MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020304	AAAG	2	8	453	460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020304	GTTG	2	8	949	956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020304	CAGA	2	8	2703	2710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020304	TGGT	2	8	2719	2726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020304	AGGA	2	8	8125	8132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020304	CTTT	2	8	8326	8333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020304	AAGG	2	8	11559	11566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020304	GAAA	2	8	13273	13280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020304	ATTC	2	8	15450	15457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020304	AAAT	2	8	21005	21012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020304	CATA	2	8	21176	21183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020304	GAAA	2	8	23334	23341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020304	TACA	2	8	23619	23626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020304	AATA	2	8	23679	23686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020304	TCTT	2	8	31552	31559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020304	AAAT	2	8	33985	33992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020304	ATGG	2	8	34108	34115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020304	CAAA	2	8	34193	34200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020304	CATA	2	8	40668	40675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020304	TTCA	2	8	44561	44568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020304	CCCT	2	8	58094	58101	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_020304	AAGA	2	8	58909	58916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020304	CAAA	3	12	64240	64251	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020304	AAGA	2	8	64384	64391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020304	AATA	2	8	65065	65072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020304	TTTG	2	8	65124	65131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020304	CAGA	2	8	68571	68578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020304	TTCC	2	8	68840	68847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020304	TCAA	2	8	71003	71010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020304	CTCC	2	8	73975	73982	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_020304	TTTA	2	8	75283	75290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020304	CTGT	2	8	75432	75439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020304	AGAC	2	8	75548	75555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020304	TTTC	2	8	90904	90911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020304	TCAC	2	8	92730	92737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020304	GTAG	2	8	104361	104368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020304	AACA	2	8	111209	111216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020304	CTTC	2	8	112544	112551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020304	CATT	2	8	117013	117020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020304	CAAA	2	8	121041	121048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020304	ATAC	2	8	147942	147949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020304	ACAT	2	8	147972	147979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020304	CCCT	2	8	147995	148002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_020304	GAAA	2	8	148062	148069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020304	GTTA	2	8	159809	159816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020304	ACGG	2	8	165031	165038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020304	GGCA	2	8	165351	165358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020304	TCTT	2	8	167441	167448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020304	CAGG	2	8	175805	175812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020304	AAAT	2	8	182934	182941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020304	AGGA	2	8	192215	192222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020304	AACC	2	8	196996	197003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020304	ACAA	2	8	197044	197051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020304	TTGT	2	8	197123	197130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020304	CCAG	2	8	201778	201785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020304	CATA	2	8	202568	202575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020304	CAGA	2	8	203735	203742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020304	GATT	2	8	209317	209324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020304	CTTT	2	8	209469	209476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020304	TCAA	2	8	213716	213723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020304	TCAC	2	8	216056	216063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020304	CAAA	2	8	216199	216206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020304	ATGA	2	8	218083	218090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020304	TTTA	2	8	219274	219281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020304	GTTT	2	8	224222	224229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020304	GTTG	2	8	230178	230185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020304	CTTT	2	8	236166	236173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020304	CCAG	2	8	236234	236241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020304	ACAA	2	8	245463	245470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020304	AGGG	2	8	249816	249823	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020304	AGAA	2	8	255936	255943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020304	ATCT	2	8	257841	257848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020304	TTTA	2	8	257925	257932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020304	CCAG	2	8	258008	258015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020304	TTAT	2	8	259653	259660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020304	TTCT	2	8	259661	259668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020304	GAAA	2	8	259739	259746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020304	TAAT	2	8	264504	264511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020304	TGAT	2	8	266709	266716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020304	ATCT	2	8	267009	267016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020304	CAAA	2	8	267958	267965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020304	ATTT	2	8	268017	268024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020304	AGAA	2	8	268068	268075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020304	AGAA	2	8	286255	286262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020304	TAAG	2	8	292961	292968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020304	TGAA	2	8	293035	293042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020304	GACT	2	8	295349	295356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020304	ACAA	2	8	296201	296208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020304	GCAG	2	8	297307	297314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020304	TTTC	3	12	314714	314725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020304	AAAC	2	8	317297	317304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020304	AATT	2	8	317390	317397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020304	TAAC	2	8	322364	322371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020304	ATTC	2	8	330990	330997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020304	AATC	2	8	331193	331200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020304	ATGG	2	8	331239	331246	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020304	TGAC	2	8	331444	331451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020304	GCCT	2	8	331485	331492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020304	CAGA	2	8	331548	331555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020304	AGGA	2	8	331604	331611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020304	AGTC	2	8	333852	333859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020304	CGCC	2	8	333942	333949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_020304	CCCA	2	8	334054	334061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_020304	TAAA	2	8	334765	334772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020304	GACA	2	8	336172	336179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020304	CTGT	2	8	336318	336325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020304	AGCA	2	8	345609	345616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020304	GCCT	2	8	347331	347338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020304	TAAA	2	8	348354	348361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020304	AGAA	2	8	348404	348411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020304	GACA	2	8	349200	349207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020304	CTTT	2	8	359489	359496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020304	AACA	2	8	359508	359515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020304	GCTT	2	8	359605	359612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020304	AATT	2	8	367133	367140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020304	AGAC	2	8	367147	367154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020304	GAAC	2	8	367233	367240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020304	TAAG	2	8	384067	384074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020304	AAAG	2	8	384628	384635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020304	TTCA	2	8	384746	384753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020304	AGAT	2	8	387210	387217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020304	ACAG	2	8	389615	389622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020304	GCCA	2	8	391707	391714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020304	TTTG	2	8	393717	393724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020304	CACC	2	8	395611	395618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_020304	AATA	2	8	395973	395980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020304	GTTT	2	8	404581	404588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020304	ATCT	2	8	425501	425508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020304	AATC	2	8	426796	426803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020304	TATC	2	8	426886	426893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020304	AGAA	2	8	428589	428596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020304	ATCT	2	8	428676	428683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020304	AGAA	2	8	429262	429269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020304	ACCT	2	8	429517	429524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020304	ATTA	2	8	429613	429620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020304	AGTT	2	8	441714	441721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020304	TAAT	2	8	461146	461153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020304	TAAA	2	8	462695	462702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020304	TTTA	2	8	476261	476268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020304	ATTT	2	8	476446	476453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020304	AATA	2	8	479170	479177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020304	GCTG	2	8	479194	479201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020304	CTAA	2	8	497477	497484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020304	ATCT	2	8	497652	497659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020304	TCGA	2	8	497745	497752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020304	CTAA	2	8	502190	502197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020304	ATCT	2	8	502365	502372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020304	TCGA	2	8	502458	502465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020304	TCTT	2	8	503618	503625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020304	AATC	2	8	503644	503651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020304	TTGT	2	8	503972	503979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020304	ATAA	2	8	503989	503996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_020304	ATCC	2	8	510579	510586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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442	NC_020304	GATG	2	8	1444549	1444556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_020304	CCGT	2	8	1445174	1445181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
444	NC_020304	CAAC	2	8	1445411	1445418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
445	NC_020304	ACAA	2	8	1448590	1448597	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_020304	AGTC	2	8	1455950	1455957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_020304	TGCT	2	8	1460595	1460602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
448	NC_020304	TGTA	2	8	1462220	1462227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_020304	GTTT	2	8	1470976	1470983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
450	NC_020304	AAAG	2	8	1471067	1471074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020304	TGCT	2	8	1474846	1474853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_020304	GGCT	2	8	1498809	1498816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
453	NC_020304	AAGT	2	8	1502947	1502954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020304	GCTC	2	8	1503017	1503024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_020304	TCTT	2	8	1503053	1503060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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457	NC_020304	TACT	2	8	1505518	1505525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
458	NC_020304	AAAC	2	8	1505550	1505557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
459	NC_020304	TCTT	2	8	1511991	1511998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
460	NC_020304	AGAT	2	8	1512786	1512793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_020304	GAAA	2	8	1520140	1520147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
462	NC_020304	TCAT	2	8	1524705	1524712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_020304	TTCT	2	8	1528367	1528374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
464	NC_020304	TTCC	2	8	1528440	1528447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_020304	TATT	2	8	1529569	1529576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_020304	TTGC	2	8	1529746	1529753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
467	NC_020304	GACT	2	8	1546108	1546115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
468	NC_020304	ATCA	2	8	1546160	1546167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_020304	TGAT	2	8	1546425	1546432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
470	NC_020304	TAAA	2	8	1546519	1546526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_020304	ACTC	2	8	1547360	1547367	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_020304	AAAG	2	8	1550010	1550017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_020304	TTCA	2	8	1561174	1561181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_020304	AGAT	2	8	1565020	1565027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_020304	ACCC	2	8	1565045	1565052	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
476	NC_020304	AGCG	2	8	1572740	1572747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
477	NC_020304	TATT	2	8	1573094	1573101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_020304	TTTC	2	8	1579082	1579089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
479	NC_020304	CCTC	3	12	1584836	1584847	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
480	NC_020304	ATGA	2	8	1586685	1586692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_020304	CTTC	2	8	1593784	1593791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_020304	GGAG	2	8	1595148	1595155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_020304	AAAT	2	8	1598459	1598466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_020304	TTTG	2	8	1609183	1609190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
485	NC_020304	AGGA	2	8	1612818	1612825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_020304	TATC	2	8	1619334	1619341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_020304	ATTG	2	8	1625991	1625998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_020304	GGCC	2	8	1626030	1626037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_020304	GTAA	2	8	1626928	1626935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_020304	TTAT	2	8	1628202	1628209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_020304	TCAT	2	8	1631517	1631524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
492	NC_020304	TGTT	2	8	1632058	1632065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_020304	TCAA	2	8	1632109	1632116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_020304	CTCA	2	8	1636517	1636524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_020304	GTTG	2	8	1638455	1638462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_020304	ATGT	2	8	1638705	1638712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_020304	CCCG	2	8	1638920	1638927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_020304	GTCT	2	8	1639911	1639918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_020304	GTCT	2	8	1639985	1639992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_020304	AGAC	2	8	1640617	1640624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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