MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020303	TC	3	6	501	506	0 %	50 %	0 %	50 %	451945537
2	NC_020303	CG	3	6	892	897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020303	TC	3	6	4688	4693	0 %	50 %	0 %	50 %	451945540
4	NC_020303	GT	3	6	5651	5656	0 %	50 %	50 %	0 %	451945540
5	NC_020303	TG	3	6	5796	5801	0 %	50 %	50 %	0 %	451945540
6	NC_020303	GT	3	6	7776	7781	0 %	50 %	50 %	0 %	451945542
7	NC_020303	GA	3	6	7931	7936	50 %	0 %	50 %	0 %	451945543
8	NC_020303	GA	3	6	8237	8242	50 %	0 %	50 %	0 %	451945543
9	NC_020303	CA	3	6	9718	9723	50 %	0 %	0 %	50 %	451945545
10	NC_020303	GA	3	6	9724	9729	50 %	0 %	50 %	0 %	451945545
11	NC_020303	GC	3	6	10319	10324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020303	GA	3	6	10718	10723	50 %	0 %	50 %	0 %	451945546
13	NC_020303	CG	3	6	10866	10871	0 %	0 %	50 %	50 %	451945546
14	NC_020303	GA	3	6	11331	11336	50 %	0 %	50 %	0 %	451945547
15	NC_020303	GA	3	6	11637	11642	50 %	0 %	50 %	0 %	451945547
16	NC_020303	CT	3	6	12605	12610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020303	CG	3	6	13006	13011	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
18	NC_020303	CG	3	6	13228	13233	0 %	0 %	50 %	50 %	451945549
19	NC_020303	CT	3	6	13809	13814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020303	TG	3	6	14968	14973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020303	GC	3	6	15506	15511	0 %	0 %	50 %	50 %	451945551
22	NC_020303	CG	3	6	16426	16431	0 %	0 %	50 %	50 %	451945551
23	NC_020303	GA	3	6	17442	17447	50 %	0 %	50 %	0 %	451945552
24	NC_020303	CG	3	6	18491	18496	0 %	0 %	50 %	50 %	451945553
25	NC_020303	GT	3	6	19057	19062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020303	GA	3	6	20441	20446	50 %	0 %	50 %	0 %	451945555
27	NC_020303	GA	3	6	20747	20752	50 %	0 %	50 %	0 %	451945555
28	NC_020303	AT	3	6	21955	21960	50 %	50 %	0 %	0 %	451945557
29	NC_020303	CG	3	6	25471	25476	0 %	0 %	50 %	50 %	451945561
30	NC_020303	GA	3	6	26100	26105	50 %	0 %	50 %	0 %	451945561
31	NC_020303	CA	3	6	28186	28191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020303	TG	3	6	29518	29523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020303	CG	3	6	29737	29742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020303	GC	3	6	29836	29841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020303	GC	3	6	31020	31025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020303	AC	3	6	32661	32666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020303	CA	3	6	33278	33283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020303	CG	3	6	34391	34396	0 %	0 %	50 %	50 %	451945567
39	NC_020303	GC	4	8	35616	35623	0 %	0 %	50 %	50 %	451945569
40	NC_020303	GC	3	6	36761	36766	0 %	0 %	50 %	50 %	451945569
41	NC_020303	AC	3	6	37994	37999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020303	CG	3	6	39178	39183	0 %	0 %	50 %	50 %	451945572
43	NC_020303	CA	3	6	40328	40333	50 %	0 %	0 %	50 %	451945572
44	NC_020303	GC	3	6	40458	40463	0 %	0 %	50 %	50 %	451945572
45	NC_020303	GA	3	6	40963	40968	50 %	0 %	50 %	0 %	451945572
46	NC_020303	CG	3	6	41218	41223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020303	CT	3	6	43449	43454	0 %	50 %	0 %	50 %	451945576
48	NC_020303	TG	3	6	44082	44087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020303	GT	3	6	44239	44244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020303	CG	3	6	44824	44829	0 %	0 %	50 %	50 %	451945577
51	NC_020303	AC	3	6	46879	46884	50 %	0 %	0 %	50 %	451945578
52	NC_020303	GC	3	6	47123	47128	0 %	0 %	50 %	50 %	451945579
53	NC_020303	CT	3	6	47717	47722	0 %	50 %	0 %	50 %	451945579
54	NC_020303	GC	3	6	48174	48179	0 %	0 %	50 %	50 %	451945579
55	NC_020303	GC	3	6	48419	48424	0 %	0 %	50 %	50 %	451945579
56	NC_020303	AC	3	6	48541	48546	50 %	0 %	0 %	50 %	451945579
57	NC_020303	CG	3	6	49837	49842	0 %	0 %	50 %	50 %	451945580
58	NC_020303	CG	3	6	50437	50442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020303	AC	3	6	55180	55185	50 %	0 %	0 %	50 %	451945584
60	NC_020303	CA	3	6	60070	60075	50 %	0 %	0 %	50 %	451945589
61	NC_020303	GC	3	6	62373	62378	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
62	NC_020303	CA	3	6	63307	63312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020303	TA	3	6	63654	63659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020303	GT	4	8	64388	64395	0 %	50 %	50 %	0 %	451945593
65	NC_020303	CG	3	6	65246	65251	0 %	0 %	50 %	50 %	451945594
66	NC_020303	AT	3	6	65814	65819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020303	GC	3	6	65980	65985	0 %	0 %	50 %	50 %	451945595
68	NC_020303	CG	3	6	66570	66575	0 %	0 %	50 %	50 %	451945595
69	NC_020303	CG	3	6	66700	66705	0 %	0 %	50 %	50 %	451945595
70	NC_020303	AT	3	6	67475	67480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020303	CG	3	6	67699	67704	0 %	0 %	50 %	50 %	451945596
72	NC_020303	AG	3	6	67999	68004	50 %	0 %	50 %	0 %	451945596
73	NC_020303	CA	3	6	68128	68133	50 %	0 %	0 %	50 %	451945596
74	NC_020303	CG	4	8	75557	75564	0 %	0 %	50 %	50 %	451945603
75	NC_020303	AC	3	6	75675	75680	50 %	0 %	0 %	50 %	451945603
76	NC_020303	GC	3	6	76595	76600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020303	GC	3	6	77465	77470	0 %	0 %	50 %	50 %	451945605
78	NC_020303	GC	3	6	78136	78141	0 %	0 %	50 %	50 %	451945605
79	NC_020303	CG	3	6	78528	78533	0 %	0 %	50 %	50 %	451945605
80	NC_020303	GA	3	6	79365	79370	50 %	0 %	50 %	0 %	451945606
81	NC_020303	GA	3	6	80612	80617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020303	AG	3	6	80654	80659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020303	GT	3	6	80748	80753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020303	GC	3	6	81658	81663	0 %	0 %	50 %	50 %	451945609
85	NC_020303	CG	3	6	81903	81908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020303	GC	3	6	82244	82249	0 %	0 %	50 %	50 %	451945610
87	NC_020303	GA	3	6	82726	82731	50 %	0 %	50 %	0 %	451945610
88	NC_020303	AC	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	451945610
89	NC_020303	CG	3	6	83401	83406	0 %	0 %	50 %	50 %	451945610
90	NC_020303	CT	3	6	85876	85881	0 %	50 %	0 %	50 %	451945610

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.