MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	451945537
2	NC_020303	CGCT	2	8	581	588	0 %	25 %	25 %	50 %	451945537
3	NC_020303	CGTC	2	8	1309	1316	0 %	25 %	25 %	50 %	451945538
4	NC_020303	GCGG	2	8	1423	1430	0 %	0 %	75 %	25 %	451945538
5	NC_020303	TGGA	2	8	1494	1501	25 %	25 %	50 %	0 %	451945538
6	NC_020303	CTGA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	25 %	25 %	451945538
7	NC_020303	CGAG	2	8	4629	4636	25 %	0 %	50 %	25 %	451945540
8	NC_020303	GGCC	2	8	5481	5488	0 %	0 %	50 %	50 %	451945540
9	NC_020303	GGCT	2	8	6268	6275	0 %	25 %	50 %	25 %	451945541
10	NC_020303	CCTG	2	8	6732	6739	0 %	25 %	25 %	50 %	451945541
11	NC_020303	GTTG	2	8	7131	7138	0 %	50 %	50 %	0 %	451945542
12	NC_020303	GACC	2	8	7603	7610	25 %	0 %	25 %	50 %	451945542
13	NC_020303	GCAG	2	8	8368	8375	25 %	0 %	50 %	25 %	451945544
14	NC_020303	GCAC	2	8	8799	8806	25 %	0 %	25 %	50 %	451945544
15	NC_020303	CTGG	2	8	9739	9746	0 %	25 %	50 %	25 %	451945545
16	NC_020303	TGCT	2	8	10420	10427	0 %	50 %	25 %	25 %	451945546
17	NC_020303	GCAG	2	8	11768	11775	25 %	0 %	50 %	25 %	451945548
18	NC_020303	GCAC	2	8	12199	12206	25 %	0 %	25 %	50 %	451945548
19	NC_020303	CCGG	2	8	12825	12832	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
20	NC_020303	GGCC	2	8	12956	12963	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
21	NC_020303	TGCT	2	8	13246	13253	0 %	50 %	25 %	25 %	451945549
22	NC_020303	GCGA	2	8	14479	14486	25 %	0 %	50 %	25 %	451945550
23	NC_020303	CGCA	2	8	15415	15422	25 %	0 %	25 %	50 %	451945551
24	NC_020303	GTCG	2	8	15618	15625	0 %	25 %	50 %	25 %	451945551
25	NC_020303	CGGT	2	8	16097	16104	0 %	25 %	50 %	25 %	451945551
26	NC_020303	CGGA	2	8	16234	16241	25 %	0 %	50 %	25 %	451945551
27	NC_020303	CGAT	2	8	16409	16416	25 %	25 %	25 %	25 %	451945551
28	NC_020303	GACT	2	8	16677	16684	25 %	25 %	25 %	25 %	451945551
29	NC_020303	CACC	2	8	17115	17122	25 %	0 %	0 %	75 %	451945552
30	NC_020303	CTGC	2	8	17149	17156	0 %	25 %	25 %	50 %	451945552
31	NC_020303	TGCG	2	8	17636	17643	0 %	25 %	50 %	25 %	451945552
32	NC_020303	CGAT	2	8	18739	18746	25 %	25 %	25 %	25 %	451945553
33	NC_020303	CGCC	2	8	18809	18816	0 %	0 %	25 %	75 %	451945553
34	NC_020303	GCAG	2	8	20878	20885	25 %	0 %	50 %	25 %	451945556
35	NC_020303	GCAC	2	8	21309	21316	25 %	0 %	25 %	50 %	451945556
36	NC_020303	TCTG	2	8	21818	21825	0 %	50 %	25 %	25 %	451945557
37	NC_020303	CGGG	2	8	22241	22248	0 %	0 %	75 %	25 %	451945558
38	NC_020303	GCAG	2	8	22981	22988	25 %	0 %	50 %	25 %	451945559
39	NC_020303	ATGG	2	8	23804	23811	25 %	25 %	50 %	0 %	451945559
40	NC_020303	GATG	2	8	24273	24280	25 %	25 %	50 %	0 %	451945560
41	NC_020303	ATCC	2	8	24595	24602	25 %	25 %	0 %	50 %	451945560
42	NC_020303	GTTC	2	8	24821	24828	0 %	50 %	25 %	25 %	451945560
43	NC_020303	GCGG	3	12	25562	25573	0 %	0 %	75 %	25 %	451945561
44	NC_020303	TGGC	2	8	25617	25624	0 %	25 %	50 %	25 %	451945561
45	NC_020303	GCAC	2	8	25894	25901	25 %	0 %	25 %	50 %	451945561
46	NC_020303	GATA	2	8	26035	26042	50 %	25 %	25 %	0 %	451945561
47	NC_020303	AGCT	2	8	26603	26610	25 %	25 %	25 %	25 %	451945562
48	NC_020303	CCAG	2	8	27773	27780	25 %	0 %	25 %	50 %	451945563
49	NC_020303	TCGG	2	8	28569	28576	0 %	25 %	50 %	25 %	451945564
50	NC_020303	ATCT	2	8	29205	29212	25 %	50 %	0 %	25 %	451945564
51	NC_020303	CAGC	2	8	30416	30423	25 %	0 %	25 %	50 %	451945565
52	NC_020303	TCGA	2	8	30673	30680	25 %	25 %	25 %	25 %	451945565
53	NC_020303	GGCT	2	8	31200	31207	0 %	25 %	50 %	25 %	451945566
54	NC_020303	CCGG	2	8	31728	31735	0 %	0 %	50 %	50 %	451945566
55	NC_020303	TGCC	2	8	34869	34876	0 %	25 %	25 %	50 %	451945568
56	NC_020303	GAGC	2	8	34935	34942	25 %	0 %	50 %	25 %	451945568
57	NC_020303	AGGG	2	8	34952	34959	25 %	0 %	75 %	0 %	451945568
58	NC_020303	CCAC	2	8	35114	35121	25 %	0 %	0 %	75 %	451945568
59	NC_020303	CTGC	2	8	35557	35564	0 %	25 %	25 %	50 %	451945569
60	NC_020303	TGAT	2	8	35757	35764	25 %	50 %	25 %	0 %	451945569
61	NC_020303	GGCG	2	8	35779	35786	0 %	0 %	75 %	25 %	451945569
62	NC_020303	GGGT	2	8	36375	36382	0 %	25 %	75 %	0 %	451945569
63	NC_020303	GGAT	2	8	36919	36926	25 %	25 %	50 %	0 %	451945569
64	NC_020303	CAGC	2	8	37003	37010	25 %	0 %	25 %	50 %	451945569
65	NC_020303	AGAC	2	8	37565	37572	50 %	0 %	25 %	25 %	451945570
66	NC_020303	TTCG	2	8	37724	37731	0 %	50 %	25 %	25 %	451945570
67	NC_020303	TGGG	2	8	38489	38496	0 %	25 %	75 %	0 %	451945571
68	NC_020303	TCCT	2	8	39217	39224	0 %	50 %	0 %	50 %	451945572
69	NC_020303	GGAC	2	8	39300	39307	25 %	0 %	50 %	25 %	451945572
70	NC_020303	GGCT	2	8	39898	39905	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
71	NC_020303	ACCG	2	8	39946	39953	25 %	0 %	25 %	50 %	451945572
72	NC_020303	TGGC	2	8	40702	40709	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
73	NC_020303	CGCT	2	8	40786	40793	0 %	25 %	25 %	50 %	451945572
74	NC_020303	GCTG	2	8	40869	40876	0 %	25 %	50 %	25 %	451945572
75	NC_020303	GCCG	2	8	41636	41643	0 %	0 %	50 %	50 %	451945573
76	NC_020303	TCCG	2	8	41720	41727	0 %	25 %	25 %	50 %	451945573
77	NC_020303	GGGT	2	8	42282	42289	0 %	25 %	75 %	0 %	451945574
78	NC_020303	GGCC	2	8	42342	42349	0 %	0 %	50 %	50 %	451945574
79	NC_020303	GCTG	2	8	42472	42479	0 %	25 %	50 %	25 %	451945574
80	NC_020303	ACGA	2	8	43435	43442	50 %	0 %	25 %	25 %	451945576
81	NC_020303	GGCC	2	8	43746	43753	0 %	0 %	50 %	50 %	451945576
82	NC_020303	GGGC	2	8	43952	43959	0 %	0 %	75 %	25 %	451945576
83	NC_020303	GAGT	2	8	44574	44581	25 %	25 %	50 %	0 %	451945577
84	NC_020303	TGGC	2	8	44912	44919	0 %	25 %	50 %	25 %	451945577
85	NC_020303	CTGG	2	8	45250	45257	0 %	25 %	50 %	25 %	451945577
86	NC_020303	AGCC	2	8	45893	45900	25 %	0 %	25 %	50 %	451945577
87	NC_020303	GGTG	2	8	46181	46188	0 %	25 %	75 %	0 %	451945578
88	NC_020303	GACT	2	8	46594	46601	25 %	25 %	25 %	25 %	451945578
89	NC_020303	GGTG	2	8	46679	46686	0 %	25 %	75 %	0 %	451945578
90	NC_020303	CGGG	2	8	46834	46841	0 %	0 %	75 %	25 %	451945578
91	NC_020303	CGGG	2	8	47251	47258	0 %	0 %	75 %	25 %	451945579
92	NC_020303	GGGC	2	8	47578	47585	0 %	0 %	75 %	25 %	451945579
93	NC_020303	GCAG	2	8	47649	47656	25 %	0 %	50 %	25 %	451945579
94	NC_020303	ACCT	2	8	47993	48000	25 %	25 %	0 %	50 %	451945579
95	NC_020303	GGTT	2	8	48736	48743	0 %	50 %	50 %	0 %	451945580
96	NC_020303	CCGG	2	8	48935	48942	0 %	0 %	50 %	50 %	451945580
97	NC_020303	GCGG	2	8	49158	49165	0 %	0 %	75 %	25 %	451945580
98	NC_020303	CTGG	2	8	49431	49438	0 %	25 %	50 %	25 %	451945580
99	NC_020303	CACC	2	8	49539	49546	25 %	0 %	0 %	75 %	451945580
100	NC_020303	GACG	2	8	49575	49582	25 %	0 %	50 %	25 %	451945580
101	NC_020303	CCGA	2	8	50107	50114	25 %	0 %	25 %	50 %	451945580
102	NC_020303	CACC	2	8	50208	50215	25 %	0 %	0 %	75 %	451945580
103	NC_020303	GGGA	2	8	51359	51366	25 %	0 %	75 %	0 %	451945581
104	NC_020303	CCGG	2	8	51691	51698	0 %	0 %	50 %	50 %	451945581
105	NC_020303	GACC	2	8	52624	52631	25 %	0 %	25 %	50 %	451945582
106	NC_020303	CAAG	2	8	52677	52684	50 %	0 %	25 %	25 %	451945582
107	NC_020303	ACCG	2	8	53131	53138	25 %	0 %	25 %	50 %	451945583
108	NC_020303	GCTG	2	8	55248	55255	0 %	25 %	50 %	25 %	451945584
109	NC_020303	CGCC	2	8	56000	56007	0 %	0 %	25 %	75 %	451945585
110	NC_020303	TCGG	2	8	56559	56566	0 %	25 %	50 %	25 %	451945585
111	NC_020303	CGGG	2	8	56914	56921	0 %	0 %	75 %	25 %	451945586
112	NC_020303	GGCT	2	8	58314	58321	0 %	25 %	50 %	25 %	451945587
113	NC_020303	GCCC	2	8	59452	59459	0 %	0 %	25 %	75 %	451945588
114	NC_020303	GGCG	2	8	60222	60229	0 %	0 %	75 %	25 %	451945589
115	NC_020303	GTGG	2	8	60259	60266	0 %	25 %	75 %	0 %	451945589
116	NC_020303	GCCG	2	8	61192	61199	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
117	NC_020303	CGGC	2	8	61557	61564	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
118	NC_020303	CCGG	2	8	61835	61842	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
119	NC_020303	GGCG	2	8	64105	64112	0 %	0 %	75 %	25 %	451945593
120	NC_020303	CAGG	2	8	64286	64293	25 %	0 %	50 %	25 %	451945593
121	NC_020303	TTCG	2	8	66031	66038	0 %	50 %	25 %	25 %	451945595
122	NC_020303	TCGG	2	8	66250	66257	0 %	25 %	50 %	25 %	451945595
123	NC_020303	CCCA	2	8	66910	66917	25 %	0 %	0 %	75 %	451945595
124	NC_020303	CACC	2	8	67282	67289	25 %	0 %	0 %	75 %	451945595
125	NC_020303	GCCA	2	8	67307	67314	25 %	0 %	25 %	50 %	451945595
126	NC_020303	GTAG	2	8	67949	67956	25 %	25 %	50 %	0 %	451945596
127	NC_020303	GGGC	2	8	68042	68049	0 %	0 %	75 %	25 %	451945596
128	NC_020303	GGTT	2	8	68075	68082	0 %	50 %	50 %	0 %	451945596
129	NC_020303	CATA	2	8	68207	68214	50 %	25 %	0 %	25 %	451945596
130	NC_020303	GCAC	2	8	68422	68429	25 %	0 %	25 %	50 %	451945596
131	NC_020303	CGGT	2	8	68755	68762	0 %	25 %	50 %	25 %	451945597
132	NC_020303	GCCG	2	8	69258	69265	0 %	0 %	50 %	50 %	451945597
133	NC_020303	CAGC	2	8	70254	70261	25 %	0 %	25 %	50 %	451945597
134	NC_020303	CAGC	2	8	70546	70553	25 %	0 %	25 %	50 %	451945598
135	NC_020303	GGTC	2	8	70699	70706	0 %	25 %	50 %	25 %	451945598
136	NC_020303	CCAG	2	8	70758	70765	25 %	0 %	25 %	50 %	451945598
137	NC_020303	AGGG	2	8	71623	71630	25 %	0 %	75 %	0 %	451945599
138	NC_020303	GGAC	2	8	72564	72571	25 %	0 %	50 %	25 %	451945600
139	NC_020303	ATCC	2	8	72815	72822	25 %	25 %	0 %	50 %	451945600
140	NC_020303	CCAG	2	8	72919	72926	25 %	0 %	25 %	50 %	451945600
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.