MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	ATAC	3	12	95	106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020303	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	451945537
3	NC_020303	CGCT	2	8	581	588	0 %	25 %	25 %	50 %	451945537
4	NC_020303	GTAT	2	8	1022	1029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020303	TGAA	2	8	1157	1164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020303	CGTC	2	8	1309	1316	0 %	25 %	25 %	50 %	451945538
7	NC_020303	GCGG	2	8	1423	1430	0 %	0 %	75 %	25 %	451945538
8	NC_020303	TGGA	2	8	1494	1501	25 %	25 %	50 %	0 %	451945538
9	NC_020303	CTGA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	25 %	25 %	451945538
10	NC_020303	TGCG	2	8	2422	2429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020303	GTGA	2	8	2438	2445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020303	CAGT	2	8	2566	2573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020303	CCCA	2	8	2782	2789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_020303	GACG	2	8	2815	2822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020303	GCTG	2	8	3809	3816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020303	ACGA	2	8	4142	4149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020303	ACGG	2	8	4176	4183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020303	CTCC	2	8	4184	4191	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_020303	CGAG	2	8	4629	4636	25 %	0 %	50 %	25 %	451945540
20	NC_020303	GGCC	2	8	5481	5488	0 %	0 %	50 %	50 %	451945540
21	NC_020303	GGCT	2	8	6268	6275	0 %	25 %	50 %	25 %	451945541
22	NC_020303	CCTG	2	8	6732	6739	0 %	25 %	25 %	50 %	451945541
23	NC_020303	GTTG	2	8	7131	7138	0 %	50 %	50 %	0 %	451945542
24	NC_020303	GACC	2	8	7603	7610	25 %	0 %	25 %	50 %	451945542
25	NC_020303	GCAG	2	8	8368	8375	25 %	0 %	50 %	25 %	451945544
26	NC_020303	GCAC	2	8	8799	8806	25 %	0 %	25 %	50 %	451945544
27	NC_020303	CTGG	2	8	9739	9746	0 %	25 %	50 %	25 %	451945545
28	NC_020303	TGCT	2	8	10420	10427	0 %	50 %	25 %	25 %	451945546
29	NC_020303	GCAG	2	8	11768	11775	25 %	0 %	50 %	25 %	451945548
30	NC_020303	GCAC	2	8	12199	12206	25 %	0 %	25 %	50 %	451945548
31	NC_020303	CCGG	2	8	12825	12832	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
32	NC_020303	GGCC	2	8	12956	12963	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
33	NC_020303	TGCT	2	8	13246	13253	0 %	50 %	25 %	25 %	451945549
34	NC_020303	CCTC	2	8	13675	13682	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020303	GCGA	2	8	14479	14486	25 %	0 %	50 %	25 %	451945550
36	NC_020303	ATCA	2	8	14589	14596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020303	CGGG	2	8	14980	14987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020303	CGCA	2	8	15415	15422	25 %	0 %	25 %	50 %	451945551
39	NC_020303	GTCG	2	8	15618	15625	0 %	25 %	50 %	25 %	451945551
40	NC_020303	CGGT	2	8	16097	16104	0 %	25 %	50 %	25 %	451945551
41	NC_020303	CGGA	2	8	16234	16241	25 %	0 %	50 %	25 %	451945551
42	NC_020303	CGAT	2	8	16409	16416	25 %	25 %	25 %	25 %	451945551
43	NC_020303	GACT	2	8	16677	16684	25 %	25 %	25 %	25 %	451945551
44	NC_020303	CACC	2	8	17115	17122	25 %	0 %	0 %	75 %	451945552
45	NC_020303	CTGC	2	8	17149	17156	0 %	25 %	25 %	50 %	451945552
46	NC_020303	TGCG	2	8	17636	17643	0 %	25 %	50 %	25 %	451945552
47	NC_020303	TAAT	2	8	17809	17816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020303	CGAT	2	8	18739	18746	25 %	25 %	25 %	25 %	451945553
49	NC_020303	CGCC	2	8	18809	18816	0 %	0 %	25 %	75 %	451945553
50	NC_020303	GGCA	2	8	18924	18931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020303	GCAG	2	8	20878	20885	25 %	0 %	50 %	25 %	451945556
52	NC_020303	GCAC	2	8	21309	21316	25 %	0 %	25 %	50 %	451945556
53	NC_020303	CAGC	2	8	21712	21719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020303	TCTG	2	8	21818	21825	0 %	50 %	25 %	25 %	451945557
55	NC_020303	CGGG	2	8	22241	22248	0 %	0 %	75 %	25 %	451945558
56	NC_020303	GCAG	2	8	22981	22988	25 %	0 %	50 %	25 %	451945559
57	NC_020303	ATGG	2	8	23804	23811	25 %	25 %	50 %	0 %	451945559
58	NC_020303	GATG	2	8	24273	24280	25 %	25 %	50 %	0 %	451945560
59	NC_020303	ATCC	2	8	24595	24602	25 %	25 %	0 %	50 %	451945560
60	NC_020303	GTTC	2	8	24821	24828	0 %	50 %	25 %	25 %	451945560
61	NC_020303	GCGG	3	12	25562	25573	0 %	0 %	75 %	25 %	451945561
62	NC_020303	TGGC	2	8	25617	25624	0 %	25 %	50 %	25 %	451945561
63	NC_020303	GCAC	2	8	25894	25901	25 %	0 %	25 %	50 %	451945561
64	NC_020303	GATA	2	8	26035	26042	50 %	25 %	25 %	0 %	451945561
65	NC_020303	CCCT	2	8	26303	26310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_020303	AGCT	2	8	26603	26610	25 %	25 %	25 %	25 %	451945562
67	NC_020303	CCAG	2	8	27773	27780	25 %	0 %	25 %	50 %	451945563
68	NC_020303	TGGT	2	8	28276	28283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020303	CCGA	2	8	28386	28393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020303	TCGG	2	8	28569	28576	0 %	25 %	50 %	25 %	451945564
71	NC_020303	ATCT	2	8	29205	29212	25 %	50 %	0 %	25 %	451945564
72	NC_020303	CAGC	2	8	30416	30423	25 %	0 %	25 %	50 %	451945565
73	NC_020303	TCGA	2	8	30673	30680	25 %	25 %	25 %	25 %	451945565
74	NC_020303	TGGA	2	8	31082	31089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020303	GGCT	2	8	31200	31207	0 %	25 %	50 %	25 %	451945566
76	NC_020303	CCGG	2	8	31728	31735	0 %	0 %	50 %	50 %	451945566
77	NC_020303	CCAC	2	8	33635	33642	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_020303	CTGG	2	8	33768	33775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020303	GTGC	2	8	34495	34502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020303	TGCC	2	8	34869	34876	0 %	25 %	25 %	50 %	451945568
81	NC_020303	GAGC	2	8	34935	34942	25 %	0 %	50 %	25 %	451945568
82	NC_020303	AGGG	2	8	34952	34959	25 %	0 %	75 %	0 %	451945568
83	NC_020303	CCAC	2	8	35114	35121	25 %	0 %	0 %	75 %	451945568
84	NC_020303	CTGC	2	8	35557	35564	0 %	25 %	25 %	50 %	451945569
85	NC_020303	TGAT	2	8	35757	35764	25 %	50 %	25 %	0 %	451945569
86	NC_020303	GGCG	2	8	35779	35786	0 %	0 %	75 %	25 %	451945569
87	NC_020303	GGGT	2	8	36375	36382	0 %	25 %	75 %	0 %	451945569
88	NC_020303	GGAT	2	8	36919	36926	25 %	25 %	50 %	0 %	451945569
89	NC_020303	CAGC	2	8	37003	37010	25 %	0 %	25 %	50 %	451945569
90	NC_020303	AGAC	2	8	37565	37572	50 %	0 %	25 %	25 %	451945570
91	NC_020303	TTCG	2	8	37724	37731	0 %	50 %	25 %	25 %	451945570
92	NC_020303	AGGG	2	8	37968	37975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020303	TGGG	2	8	38489	38496	0 %	25 %	75 %	0 %	451945571
94	NC_020303	ACCC	2	8	38944	38951	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_020303	TCCT	2	8	39217	39224	0 %	50 %	0 %	50 %	451945572
96	NC_020303	GGAC	2	8	39300	39307	25 %	0 %	50 %	25 %	451945572
97	NC_020303	GGCT	2	8	39898	39905	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
98	NC_020303	ACCG	2	8	39946	39953	25 %	0 %	25 %	50 %	451945572
99	NC_020303	TGGC	2	8	40702	40709	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
100	NC_020303	CGCT	2	8	40786	40793	0 %	25 %	25 %	50 %	451945572
101	NC_020303	GCTG	2	8	40869	40876	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
102	NC_020303	GCCG	2	8	41636	41643	0 %	0 %	50 %	50 %	451945573
103	NC_020303	TCCG	2	8	41720	41727	0 %	25 %	25 %	50 %	451945573
104	NC_020303	GGGT	2	8	42282	42289	0 %	25 %	75 %	0 %	451945574
105	NC_020303	GGCC	2	8	42342	42349	0 %	0 %	50 %	50 %	451945574
106	NC_020303	GCTG	2	8	42472	42479	0 %	25 %	50 %	25 %	451945574
107	NC_020303	ACGA	2	8	43435	43442	50 %	0 %	25 %	25 %	451945576
108	NC_020303	GGCC	2	8	43746	43753	0 %	0 %	50 %	50 %	451945576
109	NC_020303	GGGC	2	8	43952	43959	0 %	0 %	75 %	25 %	451945576
110	NC_020303	GAGT	2	8	44574	44581	25 %	25 %	50 %	0 %	451945577
111	NC_020303	TGGC	2	8	44912	44919	0 %	25 %	50 %	25 %	451945577
112	NC_020303	CTGG	2	8	45250	45257	0 %	25 %	50 %	25 %	451945577
113	NC_020303	AGCC	2	8	45893	45900	25 %	0 %	25 %	50 %	451945577
114	NC_020303	GGTG	2	8	46181	46188	0 %	25 %	75 %	0 %	451945578
115	NC_020303	GACT	2	8	46594	46601	25 %	25 %	25 %	25 %	451945578
116	NC_020303	GGTG	2	8	46679	46686	0 %	25 %	75 %	0 %	451945578
117	NC_020303	CGGG	2	8	46834	46841	0 %	0 %	75 %	25 %	451945578
118	NC_020303	CGGG	2	8	47251	47258	0 %	0 %	75 %	25 %	451945579
119	NC_020303	GGGC	2	8	47578	47585	0 %	0 %	75 %	25 %	451945579
120	NC_020303	GCAG	2	8	47649	47656	25 %	0 %	50 %	25 %	451945579
121	NC_020303	ACCT	2	8	47993	48000	25 %	25 %	0 %	50 %	451945579
122	NC_020303	GGTT	2	8	48736	48743	0 %	50 %	50 %	0 %	451945580
123	NC_020303	CCGG	2	8	48935	48942	0 %	0 %	50 %	50 %	451945580
124	NC_020303	GCGG	2	8	49158	49165	0 %	0 %	75 %	25 %	451945580
125	NC_020303	CTGG	2	8	49431	49438	0 %	25 %	50 %	25 %	451945580
126	NC_020303	CACC	2	8	49539	49546	25 %	0 %	0 %	75 %	451945580
127	NC_020303	GACG	2	8	49575	49582	25 %	0 %	50 %	25 %	451945580
128	NC_020303	CCGA	2	8	50107	50114	25 %	0 %	25 %	50 %	451945580
129	NC_020303	CACC	2	8	50208	50215	25 %	0 %	0 %	75 %	451945580
130	NC_020303	GGGA	2	8	51359	51366	25 %	0 %	75 %	0 %	451945581
131	NC_020303	CCGG	2	8	51691	51698	0 %	0 %	50 %	50 %	451945581
132	NC_020303	CGGG	2	8	51937	51944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020303	GACC	2	8	52624	52631	25 %	0 %	25 %	50 %	451945582
134	NC_020303	CAAG	2	8	52677	52684	50 %	0 %	25 %	25 %	451945582
135	NC_020303	TCAC	2	8	53031	53038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020303	ACCG	2	8	53131	53138	25 %	0 %	25 %	50 %	451945583
137	NC_020303	CGCC	2	8	54119	54126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_020303	CGGG	2	8	54412	54419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020303	AGCA	2	8	54453	54460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020303	GCTG	2	8	55248	55255	0 %	25 %	50 %	25 %	451945584
141	NC_020303	ACCC	2	8	55322	55329	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_020303	GCAG	2	8	55628	55635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020303	TTGT	2	8	55725	55732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020303	TAGC	2	8	55818	55825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_020303	GGCG	2	8	64105	64112	0 %	0 %	75 %	25 %	451945593
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234	NC_020303	GGCT	2	8	86140	86147	0 %	25 %	50 %	25 %	451945610

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.