MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 5068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020376	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020376	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	452196382
3	NC_020376	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	452196383
4	NC_020376	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	452196383
5	NC_020376	ATTAA	2	10	5082	5091	60 %	40 %	0 %	0 %	452196386
6	NC_020376	CCAGC	2	10	6159	6168	20 %	0 %	20 %	60 %	452196386
7	NC_020376	AAAAC	2	10	7521	7530	80 %	0 %	0 %	20 %	452196387
8	NC_020376	TCGTG	2	10	10271	10280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020376	ATGGT	2	10	11029	11038	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020376	CTGAA	2	10	12792	12801	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020376	TAGGT	2	10	14026	14035	20 %	40 %	40 %	0 %	452196388
12	NC_020376	TAAAG	2	10	15385	15394	60 %	20 %	20 %	0 %	452196389
13	NC_020376	ATGCT	2	10	15822	15831	20 %	40 %	20 %	20 %	452196389
14	NC_020376	TGGAA	2	10	19819	19828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020376	TAAAA	2	10	19975	19984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020376	TTTCC	2	10	21352	21361	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020376	ATATT	2	10	21405	21414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020376	TTTTA	2	10	21584	21593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020376	AAATT	2	10	23138	23147	60 %	40 %	0 %	0 %	452196396
20	NC_020376	ATTTT	2	10	23554	23563	20 %	80 %	0 %	0 %	452196397
21	NC_020376	AAGCG	2	10	26457	26466	40 %	0 %	40 %	20 %	452196399
22	NC_020376	TGAAG	2	10	27047	27056	40 %	20 %	40 %	0 %	452196400
23	NC_020376	TATTT	2	10	28088	28097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020376	TTGTC	2	10	28170	28179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020376	TCGTG	2	10	29790	29799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020376	TTCAA	2	10	30333	30342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020376	ATGGT	2	10	30774	30783	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020376	CTGAA	2	10	32537	32546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020376	TTGGC	2	10	36003	36012	0 %	40 %	40 %	20 %	452196406
30	NC_020376	GTATT	2	10	36126	36135	20 %	60 %	20 %	0 %	452196406
31	NC_020376	ATTGT	2	10	40067	40076	20 %	60 %	20 %	0 %	452196412
32	NC_020376	TGGAT	2	10	42145	42154	20 %	40 %	40 %	0 %	452196414
33	NC_020376	TGACA	2	10	43514	43523	40 %	20 %	20 %	20 %	452196415
34	NC_020376	TCTAT	2	10	44192	44201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020376	GAAAC	2	10	47443	47452	60 %	0 %	20 %	20 %	452196420
36	NC_020376	AAGAC	2	10	47714	47723	60 %	0 %	20 %	20 %	452196421
37	NC_020376	GATTT	2	10	59041	59050	20 %	60 %	20 %	0 %	452196431
38	NC_020376	TATTT	2	10	59600	59609	20 %	80 %	0 %	0 %	452196431
39	NC_020376	TTGGA	2	10	62281	62290	20 %	40 %	40 %	0 %	452196435
40	NC_020376	TTATG	2	10	64603	64612	20 %	60 %	20 %	0 %	452196438
41	NC_020376	GGAAA	3	15	64927	64941	60 %	0 %	40 %	0 %	452196438
42	NC_020376	TCAAT	2	10	66381	66390	40 %	40 %	0 %	20 %	452196438
43	NC_020376	AATGA	2	10	68511	68520	60 %	20 %	20 %	0 %	452196439
44	NC_020376	GATTA	2	10	68986	68995	40 %	40 %	20 %	0 %	452196440
45	NC_020376	ATAAG	2	10	71271	71280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020376	GGAAC	2	10	72380	72389	40 %	0 %	40 %	20 %	452196443
47	NC_020376	AATTA	2	10	74100	74109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020376	AAGGG	2	10	74372	74381	40 %	0 %	60 %	0 %	452196445
49	NC_020376	AAAAG	2	10	74637	74646	80 %	0 %	20 %	0 %	452196445
50	NC_020376	AGAGC	2	10	75127	75136	40 %	0 %	40 %	20 %	452196445
51	NC_020376	ATTTA	2	10	75650	75659	40 %	60 %	0 %	0 %	452196446
52	NC_020376	TGATG	2	10	76396	76405	20 %	40 %	40 %	0 %	452196447
53	NC_020376	GGTAA	2	10	77894	77903	40 %	20 %	40 %	0 %	452196448
54	NC_020376	AAAAC	2	10	78670	78679	80 %	0 %	0 %	20 %	452196450
55	NC_020376	AAATA	2	10	79316	79325	80 %	20 %	0 %	0 %	452196452
56	NC_020376	GTTAT	2	10	81542	81551	20 %	60 %	20 %	0 %	452196453
57	NC_020376	TCGTG	2	10	83069	83078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020376	ATGGT	2	10	83954	83963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020376	CTGAA	2	10	85717	85726	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020376	TCCAT	2	10	87807	87816	20 %	40 %	0 %	40 %	452196454
61	NC_020376	TCGTG	2	10	91880	91889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020376	ATGGT	2	10	92842	92851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020376	CTGAA	2	10	94606	94615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020376	TTTTA	2	10	95828	95837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020376	TCAAA	2	10	97851	97860	60 %	20 %	0 %	20 %	452196458
66	NC_020376	GAACA	2	10	98357	98366	60 %	0 %	20 %	20 %	452196459
67	NC_020376	GAACA	2	10	98579	98588	60 %	0 %	20 %	20 %	452196459
68	NC_020376	TGAAG	2	10	99519	99528	40 %	20 %	40 %	0 %	452196459
69	NC_020376	GAAAA	2	10	99542	99551	80 %	0 %	20 %	0 %	452196459
70	NC_020376	GAAAA	2	10	99665	99674	80 %	0 %	20 %	0 %	452196459
71	NC_020376	AGTGA	2	10	100777	100786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020376	CGTAT	2	10	101539	101548	20 %	40 %	20 %	20 %	452196460
73	NC_020376	TGAAA	2	10	101600	101609	60 %	20 %	20 %	0 %	452196460
74	NC_020376	GTAAT	2	10	102565	102574	40 %	40 %	20 %	0 %	452196461
75	NC_020376	TATGA	2	10	103303	103312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020376	ATATA	2	10	105278	105287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020376	CATTC	2	10	106423	106432	20 %	40 %	0 %	40 %	452196465
78	NC_020376	GAAAA	2	10	107311	107320	80 %	0 %	20 %	0 %	452196465
79	NC_020376	GAAAA	2	10	113000	113009	80 %	0 %	20 %	0 %	452196473
80	NC_020376	GAAAA	2	10	113016	113025	80 %	0 %	20 %	0 %	452196473
81	NC_020376	AAAGA	2	10	116062	116071	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020376	AGAAA	2	10	116635	116644	80 %	0 %	20 %	0 %	452196478
83	NC_020376	TAACG	2	10	122177	122186	40 %	20 %	20 %	20 %	452196480
84	NC_020376	CAATC	2	10	122711	122720	40 %	20 %	0 %	40 %	452196480
85	NC_020376	AACAT	2	10	124419	124428	60 %	20 %	0 %	20 %	452196481
86	NC_020376	ACGTG	2	10	125109	125118	20 %	20 %	40 %	20 %	452196483
87	NC_020376	TAAAA	2	10	125714	125723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020376	AATCC	2	10	125724	125733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_020376	TCGTA	2	10	126145	126154	20 %	40 %	20 %	20 %	452196484
90	NC_020376	CATGG	2	10	129471	129480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020376	TGGTA	2	10	133233	133242	20 %	40 %	40 %	0 %	452196494
92	NC_020376	GTGCG	2	10	140473	140482	0 %	20 %	60 %	20 %	452196509
93	NC_020376	GAAAT	2	10	145098	145107	60 %	20 %	20 %	0 %	452196517
94	NC_020376	GAGCA	2	10	148112	148121	40 %	0 %	40 %	20 %	452196521
95	NC_020376	AAAAG	2	10	148776	148785	80 %	0 %	20 %	0 %	452196523
96	NC_020376	GGGCT	2	10	150083	150092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020376	GATAA	2	10	150595	150604	60 %	20 %	20 %	0 %	452196525
98	NC_020376	CTTGG	2	10	151430	151439	0 %	40 %	40 %	20 %	452196526
99	NC_020376	GTTTT	2	10	152149	152158	0 %	80 %	20 %	0 %	452196527
100	NC_020376	TCGTG	2	10	155265	155274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020376	ATGGT	2	10	156023	156032	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020376	CTGAA	2	10	157787	157796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020376	ATGTG	2	10	160520	160529	20 %	40 %	40 %	0 %	452196530
104	NC_020376	CAAAA	2	10	164479	164488	80 %	0 %	0 %	20 %	452196533
105	NC_020376	ATTAC	2	10	165740	165749	40 %	40 %	0 %	20 %	452196534
106	NC_020376	AAGTA	2	10	166810	166819	60 %	20 %	20 %	0 %	452196535
107	NC_020376	ACAGC	2	10	167780	167789	40 %	0 %	20 %	40 %	452196535
108	NC_020376	CGTAG	2	10	167975	167984	20 %	20 %	40 %	20 %	452196535
109	NC_020376	ATTAT	2	10	173435	173444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020376	TGGAA	2	10	173469	173478	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020376	AGAAT	2	10	175724	175733	60 %	20 %	20 %	0 %	452196542
112	NC_020376	TTCAC	2	10	176501	176510	20 %	40 %	0 %	40 %	452196543
113	NC_020376	TGCTT	2	10	180935	180944	0 %	60 %	20 %	20 %	452196548
114	NC_020376	TCTAT	2	10	181180	181189	20 %	60 %	0 %	20 %	452196548
115	NC_020376	AAAAG	2	10	181284	181293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020376	AAAGG	2	10	182215	182224	60 %	0 %	40 %	0 %	452196549
117	NC_020376	AAAAG	2	10	185368	185377	80 %	0 %	20 %	0 %	452196552
118	NC_020376	TTTTA	2	10	186731	186740	20 %	80 %	0 %	0 %	452196554
119	NC_020376	ATCTT	2	10	188211	188220	20 %	60 %	0 %	20 %	452196555
120	NC_020376	AACGT	2	10	188226	188235	40 %	20 %	20 %	20 %	452196555
121	NC_020376	ATGGG	2	10	191298	191307	20 %	20 %	60 %	0 %	452196558
122	NC_020376	TATTT	2	10	191632	191641	20 %	80 %	0 %	0 %	452196559
123	NC_020376	AGTTT	2	10	191951	191960	20 %	60 %	20 %	0 %	452196559
124	NC_020376	TATTG	2	10	192393	192402	20 %	60 %	20 %	0 %	452196560
125	NC_020376	TAAAT	2	10	193531	193540	60 %	40 %	0 %	0 %	452196561
126	NC_020376	TTTGT	2	10	195302	195311	0 %	80 %	20 %	0 %	452196562
127	NC_020376	AAACC	2	10	197375	197384	60 %	0 %	0 %	40 %	452196563
128	NC_020376	TTGAT	2	10	197969	197978	20 %	60 %	20 %	0 %	452196564
129	NC_020376	AAAAG	2	10	198313	198322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020376	ATGGA	2	10	198334	198343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020376	AAAGG	2	10	198369	198378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020376	TTTTA	2	10	198778	198787	20 %	80 %	0 %	0 %	452196565
133	NC_020376	GTTTT	2	10	199228	199237	0 %	80 %	20 %	0 %	452196566
134	NC_020376	TTCTT	2	10	201906	201915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020376	GATAT	2	10	202824	202833	40 %	40 %	20 %	0 %	452196570
136	NC_020376	TACCT	2	10	203425	203434	20 %	40 %	0 %	40 %	452196571
137	NC_020376	TAATT	2	10	204077	204086	40 %	60 %	0 %	0 %	452196571
138	NC_020376	ATTTT	2	10	204391	204400	20 %	80 %	0 %	0 %	452196572
139	NC_020376	ATTGT	2	10	204437	204446	20 %	60 %	20 %	0 %	452196572
140	NC_020376	AGCTG	2	10	205366	205375	20 %	20 %	40 %	20 %	452196573
141	NC_020376	AATCA	2	10	206497	206506	60 %	20 %	0 %	20 %	452196574
142	NC_020376	AAAAG	2	10	207080	207089	80 %	0 %	20 %	0 %	452196575
143	NC_020376	AAAAC	2	10	207320	207329	80 %	0 %	0 %	20 %	452196575
144	NC_020376	GTTAA	2	10	209312	209321	40 %	40 %	20 %	0 %	452196577
145	NC_020376	GTAAT	2	10	209464	209473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020376	ATTAC	2	10	210165	210174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020376	TGTAA	2	10	210202	210211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020376	GAAGA	2	10	210687	210696	60 %	0 %	40 %	0 %	452196580
149	NC_020376	GTTTC	2	10	212893	212902	0 %	60 %	20 %	20 %	452196581
150	NC_020376	TTTTA	2	10	217001	217010	20 %	80 %	0 %	0 %	452196585
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152	NC_020376	TGGAT	2	10	218968	218977	20 %	40 %	40 %	0 %	452196587
153	NC_020376	TTATT	2	10	220092	220101	20 %	80 %	0 %	0 %	452196587
154	NC_020376	AATTA	2	10	220765	220774	60 %	40 %	0 %	0 %	452196588
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156	NC_020376	TATTC	2	10	223029	223038	20 %	60 %	0 %	20 %	452196590
157	NC_020376	GAAGT	2	10	223412	223421	40 %	20 %	40 %	0 %	452196591
158	NC_020376	ACGTT	2	10	225410	225419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_020376	GAAAG	2	10	228091	228100	60 %	0 %	40 %	0 %	452196596
161	NC_020376	GACGT	2	10	228278	228287	20 %	20 %	40 %	20 %	452196596
162	NC_020376	GGATG	2	10	229164	229173	20 %	20 %	60 %	0 %	452196597
163	NC_020376	TAAAA	2	10	229801	229810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020376	CATTT	2	10	232722	232731	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_020376	CTGCA	2	10	234318	234327	20 %	20 %	20 %	40 %	452196602
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171	NC_020376	TGTTT	2	10	241962	241971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020376	AAGAG	2	10	244976	244985	60 %	0 %	40 %	0 %	452196611
173	NC_020376	AATTT	2	10	245081	245090	40 %	60 %	0 %	0 %	452196612
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175	NC_020376	TCGTG	2	10	248251	248260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_020376	ATGGT	2	10	249009	249018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020376	CTGAA	2	10	250773	250782	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_020376	AAGAA	2	10	252135	252144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020376	GATAT	2	10	253464	253473	40 %	40 %	20 %	0 %	452196616
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181	NC_020376	CATTT	2	10	255723	255732	20 %	60 %	0 %	20 %	452196618
182	NC_020376	ATGAG	2	10	259154	259163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_020376	AACTT	2	10	263603	263612	40 %	40 %	0 %	20 %	452196626
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189	NC_020376	ATGGT	2	10	272304	272313	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020376	CTGAA	2	10	274067	274076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_020376	TATTT	2	10	275377	275386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020376	AAGAT	2	10	275391	275400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020376	TTATT	2	10	277185	277194	20 %	80 %	0 %	0 %	452196632
194	NC_020376	TCGTG	2	10	278778	278787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
195	NC_020376	ATGGT	2	10	279712	279721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
196	NC_020376	CTGAA	2	10	281476	281485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
197	NC_020376	GAACA	2	10	283975	283984	60 %	0 %	20 %	20 %	452196634
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199	NC_020376	ACTTT	2	10	286780	286789	20 %	60 %	0 %	20 %	452196637
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203	NC_020376	GATTA	2	10	289989	289998	40 %	40 %	20 %	0 %	452196640
204	NC_020376	GATTG	2	10	290627	290636	20 %	40 %	40 %	0 %	452196641
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210	NC_020376	TCGTG	2	10	294368	294377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
211	NC_020376	ATGGT	2	10	295318	295327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
212	NC_020376	CTGAA	2	10	297082	297091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
213	NC_020376	TCTTT	2	10	298629	298638	0 %	80 %	0 %	20 %	452196643
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217	NC_020376	ATGGT	2	10	302665	302674	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
218	NC_020376	CTGAA	2	10	304429	304438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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236	NC_020376	ATTGT	2	10	332784	332793	20 %	60 %	20 %	0 %	452196669
237	NC_020376	TTTTA	2	10	333679	333688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_020376	TGTAC	2	10	334606	334615	20 %	40 %	20 %	20 %	452196670
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241	NC_020376	AATTG	2	10	336176	336185	40 %	40 %	20 %	0 %	452196672
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249	NC_020376	TTTTA	2	10	344267	344276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_020376	ATTAT	2	10	344785	344794	40 %	60 %	0 %	0 %	452196681
251	NC_020376	ATTTA	2	10	344858	344867	40 %	60 %	0 %	0 %	452196681
252	NC_020376	AGAAA	2	10	345162	345171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020376	TAATT	2	10	347341	347350	40 %	60 %	0 %	0 %	452196683
254	NC_020376	CTTTT	2	10	352131	352140	0 %	80 %	0 %	20 %	452196688
255	NC_020376	TGGAG	2	10	353512	353521	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
256	NC_020376	GAAAT	2	10	353526	353535	60 %	20 %	20 %	0 %	452196690
257	NC_020376	TTTCA	2	10	353558	353567	20 %	60 %	0 %	20 %	452196690
258	NC_020376	AGTGA	2	10	353589	353598	40 %	20 %	40 %	0 %	452196690
259	NC_020376	ACTTA	2	10	356179	356188	40 %	40 %	0 %	20 %	452196692
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264	NC_020376	GTTTG	2	10	365049	365058	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_020376	CATGC	2	10	369809	369818	20 %	20 %	20 %	40 %	452196704
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268	NC_020376	AAAGT	2	10	372814	372823	60 %	20 %	20 %	0 %	452196706
269	NC_020376	ATTTC	2	10	376043	376052	20 %	60 %	0 %	20 %	452196710
270	NC_020376	ACATT	2	10	377779	377788	40 %	40 %	0 %	20 %	452196711
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