MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020304	ATAAAA	2	12	34172	34183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020304	ATATGA	2	12	53832	53843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020304	CAAAGC	2	12	104285	104296	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020304	CTATCA	2	12	165646	165657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020304	CTTCAG	2	12	196959	196970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020304	ACTTGA	2	12	209056	209067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020304	TCCCCT	2	12	249842	249853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020304	AAAGAC	2	12	262985	262996	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020304	ATGTTT	2	12	331413	331424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020304	TCCCTT	2	12	395624	395635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020304	ATAGCA	2	12	428154	428165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020304	CATTTT	2	12	428997	429008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020304	GAAAAA	2	12	430134	430145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020304	TAAACA	2	12	461089	461100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020304	ATCTTT	2	12	524703	524714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020304	GTTTCT	2	12	537943	537954	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020304	GTAATC	2	12	557899	557910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020304	AATACA	2	12	580850	580861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020304	TCAATA	2	12	593247	593258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020304	TTTATG	2	12	740198	740209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020304	GGTGAT	2	12	760067	760078	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020304	TCTCTA	2	12	767913	767924	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020304	CTTATT	2	12	772846	772857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020304	GATACC	2	12	781474	781485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020304	CCCTCT	2	12	787528	787539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020304	CATTCT	2	12	796786	796797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020304	ATGACA	2	12	812223	812234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020304	TTTATT	2	12	897744	897755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020304	TTCCCA	2	12	1038475	1038486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020304	AGAAAG	2	12	1043599	1043610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020304	CAGCAT	2	12	1098891	1098902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020304	TTTAAA	2	12	1262848	1262859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020304	AAAAGA	2	12	1277193	1277204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020304	TTCTGA	2	12	1285688	1285699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020304	CTCTTG	2	12	1285762	1285773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020304	TCCTTG	2	12	1292208	1292219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020304	ATGGGG	2	12	1317087	1317098	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020304	AACCAA	2	12	1346828	1346839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020304	TCTGTT	2	12	1351692	1351703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020304	CATTTA	2	12	1366233	1366244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020304	GTTAGG	2	12	1371037	1371048	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020304	TCTTAT	2	12	1390232	1390243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020304	GTTTTT	2	12	1514490	1514501	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020304	GTTTTT	2	12	1519816	1519827	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020304	TTGTCA	2	12	1578995	1579006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020304	TGATAT	2	12	1603310	1603321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020304	GTTATC	2	12	1729343	1729354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020304	GTAAAT	2	12	1731059	1731070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020304	TGTTTT	2	12	1775191	1775202	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020304	TTCTTT	2	12	1862395	1862406	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020304	CTGTTT	2	12	1862435	1862446	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020304	TTTTTC	2	12	1918664	1918675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020304	AAAAAT	2	12	1996434	1996445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020304	AATGTA	2	12	2001869	2001880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020304	GTAAAG	2	12	2003797	2003808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020304	GGTAAA	2	12	2043018	2043029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020304	TAATTA	2	12	2058806	2058817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020304	TGTTTT	2	12	2084234	2084245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020304	GGGAAA	2	12	2113420	2113431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020304	GGTGAA	2	12	2116629	2116640	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020304	CGTTCG	2	12	2138572	2138583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020304	AAAATA	2	12	2143580	2143591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020304	ATGATT	2	12	2172737	2172748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020304	TTTTGC	2	12	2407692	2407703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020304	CATATA	2	12	2454844	2454855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020304	CCAAAA	2	12	2528082	2528093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020304	ACAGAG	2	12	2534099	2534110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020304	CTTTCT	2	12	2562607	2562618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020304	ATTTTT	2	12	2652538	2652549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020304	GTAAAA	2	12	2672251	2672262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020304	TGTTAT	2	12	2711025	2711036	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020304	AATATA	2	12	2719415	2719426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020304	CTTCCT	2	12	2753183	2753194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020304	GTTATT	2	12	2786482	2786493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020304	ATATCA	2	12	2816284	2816295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020304	TTAACG	2	12	2847800	2847811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020304	GAGAAA	2	12	2863074	2863085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020304	TTGTTT	2	12	2918147	2918158	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020304	GGCTTC	2	12	2962147	2962158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020304	CGCCTC	2	12	2962262	2962273	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020304	AAATAT	2	12	2964156	2964167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020304	TACTGC	2	12	3067632	3067643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020304	CTTTGT	2	12	3068927	3068938	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020304	CTTGGA	2	12	3096395	3096406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020304	AAATTA	2	12	3101447	3101458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020304	TATAAA	2	12	3118322	3118333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020304	GTCTTT	2	12	3137947	3137958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020304	CCTGTC	2	12	3138318	3138329	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020304	AGGGAA	2	12	3144553	3144564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020304	ATGCAT	2	12	3145526	3145537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020304	GAAAAA	2	12	3147424	3147435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020304	TAGAAA	2	12	3163348	3163359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020304	GTTGAT	2	12	3166232	3166243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020304	AAAACA	2	12	3188541	3188552	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020304	GAAAGT	2	12	3212354	3212365	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020304	CACATT	2	12	3325787	3325798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020304	TAAAAA	2	12	3330361	3330372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020304	TTATTT	2	12	3343006	3343017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020304	CACTGC	2	12	3370984	3370995	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020304	TACACC	2	12	3406289	3406300	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020304	ATCATA	2	12	3461383	3461394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020304	TAAAGC	2	12	3583914	3583925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020304	TAAACT	2	12	3588462	3588473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020304	GCAACT	2	12	3662478	3662489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020304	CGAACG	2	12	3691557	3691568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020304	CTTCGG	2	12	3835653	3835664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020304	TCTCTT	2	12	3867499	3867510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020304	ATTTTA	2	12	3921924	3921935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020304	CGAACG	2	12	3983974	3983985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.