MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	ACC	2	6	151	156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020303	ACA	2	6	860	865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020303	TCG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020303	AGG	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020303	CAT	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020303	CTA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020303	CGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020303	TCC	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020303	GCT	2	6	1084	1089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020303	CAT	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020303	ACC	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020303	GGC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020303	ACC	2	6	2236	2241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020303	ACC	2	6	2267	2272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020303	ACC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020303	ACC	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_020303	ACC	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_020303	TCT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020303	GCT	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020303	ACA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020303	CTC	2	6	2558	2563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020303	CAG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020303	GAC	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020303	AAG	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020303	GAG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020303	CAC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_020303	AGG	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020303	CCA	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020303	CGT	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020303	TCG	3	9	2727	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020303	CCG	3	9	2742	2750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020303	ACC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020303	CTG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020303	GAG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020303	CCG	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020303	CTT	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020303	TGG	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020303	GTG	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020303	CGA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020303	CCG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020303	CAT	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020303	GAA	2	6	4233	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020303	ATG	2	6	4304	4309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020303	TGA	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020303	GCG	2	6	9199	9204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020303	CCT	2	6	9208	9213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020303	GAC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020303	GTG	2	6	10264	10269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020303	AGG	2	6	11268	11273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020303	TGG	2	6	11288	11293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020303	AGA	2	6	12642	12647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020303	ATG	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020303	TCT	2	6	12690	12695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020303	GCA	2	6	13424	13429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020303	GGA	2	6	13634	13639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020303	AAC	2	6	13728	13733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020303	CAT	2	6	13855	13860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020303	ATT	2	6	14003	14008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020303	CAG	2	6	14043	14048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020303	CAC	2	6	14059	14064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020303	CGG	2	6	14097	14102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020303	ATG	2	6	14108	14113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020303	CGG	2	6	14130	14135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020303	ATG	2	6	14170	14175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020303	TCT	2	6	14185	14190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020303	GCC	2	6	14627	14632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_020303	AGC	2	6	14668	14673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020303	GTA	2	6	14730	14735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020303	CGT	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020303	ACC	2	6	15038	15043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020303	CGT	2	6	15049	15054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020303	ATG	2	6	15131	15136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020303	ACG	2	6	15282	15287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020303	TGG	2	6	17817	17822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020303	CAG	2	6	17838	17843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020303	GGT	2	6	17890	17895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020303	GCA	2	6	18017	18022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020303	TGC	2	6	18060	18065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020303	GGA	2	6	18188	18193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020303	GGT	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020303	ACC	2	6	18251	18256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020303	ACC	2	6	18265	18270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020303	ACC	2	6	18279	18284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020303	ACT	2	6	18897	18902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020303	AGT	2	6	18918	18923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020303	TGG	2	6	18959	18964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020303	CCA	2	6	19907	19912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020303	GAC	2	6	20005	20010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020303	GAT	2	6	20048	20053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020303	CTA	2	6	20228	20233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020303	GTG	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020303	TGG	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020303	GAG	2	6	21745	21750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020303	CGT	2	6	22072	22077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020303	GCT	2	6	22104	22109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020303	TCA	2	6	22135	22140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020303	CGT	2	6	22510	22515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020303	AAT	2	6	22576	22581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020303	GTA	2	6	22615	22620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020303	TCA	2	6	22688	22693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020303	GCA	2	6	24142	24147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020303	CCT	2	6	26120	26125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020303	GCT	2	6	26193	26198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020303	GCA	2	6	26330	26335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020303	GAG	2	6	26350	26355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020303	TCC	2	6	26403	26408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020303	CAT	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020303	GGT	2	6	28215	28220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020303	GCC	2	6	28310	28315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020303	TCT	2	6	28449	28454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020303	CTT	3	9	28456	28464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020303	CGC	2	6	28467	28472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020303	CTG	2	6	28485	28490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020303	GAG	2	6	29486	29491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020303	GTA	2	6	29499	29504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020303	CTG	2	6	29514	29519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020303	CGA	2	6	29524	29529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020303	TGA	2	6	29573	29578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020303	CGC	2	6	29706	29711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_020303	TGG	2	6	29773	29778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020303	CAC	2	6	29798	29803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020303	ATG	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020303	GCG	2	6	29905	29910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020303	GCC	2	6	29955	29960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020303	AAG	2	6	30069	30074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020303	GCG	2	6	30107	30112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020303	TGG	3	9	30116	30124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020303	GGT	2	6	31001	31006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020303	TCC	2	6	32131	32136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020303	CTT	2	6	32141	32146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020303	TGC	2	6	32179	32184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020303	ACT	2	6	32256	32261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020303	GTG	2	6	32320	32325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020303	GTG	2	6	32351	32356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020303	CGG	2	6	32394	32399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020303	ATC	2	6	32471	32476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020303	CCA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020303	CGG	2	6	32609	32614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020303	CGT	2	6	32632	32637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020303	CGG	2	6	32753	32758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020303	GCG	2	6	33022	33027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020303	TGG	2	6	33181	33186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020303	CCG	2	6	33220	33225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_020303	GAA	2	6	33269	33274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020303	GAG	2	6	33375	33380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020303	GTT	2	6	33404	33409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020303	GAT	2	6	33531	33536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020303	AAG	2	6	33667	33672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_020303	ACC	2	6	33884	33889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_020303	GCC	2	6	34481	34486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_020303	CCG	2	6	34510	34515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_020303	GCG	2	6	38805	38810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_020303	GAA	2	6	38845	38850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020303	CAG	2	6	38854	38859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_020303	GGC	2	6	38912	38917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_020303	AAC	2	6	41130	41135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_020303	TCG	2	6	41466	41471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_020303	TCG	2	6	42597	42602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_020303	CGT	2	6	42604	42609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_020303	CGC	2	6	44255	44260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_020303	CAC	2	6	50359	50364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_020303	CAG	3	9	50806	50814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_020303	GCA	2	6	81337	81342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_020303	ACC	2	6	81719	81724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_020303	TCA	2	6	81776	81781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_020303	CGC	2	6	81858	81863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_020303	AAG	2	6	81981	81986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020303	TGT	2	6	82031	82036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.