MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020299	TTTATA	2	12	8409	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020299	ATTGTT	2	12	17697	17708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020299	TACAAT	2	12	17758	17769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020299	TAAAAA	2	12	111234	111245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020299	TAAAAT	2	12	134508	134519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020299	TCGGGG	2	12	167717	167728	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020299	TTTAAT	2	12	172701	172712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020299	ACTTAT	2	12	183764	183775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020299	AAGCTA	2	12	202847	202858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020299	TTCTCC	2	12	213345	213356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020299	TTTACA	2	12	214591	214602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020299	AGACAA	2	12	219083	219094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020299	AACTAT	2	12	256466	256477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020299	TTATTT	2	12	261219	261230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020299	GGTTAT	2	12	268465	268476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020299	TTTATT	2	12	268827	268838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020299	TATCTA	2	12	268920	268931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020299	TCATAT	2	12	274911	274922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020299	TATTCA	2	12	292438	292449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020299	ATTTAA	2	12	298835	298846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020299	TTTATT	2	12	308147	308158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020299	TTTTGA	2	12	343129	343140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020299	TTTTTA	2	12	345259	345270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020299	AGTTTG	2	12	356943	356954	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020299	ATAAAA	2	12	390780	390791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020299	AGTATT	2	12	396272	396283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020299	TTTTAT	2	12	400398	400409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020299	AAAAAT	2	12	402225	402236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020299	TTTCTT	2	12	405307	405318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020299	AAATAA	2	12	405528	405539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020299	ATAACC	2	12	412580	412591	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020299	ATCTTT	2	12	417230	417241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020299	AAAATG	2	12	417355	417366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020299	CAAATA	2	12	417380	417391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020299	ATTTAA	2	12	433021	433032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020299	ATTAAT	2	12	448741	448752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020299	CATATT	2	12	449038	449049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020299	AAATTT	2	12	471491	471502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020299	TGTATA	2	12	471546	471557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020299	ACTAAC	2	12	491157	491168	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020299	TAAATA	2	12	502264	502275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020299	AAATAA	2	12	557046	557057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020299	TATAAA	2	12	563256	563267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020299	ATTTAT	2	12	579301	579312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020299	AAACAA	2	12	581810	581821	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020299	TATTTT	2	12	582934	582945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020299	TTAAAA	2	12	585512	585523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020299	TAACAA	2	12	597246	597257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020299	GTAAAG	2	12	610816	610827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020299	ATAAAA	2	12	617246	617257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020299	ACAATA	2	12	621490	621501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020299	CAATAA	2	12	621747	621758	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020299	TATGTT	2	12	622120	622131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020299	AAAATC	2	12	634398	634409	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020299	TAAAAA	2	12	689915	689926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020299	ATAGAT	2	12	734850	734861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020299	ATATTT	2	12	734921	734932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020299	ATATTA	2	12	741217	741228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020299	ATATCG	2	12	752402	752413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020299	ATTTAT	2	12	752693	752704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020299	CATAGA	2	12	762630	762641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020299	AAACAA	2	12	784456	784467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020299	TCATTA	2	12	805879	805890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.