MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020305	ACCAG	2	10	486	495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020305	CAATT	2	10	3156	3165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020305	ATCAT	2	10	5208	5217	40 %	40 %	0 %	20 %	451945617
4	NC_020305	TTCTT	2	10	9004	9013	0 %	80 %	0 %	20 %	451945621
5	NC_020305	TAACC	2	10	9524	9533	40 %	20 %	0 %	40 %	451945621
6	NC_020305	ACAAA	2	10	10315	10324	80 %	0 %	0 %	20 %	451945621
7	NC_020305	TAAGG	2	10	10713	10722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020305	AAGGC	2	10	11712	11721	40 %	0 %	40 %	20 %	451945623
9	NC_020305	AGTGG	2	10	11922	11931	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020305	GTTCT	2	10	13406	13415	0 %	60 %	20 %	20 %	451945624
11	NC_020305	ATAGT	2	10	14613	14622	40 %	40 %	20 %	0 %	451945624
12	NC_020305	CCCTT	2	10	14630	14639	0 %	40 %	0 %	60 %	451945624
13	NC_020305	GGGTC	2	10	15924	15933	0 %	20 %	60 %	20 %	451945625
14	NC_020305	AACAG	2	10	18418	18427	60 %	0 %	20 %	20 %	451945629
15	NC_020305	GGTGG	2	10	18952	18961	0 %	20 %	80 %	0 %	451945630
16	NC_020305	CTTCA	2	10	19124	19133	20 %	40 %	0 %	40 %	451945630
17	NC_020305	GCAAT	2	10	19551	19560	40 %	20 %	20 %	20 %	451945630
18	NC_020305	CTGCT	2	10	20342	20351	0 %	40 %	20 %	40 %	451945630
19	NC_020305	TTTTA	2	10	21544	21553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020305	TATCT	2	10	22375	22384	20 %	60 %	0 %	20 %	451945631
21	NC_020305	ATCTG	2	10	22910	22919	20 %	40 %	20 %	20 %	451945631
22	NC_020305	AAGGT	2	10	27062	27071	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020305	CCCGG	2	10	29070	29079	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_020305	CCGGG	2	10	29103	29112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020305	TTGCA	2	10	29257	29266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020305	ACAGC	2	10	31158	31167	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020305	GCGGG	2	10	31539	31548	0 %	0 %	80 %	20 %	451945643
28	NC_020305	AGAAA	2	10	32047	32056	80 %	0 %	20 %	0 %	451945643
29	NC_020305	GTAAT	2	10	33044	33053	40 %	40 %	20 %	0 %	451945646
30	NC_020305	AGTAA	2	10	33718	33727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020305	CCCGG	2	10	35165	35174	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_020305	CCGGG	2	10	35199	35208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020305	GAGTT	2	10	36505	36514	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.