MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	ATAC	3	12	95	106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020303	GTAT	2	8	1022	1029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020303	TGAA	2	8	1157	1164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020303	TGCG	2	8	2422	2429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020303	GTGA	2	8	2438	2445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020303	CAGT	2	8	2566	2573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020303	CCCA	2	8	2782	2789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_020303	GACG	2	8	2815	2822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020303	GCTG	2	8	3809	3816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020303	ACGA	2	8	4142	4149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020303	ACGG	2	8	4176	4183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020303	CTCC	2	8	4184	4191	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020303	CCTC	2	8	13675	13682	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_020303	ATCA	2	8	14589	14596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020303	CGGG	2	8	14980	14987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020303	TAAT	2	8	17809	17816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020303	GGCA	2	8	18924	18931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020303	CAGC	2	8	21712	21719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020303	CCCT	2	8	26303	26310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_020303	TGGT	2	8	28276	28283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020303	CCGA	2	8	28386	28393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020303	TGGA	2	8	31082	31089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020303	CCAC	2	8	33635	33642	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_020303	CTGG	2	8	33768	33775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020303	GTGC	2	8	34495	34502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020303	AGGG	2	8	37968	37975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020303	ACCC	2	8	38944	38951	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_020303	CGGG	2	8	51937	51944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020303	TCAC	2	8	53031	53038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020303	CGCC	2	8	54119	54126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_020303	CGGG	2	8	54412	54419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020303	AGCA	2	8	54453	54460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020303	ACCC	2	8	55322	55329	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_020303	GCAG	2	8	55628	55635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020303	TTGT	2	8	55725	55732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020303	TAGC	2	8	55818	55825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020303	TCTA	2	8	56693	56700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020303	CGAA	2	8	57099	57106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020303	GCAA	2	8	58423	58430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020303	CGGC	2	8	58998	59005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020303	GGCC	2	8	59872	59879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020303	GAGT	2	8	59946	59953	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020303	GGGT	2	8	60753	60760	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020303	GTGA	2	8	63668	63675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020303	AGGG	2	8	63687	63694	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020303	CTGT	2	8	64670	64677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020303	GCAG	3	12	64779	64790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020303	TTGA	2	8	64811	64818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020303	CAGG	2	8	65769	65776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020303	CGAC	2	8	71961	71968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020303	CGGA	2	8	73323	73330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020303	CGCC	2	8	74215	74222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020303	GGTG	2	8	74455	74462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020303	ACCC	2	8	76503	76510	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_020303	GGAA	2	8	76916	76923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020303	CCTT	2	8	79918	79925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020303	CTTA	2	8	81109	81116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020303	CTGC	2	8	81149	81156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020303	CCTT	2	8	81738	81745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020303	GCAC	2	8	81995	82002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.