MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella australis Aust/NH1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020300	TAAAAA	2	12	3315	3326	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020300	TCGTTT	2	12	15563	15574	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020300	TAAAAT	2	12	16411	16422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020300	AGTTTT	2	12	47190	47201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020300	CTATTT	2	12	58769	58780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020300	TTAATT	2	12	59530	59541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020300	ATCAAT	2	12	64825	64836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020300	AAATAT	2	12	73693	73704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020300	TAAATA	2	12	95196	95207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020300	GATAAA	2	12	126879	126890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020300	GCTTTT	2	12	162143	162154	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020300	CGATAA	2	12	187989	188000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020300	TTATTG	2	12	214639	214650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020300	AAAATA	2	12	228734	228745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020300	TAGCAC	2	12	231173	231184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020300	GAATTT	2	12	233077	233088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020300	AAAATA	2	12	236335	236346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020300	CTTGAG	2	12	240082	240093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020300	CTTAAG	2	12	260103	260114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020300	CGTCTT	2	12	282146	282157	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020300	AAGAGC	2	12	287570	287581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020300	AAGTAA	2	12	296615	296626	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020300	GTGTTT	2	12	318692	318703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020300	TAGAGT	2	12	345142	345153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020300	AAATAA	2	12	346298	346309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020300	TTATAT	2	12	366778	366789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020300	CGTATA	2	12	386599	386610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020300	TTCTTT	2	12	386804	386815	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020300	AAAAGT	2	12	402205	402216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020300	AAAATG	2	12	405836	405847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020300	GGAAGT	2	12	411584	411595	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020300	CTAAGT	2	12	414429	414440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020300	ATAGAA	2	12	414764	414775	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020300	ATATGT	2	12	427231	427242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020300	GAAGAG	2	12	471596	471607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020300	GAATAG	2	12	473636	473647	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020300	GAAAAT	2	12	484032	484043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020300	TGTTAA	2	12	488306	488317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020300	GAAAAA	2	12	489281	489292	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020300	ACCCCA	2	12	504540	504551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020300	GTCTTT	2	12	522517	522528	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020300	GTATTT	2	12	587935	587946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020300	TGTTTT	2	12	596127	596138	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020300	GTATAT	2	12	607168	607179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020300	GTGGGC	2	12	650075	650086	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020300	TCGGAG	2	12	657256	657267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020300	CGTTCA	2	12	659920	659931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020300	GTTTGT	2	12	671293	671304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020300	CTTACA	2	12	675447	675458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020300	TTTATT	2	12	742292	742303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020300	AAGTGG	2	12	759662	759673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020300	TAAATA	2	12	761634	761645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020300	GAAAAA	2	12	770046	770057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020300	ATTGTT	2	12	811979	811990	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020300	CTCAAT	2	12	812086	812097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020300	AAAAAT	2	12	820851	820862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020300	AGTTTT	2	12	827417	827428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020300	ATATAA	2	12	850844	850855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020300	GAAAAA	2	12	871753	871764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020300	CAAAAA	2	12	882128	882139	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020300	ATAAAA	2	12	890958	890969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020300	CTAAAC	2	12	937430	937441	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020300	ATAAAA	2	12	942519	942530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020300	TATTGA	2	12	957422	957433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020300	GAAAAT	2	12	984521	984532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020300	AAAATT	2	12	993246	993257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020300	TTGAAG	2	12	995894	995905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020300	AAAACT	2	12	1000748	1000759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020300	TTTTTC	2	12	1012725	1012736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020300	CAATAT	2	12	1021366	1021377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020300	GAATCA	2	12	1052659	1052670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020300	CTTTTT	2	12	1079098	1079109	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020300	CAAAAA	2	12	1106999	1107010	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020300	TAAAAG	2	12	1110437	1110448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020300	TATCAT	2	12	1114352	1114363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020300	TAAAAA	2	12	1125249	1125260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020300	AAAAAC	2	12	1126683	1126694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020300	TTTAAA	2	12	1139599	1139610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020300	CTTTTT	2	12	1141414	1141425	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020300	CAAAAA	2	12	1141460	1141471	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020300	CAAAAA	2	12	1142805	1142816	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020300	TTTTGT	2	12	1146077	1146088	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020300	AACCAG	2	12	1160145	1160156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020300	CAAAAA	2	12	1169696	1169707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020300	AAGACG	2	12	1186810	1186821	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020300	AGAAAG	2	12	1220635	1220646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020300	CCTGTG	2	12	1224319	1224330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020300	AAAATA	2	12	1230674	1230685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020300	TAGAAA	2	12	1235032	1235043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020300	AAACAA	2	12	1245062	1245073	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020300	TCGCTT	2	12	1247963	1247974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020300	ACAAAA	2	12	1266781	1266792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020300	AAGGAA	2	12	1306886	1306897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020300	GATACA	2	12	1313926	1313937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020300	TTTAAA	2	12	1322295	1322306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020300	GCTGCA	2	12	1330380	1330391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020300	AAACAA	2	12	1349947	1349958	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020300	TCGCTT	2	12	1352847	1352858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020300	AAGAGA	2	12	1359061	1359072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020300	AAAATC	2	12	1382646	1382657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020300	CTCCTT	2	12	1389403	1389414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020300	TTTTAC	2	12	1404081	1404092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020300	TGCTGG	2	12	1457077	1457088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020300	GAGAAA	2	12	1514822	1514833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020300	AATAAA	2	12	1530442	1530453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020300	GCGGGG	2	12	1539190	1539201	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020300	ATTTTA	2	12	1540627	1540638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020300	TTTAGA	2	12	1542208	1542219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.