MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	ACGGCG	2	12	7419	7430	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451945542
2	NC_020303	GCATTC	2	12	16592	16603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451945551
3	NC_020303	GCCCTG	2	12	19182	19193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945554
4	NC_020303	GCCCAG	2	12	23690	23701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451945559
5	NC_020303	GGCCGG	2	12	24297	24308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945560
6	NC_020303	CGGTGA	2	12	24471	24482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451945560
7	NC_020303	GGTAGA	2	12	25095	25106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451945560
8	NC_020303	CAATGA	2	12	25278	25289	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451945560
9	NC_020303	CTGTCC	2	12	27348	27359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451945563
10	NC_020303	AGACCG	2	12	30722	30733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
11	NC_020303	CGCGGT	2	12	38163	38174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	451945571
12	NC_020303	GGCCGA	2	12	41693	41704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451945573
13	NC_020303	CGTTTC	2	12	45060	45071	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451945577
14	NC_020303	CAGGCC	2	12	45301	45312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451945577
15	NC_020303	CGGTGA	2	12	46088	46099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451945578
16	NC_020303	CCTGGC	2	12	48409	48420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945579
17	NC_020303	TCACCA	2	12	51730	51741	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451945581
18	NC_020303	GGATCG	2	12	51818	51829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451945581
19	NC_020303	ACCGCC	2	12	56736	56747	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451945586
20	NC_020303	GCGCTG	2	12	56763	56774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	451945586
21	NC_020303	GCCGCA	2	12	60725	60736	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451945590
22	NC_020303	CGCAGG	2	12	60870	60881	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451945591
23	NC_020303	GACGGT	2	12	61517	61528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451945591
24	NC_020303	CCTTGG	2	12	62398	62409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945591
25	NC_020303	GGCCCC	3	18	65038	65055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945594
26	NC_020303	TGTCGA	2	12	65077	65088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451945594
27	NC_020303	GCACGA	2	12	66729	66740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
28	NC_020303	ATCAGG	2	12	68095	68106	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451945596
29	NC_020303	TGGTGC	2	12	71217	71228	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451945598
30	NC_020303	GCATCC	2	12	72196	72207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451945600
31	NC_020303	CCATGT	2	12	72835	72846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451945600
32	NC_020303	TGGGTC	2	12	73826	73837	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451945601
33	NC_020303	CGGTGG	2	12	74055	74066	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	451945601
34	NC_020303	CCTGGC	2	12	75891	75902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945603
35	NC_020303	ACCGCC	2	12	75997	76008	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451945603
36	NC_020303	CCCGGG	2	12	76312	76323	0 %	0 %	50 %	50 %	451945603
37	NC_020303	TCACCG	2	12	76793	76804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451945604
38	NC_020303	CCCCAC	2	12	76932	76943	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	451945605
39	NC_020303	CGTCCG	2	12	77747	77758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945605
40	NC_020303	ACCGTG	2	12	77955	77966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451945605
41	NC_020303	AGGACA	2	12	78658	78669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451945605
42	NC_020303	CTGGCC	2	12	79229	79240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945606
43	NC_020303	CCGAGC	2	12	79257	79268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451945606
44	NC_020303	CGTCGC	2	12	80516	80527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945607
45	NC_020303	CCGCTG	2	12	81058	81069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945608
46	NC_020303	CGGATG	2	12	82271	82282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451945610
47	NC_020303	ACCCCG	2	12	85420	85431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451945610
48	NC_020303	GCCCAC	2	12	85834	85845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451945610

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.