MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 59479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020307	CGA	2	6	418	423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119556
2	NC_020307	CGG	2	6	467	472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119556
3	NC_020307	GGC	2	6	475	480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119556
4	NC_020307	CAC	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119556
5	NC_020307	CCA	2	6	517	522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119556
6	NC_020307	CCG	2	6	550	555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119556
7	NC_020307	CGG	2	6	568	573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119556
8	NC_020307	TCA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119559
9	NC_020307	GGC	2	6	1315	1320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119559
10	NC_020307	GCC	2	6	1321	1326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119559
11	NC_020307	GGC	3	9	1366	1374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119559
12	NC_020307	CAT	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119559
13	NC_020307	CGG	2	6	1425	1430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119559
14	NC_020307	CAG	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119559
15	NC_020307	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119559
16	NC_020307	GCG	2	6	1505	1510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119559
17	NC_020307	TGG	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119559
18	NC_020307	TGC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119559
19	NC_020307	GAC	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119559
20	NC_020307	GTG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119559
21	NC_020307	GTG	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119559
22	NC_020307	GCA	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119559
23	NC_020307	CGC	2	6	1890	1895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119559
24	NC_020307	CTG	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119559
25	NC_020307	CGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119559
26	NC_020307	TGC	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119560
27	NC_020307	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119560
28	NC_020307	GCG	2	6	2168	2173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119560
29	NC_020307	GCA	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119560
30	NC_020307	AGG	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119560
31	NC_020307	GGT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119561
32	NC_020307	ACC	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119561
33	NC_020307	GCA	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119561
34	NC_020307	CGG	3	9	2395	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119561
35	NC_020307	CGG	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119561
36	NC_020307	ACG	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119561
37	NC_020307	GTG	3	9	2559	2567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119561
38	NC_020307	CCG	2	6	2640	2645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119561
39	NC_020307	ACC	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119561
40	NC_020307	GCC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119561
41	NC_020307	TCA	2	6	2706	2711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119561
42	NC_020307	GCT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
43	NC_020307	GCT	3	9	2761	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
44	NC_020307	GAT	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119562
45	NC_020307	GCT	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
46	NC_020307	GCC	2	6	2966	2971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
47	NC_020307	GCT	3	9	2995	3003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
48	NC_020307	TGC	2	6	3009	3014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
49	NC_020307	TGA	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119562
50	NC_020307	CGG	2	6	3053	3058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
51	NC_020307	CGG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
52	NC_020307	TCG	2	6	3072	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
53	NC_020307	GCT	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
54	NC_020307	CGC	2	6	3231	3236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
55	NC_020307	CGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
56	NC_020307	GCT	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
57	NC_020307	GGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
58	NC_020307	CTA	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119562
59	NC_020307	GGC	2	6	3419	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
60	NC_020307	TGG	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119562
61	NC_020307	CCT	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119562
62	NC_020307	CTG	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
63	NC_020307	GCT	3	9	3538	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
64	NC_020307	CTG	2	6	3572	3577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
65	NC_020307	CGG	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
66	NC_020307	GCT	3	9	3688	3696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
67	NC_020307	AAC	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119562
68	NC_020307	GCT	3	9	3760	3768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
69	NC_020307	AAT	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119562
70	NC_020307	CTG	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
71	NC_020307	GCC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
72	NC_020307	TGG	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119562
73	NC_020307	CTG	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
74	NC_020307	CTG	2	6	3821	3826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
75	NC_020307	CTG	3	9	3920	3928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
76	NC_020307	CTG	2	6	3983	3988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
77	NC_020307	GCT	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
78	NC_020307	ATC	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119562
79	NC_020307	CGG	2	6	4065	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
80	NC_020307	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
81	NC_020307	TGG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119562
82	NC_020307	TGC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
83	NC_020307	ACA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119562
84	NC_020307	TGA	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119562
85	NC_020307	GGC	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
86	NC_020307	CGG	2	6	4450	4455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119562
87	NC_020307	CGC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
88	NC_020307	GAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119562
89	NC_020307	TAC	2	6	4523	4528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119562
90	NC_020307	CTG	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119562
91	NC_020307	CCG	3	9	4609	4617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119562
92	NC_020307	TTA	2	6	4657	4662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119563
93	NC_020307	GCT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119563
94	NC_020307	CTG	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119563
95	NC_020307	GCT	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119563
96	NC_020307	CGA	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119563
97	NC_020307	TAC	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119563
98	NC_020307	TGC	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119563
99	NC_020307	GGT	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119563
100	NC_020307	GAC	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119563
101	NC_020307	GGC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119563
102	NC_020307	ACC	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119564
103	NC_020307	AGC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119564
104	NC_020307	AGC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119564
105	NC_020307	AAC	2	6	5346	5351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119564
106	NC_020307	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119564
107	NC_020307	AGG	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119564
108	NC_020307	GCC	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
109	NC_020307	ATC	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119564
110	NC_020307	TGG	2	6	5452	5457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119564
111	NC_020307	CGC	2	6	5488	5493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
112	NC_020307	TGC	2	6	5509	5514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119564
113	NC_020307	TGC	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119564
114	NC_020307	GCC	2	6	5532	5537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
115	NC_020307	CGG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
116	NC_020307	CGG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
117	NC_020307	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
118	NC_020307	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
119	NC_020307	CAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119564
120	NC_020307	GCA	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119564
121	NC_020307	GCT	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119564
122	NC_020307	GAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119564
123	NC_020307	ATG	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119564
124	NC_020307	GCC	2	6	5950	5955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
125	NC_020307	GCG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
126	NC_020307	GGA	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119564
127	NC_020307	CCG	2	6	6029	6034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119564
128	NC_020307	CGG	2	6	6035	6040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
129	NC_020307	GCT	2	6	6044	6049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119564
130	NC_020307	AGC	3	9	6118	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119564
131	NC_020307	TGA	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119564
132	NC_020307	GGC	2	6	6143	6148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
133	NC_020307	GAT	2	6	6155	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119564
134	NC_020307	GCT	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119564
135	NC_020307	CGG	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
136	NC_020307	CGG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119564
137	NC_020307	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119564
138	NC_020307	CGC	2	6	6316	6321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119565
139	NC_020307	CCG	2	6	6548	6553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119565
140	NC_020307	CAG	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119565
141	NC_020307	AAT	3	9	6673	6681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119565
142	NC_020307	CAG	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119565
143	NC_020307	CGC	2	6	6869	6874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119565
144	NC_020307	GTC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119565
145	NC_020307	AAT	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119566
146	NC_020307	AGG	2	6	7966	7971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119566
147	NC_020307	GAT	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119566
148	NC_020307	GAT	2	6	8138	8143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119566
149	NC_020307	TTC	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119567
150	NC_020307	TCT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119568
151	NC_020307	GCA	3	9	8934	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119568
152	NC_020307	TCT	2	6	8970	8975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119568
153	NC_020307	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119568
154	NC_020307	GCG	2	6	9033	9038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119568
155	NC_020307	GCC	2	6	9065	9070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119568
156	NC_020307	GAC	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119568
157	NC_020307	TCA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119568
158	NC_020307	TCC	2	6	9281	9286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119568
159	NC_020307	ACG	2	6	9323	9328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119568
160	NC_020307	GGC	2	6	9397	9402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119568
161	NC_020307	TTC	2	6	9425	9430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119568
162	NC_020307	TCA	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119568
163	NC_020307	GAA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119568
164	NC_020307	TGG	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119568
165	NC_020307	AGC	2	6	9866	9871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119568
166	NC_020307	CAG	2	6	9985	9990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119568
167	NC_020307	GGC	3	9	10155	10163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119568
168	NC_020307	TAA	2	6	10236	10241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119568
169	NC_020307	TGA	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119568
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172	NC_020307	TCA	2	6	10887	10892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119569
173	NC_020307	ACC	2	6	11194	11199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119570
174	NC_020307	TGG	2	6	11210	11215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119570
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237	NC_020307	TGA	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119574
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240	NC_020307	TCG	2	6	16333	16338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119574
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245	NC_020307	GCC	2	6	17121	17126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119575
246	NC_020307	AAT	2	6	17178	17183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119575
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248	NC_020307	GCA	2	6	17288	17293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119576
249	NC_020307	TAC	2	6	17319	17324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119576
250	NC_020307	AGG	2	6	17383	17388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119576
251	NC_020307	AAT	2	6	17442	17447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119576
252	NC_020307	GCC	2	6	17499	17504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119576
253	NC_020307	CAT	2	6	17556	17561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119576
254	NC_020307	CTG	2	6	17574	17579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119576
255	NC_020307	TGG	2	6	17608	17613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119576
256	NC_020307	CTT	2	6	17624	17629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119576
257	NC_020307	GGC	2	6	17720	17725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119576
258	NC_020307	GGT	2	6	17802	17807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119576
259	NC_020307	ACC	2	6	17881	17886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119576
260	NC_020307	ACG	2	6	17899	17904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119576
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262	NC_020307	AGT	2	6	18016	18021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119576
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269	NC_020307	CGG	2	6	18593	18598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119576
270	NC_020307	CAG	2	6	18841	18846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119577
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274	NC_020307	GTG	2	6	18989	18994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119577
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279	NC_020307	GCC	2	6	19303	19308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119577
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281	NC_020307	CGC	2	6	19422	19427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119577
282	NC_020307	GTG	2	6	19484	19489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119577
283	NC_020307	GCC	2	6	19603	19608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119577
284	NC_020307	TAA	2	6	19878	19883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119578
285	NC_020307	CAG	2	6	19956	19961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119578
286	NC_020307	AGC	2	6	19996	20001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119578
287	NC_020307	CAG	2	6	20052	20057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119578
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291	NC_020307	AAT	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119578
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375	NC_020307	CGG	2	6	26538	26543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
376	NC_020307	GAG	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119583
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