MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 9210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020307	GC	3	6	124	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020307	GC	4	8	280	287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020307	GC	3	6	455	460	0 %	0 %	50 %	50 %	452119556
4	NC_020307	GC	3	6	750	755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020307	CG	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	452119559
6	NC_020307	GC	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	452119559
7	NC_020307	GC	3	6	2188	2193	0 %	0 %	50 %	50 %	452119560
8	NC_020307	GC	3	6	2205	2210	0 %	0 %	50 %	50 %	452119560
9	NC_020307	GC	3	6	2324	2329	0 %	0 %	50 %	50 %	452119561
10	NC_020307	GC	3	6	2795	2800	0 %	0 %	50 %	50 %	452119562
11	NC_020307	CG	3	6	2806	2811	0 %	0 %	50 %	50 %	452119562
12	NC_020307	GC	3	6	3514	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	452119562
13	NC_020307	GC	3	6	3638	3643	0 %	0 %	50 %	50 %	452119562
14	NC_020307	CG	3	6	3750	3755	0 %	0 %	50 %	50 %	452119562
15	NC_020307	GC	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	452119563
16	NC_020307	GC	3	6	5063	5068	0 %	0 %	50 %	50 %	452119563
17	NC_020307	CG	4	8	5630	5637	0 %	0 %	50 %	50 %	452119564
18	NC_020307	CG	3	6	6324	6329	0 %	0 %	50 %	50 %	452119565
19	NC_020307	GC	3	6	6489	6494	0 %	0 %	50 %	50 %	452119565
20	NC_020307	GA	3	6	7101	7106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020307	CA	3	6	7572	7577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020307	AT	3	6	7697	7702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020307	TA	7	14	7764	7777	50 %	50 %	0 %	0 %	452119566
24	NC_020307	TA	3	6	7893	7898	50 %	50 %	0 %	0 %	452119566
25	NC_020307	TA	3	6	8117	8122	50 %	50 %	0 %	0 %	452119566
26	NC_020307	AG	3	6	10030	10035	50 %	0 %	50 %	0 %	452119568
27	NC_020307	CG	3	6	10257	10262	0 %	0 %	50 %	50 %	452119568
28	NC_020307	AG	3	6	11271	11276	50 %	0 %	50 %	0 %	452119570
29	NC_020307	AG	3	6	11901	11906	50 %	0 %	50 %	0 %	452119570
30	NC_020307	CG	3	6	12226	12231	0 %	0 %	50 %	50 %	452119571
31	NC_020307	TC	3	6	12513	12518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020307	CG	3	6	12717	12722	0 %	0 %	50 %	50 %	452119572
33	NC_020307	AG	3	6	13863	13868	50 %	0 %	50 %	0 %	452119572
34	NC_020307	CT	3	6	14130	14135	0 %	50 %	0 %	50 %	452119572
35	NC_020307	GC	3	6	14179	14184	0 %	0 %	50 %	50 %	452119572
36	NC_020307	CG	3	6	14254	14259	0 %	0 %	50 %	50 %	452119572
37	NC_020307	CA	4	8	14537	14544	50 %	0 %	0 %	50 %	452119573
38	NC_020307	GC	3	6	15403	15408	0 %	0 %	50 %	50 %	452119574
39	NC_020307	GC	3	6	16162	16167	0 %	0 %	50 %	50 %	452119574
40	NC_020307	TG	3	6	16221	16226	0 %	50 %	50 %	0 %	452119574
41	NC_020307	GC	3	6	16461	16466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020307	GA	3	6	16747	16752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020307	GC	3	6	17312	17317	0 %	0 %	50 %	50 %	452119576
44	NC_020307	GC	3	6	17588	17593	0 %	0 %	50 %	50 %	452119576
45	NC_020307	GA	3	6	18934	18939	50 %	0 %	50 %	0 %	452119577
46	NC_020307	GC	3	6	19142	19147	0 %	0 %	50 %	50 %	452119577
47	NC_020307	GC	3	6	19323	19328	0 %	0 %	50 %	50 %	452119577
48	NC_020307	CG	3	6	19931	19936	0 %	0 %	50 %	50 %	452119578
49	NC_020307	AT	3	6	20303	20308	50 %	50 %	0 %	0 %	452119578
50	NC_020307	CA	3	6	20401	20406	50 %	0 %	0 %	50 %	452119578
51	NC_020307	AG	3	6	20571	20576	50 %	0 %	50 %	0 %	452119578
52	NC_020307	TA	3	6	20984	20989	50 %	50 %	0 %	0 %	452119579
53	NC_020307	GT	3	6	21800	21805	0 %	50 %	50 %	0 %	452119579
54	NC_020307	CG	3	6	22709	22714	0 %	0 %	50 %	50 %	452119579
55	NC_020307	TC	3	6	23460	23465	0 %	50 %	0 %	50 %	452119580
56	NC_020307	GT	3	6	24567	24572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020307	AT	3	6	25251	25256	50 %	50 %	0 %	0 %	452119581
58	NC_020307	CG	3	6	25857	25862	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
59	NC_020307	AG	3	6	26041	26046	50 %	0 %	50 %	0 %	452119582
60	NC_020307	GC	3	6	26057	26062	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
61	NC_020307	GC	3	6	27290	27295	0 %	0 %	50 %	50 %	452119583
62	NC_020307	CG	3	6	27649	27654	0 %	0 %	50 %	50 %	452119584
63	NC_020307	GC	3	6	28637	28642	0 %	0 %	50 %	50 %	452119585
64	NC_020307	TG	3	6	29183	29188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020307	AG	3	6	31239	31244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020307	GC	3	6	31720	31725	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
67	NC_020307	CG	3	6	31787	31792	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
68	NC_020307	GC	3	6	31992	31997	0 %	0 %	50 %	50 %	452119589
69	NC_020307	GC	3	6	33400	33405	0 %	0 %	50 %	50 %	452119590
70	NC_020307	GC	3	6	33627	33632	0 %	0 %	50 %	50 %	452119590
71	NC_020307	CG	3	6	34091	34096	0 %	0 %	50 %	50 %	452119591
72	NC_020307	AG	3	6	34332	34337	50 %	0 %	50 %	0 %	452119591
73	NC_020307	CG	3	6	35117	35122	0 %	0 %	50 %	50 %	452119591
74	NC_020307	GC	3	6	35386	35391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020307	CG	3	6	35764	35769	0 %	0 %	50 %	50 %	452119592
76	NC_020307	CG	3	6	36221	36226	0 %	0 %	50 %	50 %	452119592
77	NC_020307	TA	3	6	37472	37477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020307	CG	4	8	37734	37741	0 %	0 %	50 %	50 %	452119594
79	NC_020307	GC	3	6	38733	38738	0 %	0 %	50 %	50 %	452119595
80	NC_020307	GC	3	6	38985	38990	0 %	0 %	50 %	50 %	452119595
81	NC_020307	CG	4	8	39300	39307	0 %	0 %	50 %	50 %	452119595
82	NC_020307	GC	3	6	42947	42952	0 %	0 %	50 %	50 %	452119597
83	NC_020307	AT	3	6	43008	43013	50 %	50 %	0 %	0 %	452119597
84	NC_020307	AT	3	6	44121	44126	50 %	50 %	0 %	0 %	452119598
85	NC_020307	GC	3	6	44349	44354	0 %	0 %	50 %	50 %	452119598
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88	NC_020307	GC	3	6	45606	45611	0 %	0 %	50 %	50 %	452119599
89	NC_020307	AG	3	6	46068	46073	50 %	0 %	50 %	0 %	452119599
90	NC_020307	AG	3	6	46250	46255	50 %	0 %	50 %	0 %	452119599
91	NC_020307	CG	3	6	46370	46375	0 %	0 %	50 %	50 %	452119600
92	NC_020307	TC	3	6	46442	46447	0 %	50 %	0 %	50 %	452119600
93	NC_020307	CG	3	6	46782	46787	0 %	0 %	50 %	50 %	452119601
94	NC_020307	TG	3	6	47178	47183	0 %	50 %	50 %	0 %	452119601
95	NC_020307	GC	3	6	47305	47310	0 %	0 %	50 %	50 %	452119601
96	NC_020307	GC	3	6	48382	48387	0 %	0 %	50 %	50 %	452119602
97	NC_020307	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
98	NC_020307	CG	3	6	49318	49323	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
99	NC_020307	GC	3	6	49330	49335	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
100	NC_020307	GC	3	6	49631	49636	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
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102	NC_020307	GC	3	6	50556	50561	0 %	0 %	50 %	50 %	452119604
103	NC_020307	GC	3	6	51177	51182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020307	GC	3	6	51378	51383	0 %	0 %	50 %	50 %	452119605
105	NC_020307	GC	3	6	51632	51637	0 %	0 %	50 %	50 %	452119605
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107	NC_020307	GA	3	6	56140	56145	50 %	0 %	50 %	0 %	452119608
108	NC_020307	CG	3	6	56501	56506	0 %	0 %	50 %	50 %	452119609
109	NC_020307	GC	3	6	56819	56824	0 %	0 %	50 %	50 %	452119609
110	NC_020307	GC	3	6	58148	58153	0 %	0 %	50 %	50 %	452119611
111	NC_020307	GC	3	6	58258	58263	0 %	0 %	50 %	50 %	452119611
112	NC_020307	CG	3	6	58997	59002	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
113	NC_020307	GC	3	6	59047	59052	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
114	NC_020307	CG	3	6	59318	59323	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
115	NC_020307	GC	3	6	59543	59548	0 %	0 %	50 %	50 %	452119612
116	NC_020307	GC	3	6	60050	60055	0 %	0 %	50 %	50 %	452119613
117	NC_020307	CG	4	8	60366	60373	0 %	0 %	50 %	50 %	452119613
118	NC_020307	AT	3	6	60612	60617	50 %	50 %	0 %	0 %	452119613
119	NC_020307	GC	4	8	60747	60754	0 %	0 %	50 %	50 %	452119614
120	NC_020307	TA	3	6	60985	60990	50 %	50 %	0 %	0 %	452119614
121	NC_020307	CG	3	6	61501	61506	0 %	0 %	50 %	50 %	452119615
122	NC_020307	GC	3	6	62403	62408	0 %	0 %	50 %	50 %	452119616
123	NC_020307	GC	3	6	62682	62687	0 %	0 %	50 %	50 %	452119616
124	NC_020307	GC	3	6	63099	63104	0 %	0 %	50 %	50 %	452119616
125	NC_020307	GT	3	6	63114	63119	0 %	50 %	50 %	0 %	452119616
126	NC_020307	GC	3	6	63683	63688	0 %	0 %	50 %	50 %	452119617
127	NC_020307	GA	4	8	64599	64606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020307	TC	3	6	65025	65030	0 %	50 %	0 %	50 %	452119618
129	NC_020307	GC	3	6	65583	65588	0 %	0 %	50 %	50 %	452119619
130	NC_020307	GC	3	6	66047	66052	0 %	0 %	50 %	50 %	452119620
131	NC_020307	CG	3	6	66507	66512	0 %	0 %	50 %	50 %	452119620
132	NC_020307	CT	3	6	66722	66727	0 %	50 %	0 %	50 %	452119620
133	NC_020307	AT	3	6	66877	66882	50 %	50 %	0 %	0 %	452119620
134	NC_020307	AG	3	6	67234	67239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020307	GC	3	6	67902	67907	0 %	0 %	50 %	50 %	452119621
136	NC_020307	CG	3	6	68089	68094	0 %	0 %	50 %	50 %	452119621
137	NC_020307	AT	3	6	68128	68133	50 %	50 %	0 %	0 %	452119621
138	NC_020307	CT	3	6	68643	68648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020307	CG	3	6	69168	69173	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
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143	NC_020307	GC	3	6	69958	69963	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
144	NC_020307	GC	3	6	70085	70090	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
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