MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992 plasmid pCFSAN001992_2

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020308	TCA	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020308	CTT	2	6	32	37	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020308	GCA	3	9	40	48	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020308	TTC	2	6	78	83	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020308	GAG	2	6	114	119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020308	CTT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020308	CAG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020308	AGA	2	6	313	318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020308	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020308	TTC	2	6	405	410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020308	GGC	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020308	AGC	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020308	TGT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020308	GAC	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020308	ATG	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020308	CAC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_020308	ATT	2	6	1310	1315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020308	AGG	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020308	TGG	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020308	TTG	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020308	CGG	2	6	3860	3865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020308	GAT	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020308	GAT	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020308	CCA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020308	GAA	3	9	5032	5040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020308	TCT	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020308	TGA	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020308	ATT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020308	TGA	2	6	6869	6874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020308	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020308	CTG	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020308	TAT	2	6	6982	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020308	AAT	2	6	11463	11468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020308	ATC	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020308	TTA	2	6	11593	11598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020308	ATT	2	6	11634	11639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020308	GAA	2	6	11727	11732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020308	ATT	2	6	11741	11746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020308	AAT	2	6	11784	11789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020308	TAT	2	6	11808	11813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020308	ATG	2	6	12096	12101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020308	ATA	2	6	12267	12272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020308	TGA	2	6	12655	12660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020308	TGA	2	6	12822	12827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020308	ATT	2	6	12863	12868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020308	ATA	2	6	13021	13026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020308	AAT	2	6	13027	13032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020308	ATG	2	6	14996	15001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020308	GGT	2	6	15144	15149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020308	ACA	2	6	15180	15185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020308	TGT	2	6	15219	15224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020308	GCG	2	6	15241	15246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020308	TTG	2	6	15307	15312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020308	TTG	2	6	15338	15343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020308	ATT	2	6	15354	15359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020308	ACG	2	6	15378	15383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020308	TAA	2	6	15384	15389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020308	CAA	2	6	15402	15407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020308	CTT	2	6	15800	15805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020308	TCA	2	6	15865	15870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020308	ACG	2	6	15938	15943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020308	TTC	2	6	16032	16037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020308	ATA	2	6	16201	16206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020308	CTG	2	6	16231	16236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020308	TAT	2	6	16248	16253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020308	CAA	2	6	16343	16348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020308	AGC	2	6	16350	16355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020308	TTG	2	6	16366	16371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020308	ATA	2	6	16427	16432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020308	CAA	2	6	16442	16447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020308	CGC	2	6	16481	16486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020308	TGA	2	6	16590	16595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020308	GAT	2	6	16680	16685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020308	AGC	2	6	16821	16826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020308	TAT	2	6	16988	16993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020308	TCA	2	6	16996	17001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.