MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992 plasmid pCFSAN001992_2

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020308	AGAAA	2	10	531	540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020308	GTCCA	2	10	646	655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020308	GGGTG	2	10	1180	1189	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020308	CTGTT	2	10	1374	1383	0 %	60 %	20 %	20 %	452119537
5	NC_020308	TTTGA	2	10	2087	2096	20 %	60 %	20 %	0 %	452119538
6	NC_020308	ATCGC	2	10	2447	2456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020308	GTGAT	2	10	4181	4190	20 %	40 %	40 %	0 %	452119540
8	NC_020308	AGGCC	2	10	5317	5326	20 %	0 %	40 %	40 %	452119542
9	NC_020308	CCGGT	2	10	7205	7214	0 %	20 %	40 %	40 %	452119545
10	NC_020308	CCGCC	2	10	7524	7533	0 %	0 %	20 %	80 %	452119546
11	NC_020308	AAATA	2	10	11373	11382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020308	AAGCC	2	10	11677	11686	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020308	GGTGC	2	10	11774	11783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020308	CATTT	2	10	13159	13168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020308	CCGCC	2	10	14095	14104	0 %	0 %	20 %	80 %	452119551
16	NC_020308	ACCAT	2	10	14223	14232	40 %	20 %	0 %	40 %	452119551
17	NC_020308	GGGGT	2	10	14245	14254	0 %	20 %	80 %	0 %	452119551
18	NC_020308	AATAT	2	10	16157	16166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.