MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 1347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020307	GC	3	6	124	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020307	GC	4	8	280	287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020307	GC	3	6	750	755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020307	GA	3	6	7101	7106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020307	CA	3	6	7572	7577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020307	AT	3	6	7697	7702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020307	TC	3	6	12513	12518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020307	GC	3	6	16461	16466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020307	GA	3	6	16747	16752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020307	GT	3	6	24567	24572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020307	TG	3	6	29183	29188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020307	AG	3	6	31239	31244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020307	GC	3	6	35386	35391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020307	TA	3	6	37472	37477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020307	GC	3	6	51177	51182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020307	GA	4	8	64599	64606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020307	AG	3	6	67234	67239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020307	CT	3	6	68643	68648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020307	CG	3	6	72440	72445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020307	GA	3	6	75460	75465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020307	TA	3	6	86946	86951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020307	AT	4	8	90524	90531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020307	GT	3	6	96541	96546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020307	AG	3	6	104919	104924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020307	TA	3	6	105190	105195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020307	TA	3	6	105731	105736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020307	TA	3	6	110463	110468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020307	CA	3	6	110725	110730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020307	TA	3	6	110754	110759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020307	AT	3	6	111004	111009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020307	TA	3	6	111482	111487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020307	TA	3	6	111763	111768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020307	TA	3	6	113115	113120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020307	AT	3	6	113625	113630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020307	GC	3	6	116146	116151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020307	CG	3	6	116394	116399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020307	GC	3	6	118885	118890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020307	GT	3	6	120802	120807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020307	AT	3	6	142971	142976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020307	CG	3	6	159909	159914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020307	CG	3	6	160206	160211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020307	GT	3	6	167475	167480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020307	TA	3	6	179635	179640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020307	TA	3	6	188130	188135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020307	AT	3	6	189466	189471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020307	CG	3	6	197779	197784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020307	CA	3	6	197868	197873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020307	CG	3	6	201529	201534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020307	AT	3	6	205070	205075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020307	AG	3	6	205983	205988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020307	AG	3	6	251971	251976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020307	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020307	TA	4	8	252080	252087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020307	TA	3	6	253598	253603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020307	TA	3	6	255149	255154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020307	TA	3	6	258426	258431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020307	TA	3	6	258522	258527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020307	TA	3	6	258546	258551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020307	CT	3	6	258634	258639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020307	CG	3	6	259209	259214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020307	GA	3	6	260345	260350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020307	CT	3	6	265541	265546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020307	GC	4	8	266768	266775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020307	CG	3	6	266966	266971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020307	CA	3	6	267454	267459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020307	AC	3	6	270475	270480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020307	GA	3	6	272297	272302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020307	CT	3	6	272374	272379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020307	CA	3	6	272797	272802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020307	GA	4	8	272846	272853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020307	GC	3	6	272908	272913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020307	TA	3	6	272934	272939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020307	CT	3	6	275048	275053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020307	AT	4	8	277139	277146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020307	AG	3	6	277988	277993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020307	AT	3	6	287317	287322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020307	GC	3	6	298640	298645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020307	TA	3	6	299174	299179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020307	AC	3	6	310766	310771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020307	CT	3	6	313306	313311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020307	TA	4	8	313371	313378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020307	TA	3	6	319056	319061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020307	AG	3	6	320765	320770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020307	CA	3	6	320869	320874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020307	TC	3	6	321277	321282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020307	TG	3	6	321288	321293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020307	TG	3	6	325195	325200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020307	TG	3	6	325209	325214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020307	AC	3	6	331143	331148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020307	AG	3	6	331355	331360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020307	TG	3	6	339097	339102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020307	GC	3	6	339207	339212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020307	CT	3	6	346061	346066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020307	TC	3	6	349402	349407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020307	GC	4	8	351348	351355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020307	GC	3	6	359297	359302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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98	NC_020307	AT	5	10	361865	361874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_020307	AG	3	6	369346	369351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020307	TG	3	6	371999	372004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020307	AC	3	6	375706	375711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020307	GA	3	6	375724	375729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020307	GC	3	6	377681	377686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020307	TA	3	6	377689	377694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020307	TA	3	6	377757	377762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020307	AT	3	6	379430	379435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020307	CG	3	6	381519	381524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020307	TA	3	6	383030	383035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020307	CT	3	6	385212	385217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020307	TG	3	6	388866	388871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020307	CT	3	6	389047	389052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020307	GC	3	6	389128	389133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020307	AT	3	6	391648	391653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020307	AT	3	6	393565	393570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020307	AT	3	6	394512	394517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020307	AC	3	6	395160	395165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020307	AC	3	6	397187	397192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020307	CT	3	6	398474	398479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020307	TA	3	6	398606	398611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020307	AT	3	6	399988	399993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020307	AC	3	6	400010	400015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020307	TA	3	6	400184	400189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020307	TA	3	6	401761	401766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020307	TG	3	6	401946	401951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020307	TA	3	6	402983	402988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020307	GC	3	6	406387	406392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020307	TA	3	6	410447	410452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020307	TC	3	6	418429	418434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020307	TC	4	8	418578	418585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020307	AT	3	6	418867	418872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020307	TG	3	6	426550	426555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020307	GC	3	6	431723	431728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020307	TA	3	6	431740	431745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020307	GC	3	6	436445	436450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020307	GA	3	6	439735	439740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020307	GT	3	6	445890	445895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020307	AG	3	6	448165	448170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020307	CT	3	6	450657	450662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020307	AT	3	6	456189	456194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020307	GC	4	8	460008	460015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020307	TA	3	6	461528	461533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020307	AT	3	6	461541	461546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020307	AG	3	6	464569	464574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020307	CG	3	6	470215	470220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020307	GT	3	6	470317	470322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020307	TA	3	6	470540	470545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020307	GT	3	6	473954	473959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020307	AT	3	6	477392	477397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020307	CT	4	8	479148	479155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020307	AC	3	6	480489	480494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020307	AG	3	6	490795	490800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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