MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 7698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020307	CGG	2	6	73	78	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020307	ACC	2	6	94	99	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020307	CTG	2	6	100	105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020307	CTG	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020307	CGG	2	6	135	140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020307	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020307	CTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020307	AGC	2	6	360	365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020307	TCT	2	6	599	604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020307	TTC	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020307	TCA	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020307	GCT	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020307	CAT	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020307	GCT	2	6	766	771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020307	CGA	2	6	793	798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020307	AGC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020307	TGC	3	9	828	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020307	CGG	2	6	849	854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020307	TGG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020307	GCT	3	9	928	936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020307	GCT	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020307	CGC	2	6	1006	1011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020307	GCG	2	6	1039	1044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020307	CGG	2	6	1045	1050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020307	CTG	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020307	TGC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020307	CGC	3	9	1102	1110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020307	GCT	2	6	1171	1176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020307	CGG	2	6	1212	1217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020307	AGG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020307	GAC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020307	GAC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020307	TTA	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020307	ATT	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020307	AGT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020307	AAC	2	6	7089	7094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020307	TGC	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020307	TTA	2	6	7241	7246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020307	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020307	ATT	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020307	TTA	2	6	7311	7316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020307	TAG	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020307	AAC	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020307	ATA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020307	AAG	2	6	8439	8444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020307	TAT	2	6	8475	8480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020307	TGC	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020307	TAC	2	6	8838	8843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020307	GGT	2	6	11056	11061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020307	GGA	2	6	12121	12126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020307	TTC	2	6	12204	12209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020307	TAA	2	6	12521	12526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020307	TAT	2	6	14519	14524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020307	TCA	2	6	16575	16580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020307	CAT	2	6	16632	16637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020307	CGC	2	6	16686	16691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020307	ATG	2	6	16788	16793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020307	AAT	2	6	22777	22782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020307	ATA	2	6	24628	24633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020307	GTC	2	6	24666	24671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020307	TCA	2	6	24672	24677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020307	TGC	2	6	24694	24699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020307	TGA	2	6	24701	24706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020307	TGA	2	6	25341	25346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020307	AAT	2	6	25425	25430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020307	TTG	2	6	25467	25472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020307	AAT	2	6	25599	25604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020307	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020307	ATC	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020307	ACA	2	6	27452	27457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020307	AAC	2	6	27459	27464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020307	TAA	2	6	27467	27472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020307	GAG	2	6	28217	28222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020307	TGT	2	6	28227	28232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020307	ACT	2	6	28259	28264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020307	TGT	2	6	28399	28404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020307	ATG	2	6	28455	28460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020307	CCT	2	6	28872	28877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020307	CGC	2	6	28940	28945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020307	AAG	2	6	29040	29045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020307	ATT	2	6	29063	29068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020307	TGT	2	6	29148	29153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020307	GAA	2	6	29202	29207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020307	GTG	2	6	31230	31235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020307	CAG	2	6	31570	31575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020307	GAG	2	6	31578	31583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020307	CAG	2	6	33657	33662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020307	GAA	2	6	35411	35416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020307	TAA	2	6	36355	36360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020307	AGG	2	6	38404	38409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020307	GGC	2	6	38418	38423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020307	ATT	2	6	40187	40192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020307	ATT	2	6	40209	40214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020307	TAT	2	6	44701	44706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020307	GCG	2	6	44719	44724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020307	GTT	2	6	44776	44781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020307	TTC	2	6	47542	47547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020307	ATA	2	6	47548	47553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020307	ATT	2	6	47557	47562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020307	TCA	2	6	47609	47614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020307	CAA	2	6	47703	47708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020307	AAT	2	6	47751	47756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020307	GCC	2	6	49749	49754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020307	TTA	2	6	50875	50880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020307	ATG	2	6	50895	50900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020307	CGC	2	6	51104	51109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020307	GCG	2	6	51112	51117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020307	TAC	2	6	51153	51158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020307	TGG	2	6	51217	51222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020307	ATA	2	6	51306	51311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020307	TTG	2	6	52348	52353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020307	AAG	2	6	57639	57644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020307	ATA	3	9	57712	57720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020307	ATA	2	6	57742	57747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020307	CCG	2	6	58783	58788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020307	TGA	2	6	61033	61038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020307	TCA	2	6	61046	61051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020307	CAT	2	6	61084	61089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020307	CAG	2	6	61115	61120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020307	CGG	2	6	61144	61149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020307	ACA	2	6	62152	62157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020307	GCC	2	6	67202	67207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020307	CTG	2	6	68414	68419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020307	TTG	2	6	68422	68427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020307	GCG	2	6	68431	68436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020307	GCT	2	6	68454	68459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020307	GCA	2	6	68470	68475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020307	TTA	2	6	68487	68492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020307	ATT	2	6	68548	68553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020307	TGT	2	6	68586	68591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020307	TGA	2	6	68593	68598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020307	GAT	2	6	70122	70127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020307	ATC	2	6	70162	70167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020307	GGC	2	6	70957	70962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020307	ACC	2	6	71565	71570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020307	GCA	2	6	71699	71704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020307	GCA	2	6	72337	72342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020307	TTC	2	6	72354	72359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020307	ATG	2	6	72386	72391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020307	ACG	2	6	72436	72441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020307	CGC	2	6	73420	73425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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