MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020305	TGA	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945612
2	NC_020305	TTC	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945612
3	NC_020305	ACA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945613
4	NC_020305	TTC	2	6	1211	1216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945613
5	NC_020305	TAG	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945613
6	NC_020305	ACC	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945613
7	NC_020305	TTC	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945613
8	NC_020305	GGT	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945614
9	NC_020305	AAG	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945614
10	NC_020305	AAG	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945614
11	NC_020305	TTA	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945614
12	NC_020305	ATT	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945614
13	NC_020305	CTG	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945615
14	NC_020305	ATA	2	6	2970	2975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945615
15	NC_020305	GCT	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945616
16	NC_020305	CGA	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945616
17	NC_020305	CAC	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945616
18	NC_020305	ATA	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945616
19	NC_020305	TCA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945616
20	NC_020305	ACC	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945616
21	NC_020305	CAT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945616
22	NC_020305	ACT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945616
23	NC_020305	TAA	2	6	5250	5255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945617
24	NC_020305	ATA	2	6	5339	5344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945617
25	NC_020305	ATA	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945617
26	NC_020305	TAT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945617
27	NC_020305	ATT	2	6	5514	5519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945617
28	NC_020305	GAA	2	6	5615	5620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945617
29	NC_020305	GGA	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945617
30	NC_020305	TTA	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945617
31	NC_020305	TAG	2	6	5679	5684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945617
32	NC_020305	ATG	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945617
33	NC_020305	GAT	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945617
34	NC_020305	CAG	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945617
35	NC_020305	AGA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945617
36	NC_020305	CAG	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945617
37	NC_020305	GTT	2	6	5982	5987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945618
38	NC_020305	AAC	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945618
39	NC_020305	GTA	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
40	NC_020305	GAG	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945618
41	NC_020305	GTT	2	6	6132	6137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945618
42	NC_020305	TGA	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
43	NC_020305	GTA	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
44	NC_020305	GTG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945618
45	NC_020305	TGA	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
46	NC_020305	TTA	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945618
47	NC_020305	GCA	2	6	6483	6488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945618
48	NC_020305	GAT	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
49	NC_020305	GTA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945618
50	NC_020305	ATA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945619
51	NC_020305	ATG	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945619
52	NC_020305	TTA	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945619
53	NC_020305	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945619
54	NC_020305	CAG	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945619
55	NC_020305	CCA	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945619
56	NC_020305	TCA	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945619
57	NC_020305	CTT	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945619
58	NC_020305	ACC	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945619
59	NC_020305	AAC	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945619
60	NC_020305	GTA	2	6	7338	7343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945619
61	NC_020305	TAT	2	6	7450	7455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945619
62	NC_020305	AGA	2	6	7469	7474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945619
63	NC_020305	GGT	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945619
64	NC_020305	TGG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945619
65	NC_020305	TCG	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945619
66	NC_020305	ATT	2	6	7683	7688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945619
67	NC_020305	TGG	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945619
68	NC_020305	AAT	2	6	7775	7780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945619
69	NC_020305	TAA	2	6	7798	7803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945619
70	NC_020305	CAA	2	6	7815	7820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945620
71	NC_020305	TGA	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945620
72	NC_020305	AGC	2	6	8062	8067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945620
73	NC_020305	TTC	2	6	8073	8078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945620
74	NC_020305	GTT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945620
75	NC_020305	GGT	2	6	8099	8104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945620
76	NC_020305	ACT	2	6	8132	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945620
77	NC_020305	CAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945620
78	NC_020305	TGC	2	6	8392	8397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945620
79	NC_020305	CAC	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945620
80	NC_020305	AAC	2	6	8609	8614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945620
81	NC_020305	CTA	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945620
82	NC_020305	ATA	2	6	8793	8798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945620
83	NC_020305	TCC	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945620
84	NC_020305	CCA	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945621
85	NC_020305	ATT	2	6	9084	9089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945621
86	NC_020305	TCT	3	9	9292	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945621
87	NC_020305	CTT	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945621
88	NC_020305	CTC	2	6	9321	9326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945621
89	NC_020305	ACG	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945621
90	NC_020305	AAG	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945621
91	NC_020305	CTA	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945621
92	NC_020305	GAA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945621
93	NC_020305	AAG	2	6	9797	9802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945621
94	NC_020305	TAA	2	6	9812	9817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945621
95	NC_020305	CGA	2	6	9869	9874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945621
96	NC_020305	ACA	2	6	9948	9953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945621
97	NC_020305	ATT	2	6	10016	10021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945621
98	NC_020305	GAA	2	6	10341	10346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945621
99	NC_020305	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945621
100	NC_020305	CCA	2	6	10489	10494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945621
101	NC_020305	GGC	2	6	10902	10907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945622
102	NC_020305	TGA	2	6	11057	11062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945622
103	NC_020305	CTG	2	6	11161	11166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945622
104	NC_020305	ATC	2	6	11175	11180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945622
105	NC_020305	CCA	2	6	11182	11187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945622
106	NC_020305	CTC	2	6	11210	11215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945622
107	NC_020305	TCC	2	6	11278	11283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945622
108	NC_020305	AGC	2	6	11447	11452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945622
109	NC_020305	CTG	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945622
110	NC_020305	AAT	2	6	11503	11508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945622
111	NC_020305	TGA	2	6	11634	11639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945623
112	NC_020305	GAA	2	6	11669	11674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945623
113	NC_020305	ATT	2	6	11843	11848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945623
114	NC_020305	AAG	2	6	11873	11878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945623
115	NC_020305	TAA	2	6	12210	12215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945624
116	NC_020305	TTA	2	6	12235	12240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945624
117	NC_020305	ACT	2	6	12328	12333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
118	NC_020305	AGG	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945624
119	NC_020305	TAC	2	6	12377	12382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
120	NC_020305	TTC	2	6	12498	12503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945624
121	NC_020305	TGA	2	6	12537	12542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945624
122	NC_020305	TCA	2	6	12709	12714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
123	NC_020305	TCA	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
124	NC_020305	CTT	2	6	12793	12798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945624
125	NC_020305	CTA	2	6	12815	12820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
126	NC_020305	TAT	2	6	12933	12938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945624
127	NC_020305	TCT	2	6	12940	12945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945624
128	NC_020305	CAT	2	6	12983	12988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
129	NC_020305	GTA	2	6	12990	12995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945624
130	NC_020305	CAT	2	6	13184	13189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945624
131	NC_020305	ATA	2	6	13221	13226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945624
132	NC_020305	GAA	2	6	13268	13273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945624
133	NC_020305	TGA	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945624
134	NC_020305	GTG	2	6	13400	13405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945624
135	NC_020305	GTG	2	6	13416	13421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945624
136	NC_020305	GTG	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945624
137	NC_020305	GTC	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945624
138	NC_020305	TAT	2	6	13532	13537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945624
139	NC_020305	TAA	2	6	13551	13556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945624
140	NC_020305	TTA	2	6	13702	13707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945624
141	NC_020305	TTC	2	6	13878	13883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945624
142	NC_020305	TAA	2	6	13953	13958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945624
143	NC_020305	TGG	2	6	13960	13965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945624
144	NC_020305	TGA	2	6	14026	14031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945624
145	NC_020305	TGC	2	6	14055	14060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945624
146	NC_020305	ATT	2	6	14065	14070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945624
147	NC_020305	TTG	2	6	14102	14107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945624
148	NC_020305	TCC	2	6	14143	14148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945624
149	NC_020305	TCC	2	6	14238	14243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945624
150	NC_020305	GTT	2	6	14541	14546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945624
151	NC_020305	GAA	2	6	14729	14734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945624
152	NC_020305	TCC	2	6	15017	15022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945625
153	NC_020305	TCA	2	6	15086	15091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945625
154	NC_020305	CTG	2	6	15241	15246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945625
155	NC_020305	AAT	2	6	15304	15309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945625
156	NC_020305	GCC	2	6	15425	15430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945625
157	NC_020305	CCA	2	6	15456	15461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945625
158	NC_020305	CTG	2	6	15562	15567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945625
159	NC_020305	CTT	2	6	15619	15624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945625
160	NC_020305	GGC	2	6	15658	15663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945625
161	NC_020305	TGA	2	6	15816	15821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945625
162	NC_020305	AGT	2	6	15840	15845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945625
163	NC_020305	GTG	2	6	15884	15889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945625
164	NC_020305	AAG	2	6	15907	15912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945625
165	NC_020305	ATA	2	6	15965	15970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945625
166	NC_020305	GGT	2	6	15988	15993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945625
167	NC_020305	CTT	2	6	16045	16050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945625
168	NC_020305	CAG	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945625
169	NC_020305	TCA	2	6	16070	16075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945625
170	NC_020305	ACC	2	6	16267	16272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945625
171	NC_020305	GAA	2	6	16900	16905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945626
172	NC_020305	GAT	2	6	16906	16911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945626
173	NC_020305	TCC	2	6	16950	16955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945626
174	NC_020305	CGT	2	6	16981	16986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945626
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221	NC_020305	GCT	2	6	21094	21099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945630
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223	NC_020305	GAT	2	6	21245	21250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945630
224	NC_020305	CCA	2	6	21288	21293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945630
225	NC_020305	GCT	2	6	21362	21367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945630
226	NC_020305	ATT	2	6	21400	21405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451945630
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237	NC_020305	GGA	2	6	23262	23267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945632
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240	NC_020305	AGA	2	6	23453	23458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945632
241	NC_020305	TGA	2	6	23479	23484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945632
242	NC_020305	TGA	2	6	23524	23529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945632
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246	NC_020305	CCA	2	6	23954	23959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945633
247	NC_020305	ATA	2	6	23998	24003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451945633
248	NC_020305	GCC	2	6	24004	24009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945633
249	NC_020305	GAA	2	6	24031	24036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945633
250	NC_020305	GAG	2	6	24244	24249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945633
251	NC_020305	TGA	2	6	24290	24295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945633
252	NC_020305	CTT	2	6	24329	24334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945633
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254	NC_020305	GAT	2	6	24833	24838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945634
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260	NC_020305	AAG	2	6	25428	25433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945635
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.