MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020305	TAAA	2	8	1283	1290	75 %	25 %	0 %	0 %	451945613
2	NC_020305	TCTT	2	8	1598	1605	0 %	75 %	0 %	25 %	451945613
3	NC_020305	TGGT	2	8	2453	2460	0 %	50 %	50 %	0 %	451945614
4	NC_020305	AATA	2	8	2482	2489	75 %	25 %	0 %	0 %	451945614
5	NC_020305	AAAG	2	8	2599	2606	75 %	0 %	25 %	0 %	451945614
6	NC_020305	ACCC	2	8	2763	2770	25 %	0 %	0 %	75 %	451945615
7	NC_020305	TGTA	2	8	4294	4301	25 %	50 %	25 %	0 %	451945616
8	NC_020305	AATT	2	8	4541	4548	50 %	50 %	0 %	0 %	451945616
9	NC_020305	AAAT	2	8	4581	4588	75 %	25 %	0 %	0 %	451945616
10	NC_020305	TAAT	2	8	4811	4818	50 %	50 %	0 %	0 %	451945616
11	NC_020305	TTTC	2	8	5777	5784	0 %	75 %	0 %	25 %	451945617
12	NC_020305	TCGC	2	8	6174	6181	0 %	25 %	25 %	50 %	451945618
13	NC_020305	AGCC	2	8	6502	6509	25 %	0 %	25 %	50 %	451945618
14	NC_020305	CAAA	2	8	6591	6598	75 %	0 %	0 %	25 %	451945618
15	NC_020305	ACTG	2	8	7646	7653	25 %	25 %	25 %	25 %	451945619
16	NC_020305	TTCT	2	8	7996	8003	0 %	75 %	0 %	25 %	451945620
17	NC_020305	GCTG	2	8	8291	8298	0 %	25 %	50 %	25 %	451945620
18	NC_020305	CAAA	2	8	8358	8365	75 %	0 %	0 %	25 %	451945620
19	NC_020305	CAAC	2	8	8523	8530	50 %	0 %	0 %	50 %	451945620
20	NC_020305	AATC	2	8	9257	9264	50 %	25 %	0 %	25 %	451945621
21	NC_020305	TATC	2	8	9501	9508	25 %	50 %	0 %	25 %	451945621
22	NC_020305	TTCC	2	8	10106	10113	0 %	50 %	0 %	50 %	451945621
23	NC_020305	CCTA	2	8	10124	10131	25 %	25 %	0 %	50 %	451945621
24	NC_020305	TCAA	2	8	10137	10144	50 %	25 %	0 %	25 %	451945621
25	NC_020305	TTTA	2	8	10438	10445	25 %	75 %	0 %	0 %	451945621
26	NC_020305	TCAA	2	8	11284	11291	50 %	25 %	0 %	25 %	451945622
27	NC_020305	ATGA	2	8	11834	11841	50 %	25 %	25 %	0 %	451945623
28	NC_020305	TCGT	2	8	12109	12116	0 %	50 %	25 %	25 %	451945624
29	NC_020305	TAAG	2	8	12504	12511	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
30	NC_020305	ATCT	2	8	12581	12588	25 %	50 %	0 %	25 %	451945624
31	NC_020305	ATTG	2	8	12722	12729	25 %	50 %	25 %	0 %	451945624
32	NC_020305	ATTA	2	8	13782	13789	50 %	50 %	0 %	0 %	451945624
33	NC_020305	CCAA	2	8	13799	13806	50 %	0 %	0 %	50 %	451945624
34	NC_020305	AATG	2	8	13911	13918	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
35	NC_020305	ATTT	2	8	14493	14500	25 %	75 %	0 %	0 %	451945624
36	NC_020305	AGTA	2	8	14718	14725	50 %	25 %	25 %	0 %	451945624
37	NC_020305	TGGC	2	8	15675	15682	0 %	25 %	50 %	25 %	451945625
38	NC_020305	ACAA	2	8	17593	17600	75 %	0 %	0 %	25 %	451945627
39	NC_020305	GAAT	2	8	18531	18538	50 %	25 %	25 %	0 %	451945630
40	NC_020305	TGGA	2	8	19385	19392	25 %	25 %	50 %	0 %	451945630
41	NC_020305	CAGC	2	8	19681	19688	25 %	0 %	25 %	50 %	451945630
42	NC_020305	AATC	2	8	19749	19756	50 %	25 %	0 %	25 %	451945630
43	NC_020305	GGTG	2	8	20081	20088	0 %	25 %	75 %	0 %	451945630
44	NC_020305	GCCA	2	8	20519	20526	25 %	0 %	25 %	50 %	451945630
45	NC_020305	TGAT	2	8	20541	20548	25 %	50 %	25 %	0 %	451945630
46	NC_020305	TAGA	2	8	20967	20974	50 %	25 %	25 %	0 %	451945630
47	NC_020305	GAAC	2	8	21133	21140	50 %	0 %	25 %	25 %	451945630
48	NC_020305	ACCC	2	8	21194	21201	25 %	0 %	0 %	75 %	451945630
49	NC_020305	ATCA	2	8	21214	21221	50 %	25 %	0 %	25 %	451945630
50	NC_020305	GCTG	2	8	23159	23166	0 %	25 %	50 %	25 %	451945632
51	NC_020305	ATGG	2	8	23883	23890	25 %	25 %	50 %	0 %	451945633
52	NC_020305	TTTC	2	8	24554	24561	0 %	75 %	0 %	25 %	451945634
53	NC_020305	TGGG	2	8	24640	24647	0 %	25 %	75 %	0 %	451945634
54	NC_020305	AGGA	2	8	24997	25004	50 %	0 %	50 %	0 %	451945634
55	NC_020305	ATGG	2	8	25188	25195	25 %	25 %	50 %	0 %	451945634
56	NC_020305	TTGG	2	8	25535	25542	0 %	50 %	50 %	0 %	451945635
57	NC_020305	AGCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	50 %	25 %	451945635
58	NC_020305	TTAA	2	8	25671	25678	50 %	50 %	0 %	0 %	451945635
59	NC_020305	CAAA	2	8	27420	27427	75 %	0 %	0 %	25 %	451945639
60	NC_020305	AAGG	2	8	28281	28288	50 %	0 %	50 %	0 %	451945639
61	NC_020305	CTAC	2	8	28342	28349	25 %	25 %	0 %	50 %	451945639
62	NC_020305	TTTC	2	8	29557	29564	0 %	75 %	0 %	25 %	451945640
63	NC_020305	AAAG	2	8	30213	30220	75 %	0 %	25 %	0 %	451945641
64	NC_020305	CTTC	2	8	30479	30486	0 %	50 %	0 %	50 %	451945642
65	NC_020305	GGAA	2	8	31020	31027	50 %	0 %	50 %	0 %	451945642
66	NC_020305	GAAA	2	8	31100	31107	75 %	0 %	25 %	0 %	451945642
67	NC_020305	ATAA	2	8	31120	31127	75 %	25 %	0 %	0 %	451945642
68	NC_020305	GCAA	2	8	31525	31532	50 %	0 %	25 %	25 %	451945643
69	NC_020305	CGGT	2	8	32237	32244	0 %	25 %	50 %	25 %	451945644
70	NC_020305	GCAG	2	8	32279	32286	25 %	0 %	50 %	25 %	451945644
71	NC_020305	AGTA	2	8	32982	32989	50 %	25 %	25 %	0 %	451945646
72	NC_020305	AGAA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	25 %	0 %	451945646
73	NC_020305	AAAG	2	8	33175	33182	75 %	0 %	25 %	0 %	451945646
74	NC_020305	AGGA	2	8	34146	34153	50 %	0 %	50 %	0 %	451945647
75	NC_020305	GCTG	2	8	34506	34513	0 %	25 %	50 %	25 %	451945648

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.