MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020305	TAAA	2	8	1283	1290	75 %	25 %	0 %	0 %	451945613
2	NC_020305	TCTT	2	8	1598	1605	0 %	75 %	0 %	25 %	451945613
3	NC_020305	ATTA	2	8	1836	1843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020305	TGCC	2	8	2076	2083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020305	TGGT	2	8	2453	2460	0 %	50 %	50 %	0 %	451945614
6	NC_020305	AATA	2	8	2482	2489	75 %	25 %	0 %	0 %	451945614
7	NC_020305	AAAG	2	8	2599	2606	75 %	0 %	25 %	0 %	451945614
8	NC_020305	CCCT	2	8	2643	2650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_020305	ACCC	2	8	2763	2770	25 %	0 %	0 %	75 %	451945615
10	NC_020305	CAAC	2	8	3064	3071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020305	GAAT	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020305	CGGG	2	8	3434	3441	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020305	ACCT	2	8	3662	3669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020305	CTAT	2	8	4009	4016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020305	TTAT	2	8	4117	4124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020305	TGTA	2	8	4294	4301	25 %	50 %	25 %	0 %	451945616
17	NC_020305	AATT	2	8	4541	4548	50 %	50 %	0 %	0 %	451945616
18	NC_020305	AAAT	2	8	4581	4588	75 %	25 %	0 %	0 %	451945616
19	NC_020305	TAAT	2	8	4811	4818	50 %	50 %	0 %	0 %	451945616
20	NC_020305	TTTC	2	8	5777	5784	0 %	75 %	0 %	25 %	451945617
21	NC_020305	TCGC	2	8	6174	6181	0 %	25 %	25 %	50 %	451945618
22	NC_020305	AGCC	2	8	6502	6509	25 %	0 %	25 %	50 %	451945618
23	NC_020305	CAAA	2	8	6591	6598	75 %	0 %	0 %	25 %	451945618
24	NC_020305	ACTG	2	8	7646	7653	25 %	25 %	25 %	25 %	451945619
25	NC_020305	TTCT	2	8	7996	8003	0 %	75 %	0 %	25 %	451945620
26	NC_020305	GCTG	2	8	8291	8298	0 %	25 %	50 %	25 %	451945620
27	NC_020305	CAAA	2	8	8358	8365	75 %	0 %	0 %	25 %	451945620
28	NC_020305	CAAC	2	8	8523	8530	50 %	0 %	0 %	50 %	451945620
29	NC_020305	AATC	2	8	9257	9264	50 %	25 %	0 %	25 %	451945621
30	NC_020305	TATC	2	8	9501	9508	25 %	50 %	0 %	25 %	451945621
31	NC_020305	TTCC	2	8	10106	10113	0 %	50 %	0 %	50 %	451945621
32	NC_020305	CCTA	2	8	10124	10131	25 %	25 %	0 %	50 %	451945621
33	NC_020305	TCAA	2	8	10137	10144	50 %	25 %	0 %	25 %	451945621
34	NC_020305	TTTA	2	8	10438	10445	25 %	75 %	0 %	0 %	451945621
35	NC_020305	ATAA	2	8	10564	10571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020305	TCAA	2	8	11284	11291	50 %	25 %	0 %	25 %	451945622
37	NC_020305	TCAT	2	8	11580	11587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020305	ATGA	2	8	11834	11841	50 %	25 %	25 %	0 %	451945623
39	NC_020305	TCGT	2	8	12109	12116	0 %	50 %	25 %	25 %	451945624
40	NC_020305	TAAG	2	8	12504	12511	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
41	NC_020305	ATCT	2	8	12581	12588	25 %	50 %	0 %	25 %	451945624
42	NC_020305	ATTG	2	8	12722	12729	25 %	50 %	25 %	0 %	451945624
43	NC_020305	ATTA	2	8	13782	13789	50 %	50 %	0 %	0 %	451945624
44	NC_020305	CCAA	2	8	13799	13806	50 %	0 %	0 %	50 %	451945624
45	NC_020305	AATG	2	8	13911	13918	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
46	NC_020305	ATTT	2	8	14493	14500	25 %	75 %	0 %	0 %	451945624
47	NC_020305	AGTA	2	8	14718	14725	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
48	NC_020305	CATA	2	8	14870	14877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020305	AATT	2	8	14976	14983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020305	TGGC	2	8	15675	15682	0 %	25 %	50 %	25 %	451945625
51	NC_020305	GTCA	2	8	16297	16304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020305	TAGT	2	8	16398	16405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020305	AAGA	2	8	16434	16441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020305	TAGT	2	8	16683	16690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020305	CTGT	2	8	16816	16823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020305	ACAA	2	8	17593	17600	75 %	0 %	0 %	25 %	451945627
57	NC_020305	GAAT	2	8	18531	18538	50 %	25 %	25 %	0 %	451945630
58	NC_020305	TGGA	2	8	19385	19392	25 %	25 %	50 %	0 %	451945630
59	NC_020305	CAGC	2	8	19681	19688	25 %	0 %	25 %	50 %	451945630
60	NC_020305	AATC	2	8	19749	19756	50 %	25 %	0 %	25 %	451945630
61	NC_020305	GGTG	2	8	20081	20088	0 %	25 %	75 %	0 %	451945630
62	NC_020305	GCCA	2	8	20519	20526	25 %	0 %	25 %	50 %	451945630
63	NC_020305	TGAT	2	8	20541	20548	25 %	50 %	25 %	0 %	451945630
64	NC_020305	TAGA	2	8	20967	20974	50 %	25 %	25 %	0 %	451945630
65	NC_020305	GAAC	2	8	21133	21140	50 %	0 %	25 %	25 %	451945630
66	NC_020305	ACCC	2	8	21194	21201	25 %	0 %	0 %	75 %	451945630
67	NC_020305	ATCA	2	8	21214	21221	50 %	25 %	0 %	25 %	451945630
68	NC_020305	AGGA	2	8	21513	21520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020305	GCTG	2	8	23159	23166	0 %	25 %	50 %	25 %	451945632
70	NC_020305	ATGG	2	8	23883	23890	25 %	25 %	50 %	0 %	451945633
71	NC_020305	TTTC	2	8	24554	24561	0 %	75 %	0 %	25 %	451945634
72	NC_020305	TGGG	2	8	24640	24647	0 %	25 %	75 %	0 %	451945634
73	NC_020305	AGGA	2	8	24997	25004	50 %	0 %	50 %	0 %	451945634
74	NC_020305	ATGG	2	8	25188	25195	25 %	25 %	50 %	0 %	451945634
75	NC_020305	TTGG	2	8	25535	25542	0 %	50 %	50 %	0 %	451945635
76	NC_020305	AGCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	50 %	25 %	451945635
77	NC_020305	TTAA	2	8	25671	25678	50 %	50 %	0 %	0 %	451945635
78	NC_020305	TAGA	2	8	26119	26126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020305	CAAA	2	8	27420	27427	75 %	0 %	0 %	25 %	451945639
80	NC_020305	AAGG	2	8	28281	28288	50 %	0 %	50 %	0 %	451945639
81	NC_020305	CTAC	2	8	28342	28349	25 %	25 %	0 %	50 %	451945639
82	NC_020305	CAGC	2	8	28518	28525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020305	CAGG	2	8	29271	29278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020305	TTTC	2	8	29557	29564	0 %	75 %	0 %	25 %	451945640
85	NC_020305	TAAA	2	8	29838	29845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020305	AAAG	2	8	30213	30220	75 %	0 %	25 %	0 %	451945641
87	NC_020305	CTTC	2	8	30479	30486	0 %	50 %	0 %	50 %	451945642
88	NC_020305	GGAA	2	8	31020	31027	50 %	0 %	50 %	0 %	451945642
89	NC_020305	GAAA	2	8	31100	31107	75 %	0 %	25 %	0 %	451945642
90	NC_020305	ATAA	2	8	31120	31127	75 %	25 %	0 %	0 %	451945642
91	NC_020305	GCAA	2	8	31525	31532	50 %	0 %	25 %	25 %	451945643
92	NC_020305	GGGC	2	8	32085	32092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020305	CGGT	2	8	32237	32244	0 %	25 %	50 %	25 %	451945644
94	NC_020305	GCAG	2	8	32279	32286	25 %	0 %	50 %	25 %	451945644
95	NC_020305	ATTC	2	8	32818	32825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020305	AGTA	2	8	32982	32989	50 %	25 %	25 %	0 %	451945646
97	NC_020305	AGAA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	25 %	0 %	451945646
98	NC_020305	AAAG	2	8	33175	33182	75 %	0 %	25 %	0 %	451945646
99	NC_020305	AGGA	2	8	34146	34153	50 %	0 %	50 %	0 %	451945647
100	NC_020305	GCTG	2	8	34506	34513	0 %	25 %	50 %	25 %	451945648
101	NC_020305	AATA	2	8	34818	34825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020305	TTGA	2	8	35046	35053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020305	GATC	2	8	35071	35078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020305	AGAA	2	8	35761	35768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020305	AGAA	2	8	36637	36644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.