MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020299	TTTTTC	2	12	3267	3278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451936137
2	NC_020299	CTGATG	2	12	4121	4132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936137
3	NC_020299	AATTAG	2	12	4590	4601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451936137
4	NC_020299	ATATTT	2	12	10818	10829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451936142
5	NC_020299	TAAATC	2	12	11444	11455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451936142
6	NC_020299	AATTCT	2	12	13409	13420	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451936143
7	NC_020299	GTTTTT	2	12	14391	14402	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451936144
8	NC_020299	TACTTT	2	12	17334	17345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936147
9	NC_020299	TTTCTA	2	12	17786	17797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936148
10	NC_020299	TGCGTT	2	12	18278	18289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451936148
11	NC_020299	ATTTTA	2	12	21908	21919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451936154
12	NC_020299	GGTGAT	2	12	23375	23386	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451936156
13	NC_020299	AAATCT	2	12	24195	24206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451936157
14	NC_020299	TTTTAT	2	12	26256	26267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936159
15	NC_020299	GTTACT	2	12	26521	26532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451936159
16	NC_020299	TAAATT	2	12	27908	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	451936160
17	NC_020299	TTACAC	2	12	34190	34201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451936168
18	NC_020299	TCTAGC	2	12	34599	34610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451936168
19	NC_020299	GGATCT	2	12	38185	38196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936169
20	NC_020299	TATAGC	2	12	43136	43147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936174
21	NC_020299	CAAAAT	2	12	48227	48238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451936176
22	NC_020299	AATAAA	2	12	51426	51437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936179
23	NC_020299	TTTGCT	2	12	52072	52083	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451936180
24	NC_020299	TACCAT	2	12	59303	59314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451936188
25	NC_020299	TGCATC	2	12	61574	61585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451936189
26	NC_020299	AATATT	2	12	61940	61951	50 %	50 %	0 %	0 %	451936189
27	NC_020299	GGAGAT	2	12	64573	64584	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451936191
28	NC_020299	TGCATT	2	12	71317	71328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451936198
29	NC_020299	ATGCGT	2	12	73281	73292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936200
30	NC_020299	CTTATT	2	12	89773	89784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936212
31	NC_020299	AAATGA	2	12	91892	91903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936214
32	NC_020299	AAAAAT	2	12	94676	94687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936215
33	NC_020299	TATAGT	2	12	100562	100573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451936219
34	NC_020299	TTTATT	2	12	103903	103914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936222
35	NC_020299	TAGAGC	2	12	107028	107039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451936225
36	NC_020299	TGATTT	2	12	108742	108753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451936227
37	NC_020299	CTGTTG	2	12	112686	112697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451936231
38	NC_020299	TGGCAT	2	12	119988	119999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936237
39	NC_020299	TATTTC	2	12	123657	123668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936241
40	NC_020299	TTTGTA	2	12	130567	130578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451936247
41	NC_020299	AATTGC	2	12	133687	133698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936250
42	NC_020299	ATGTTG	2	12	136896	136907	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451936252
43	NC_020299	GCTATA	2	12	141271	141282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936255
44	NC_020299	TGCTGG	2	12	142886	142897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451936257
45	NC_020299	GATCCA	2	12	143324	143335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451936258
46	NC_020299	GCTGAT	2	12	144504	144515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936259
47	NC_020299	ATACTG	2	12	145810	145821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936260
48	NC_020299	ATAAAA	2	12	146994	147005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936261
49	NC_020299	TTTTAT	2	12	154428	154439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936264
50	NC_020299	TACACA	2	12	162947	162958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451936272
51	NC_020299	AATGAA	2	12	164405	164416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936272
52	NC_020299	AGGTTT	2	12	165245	165256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451936273
53	NC_020299	TTATAA	2	12	165846	165857	50 %	50 %	0 %	0 %	451936274
54	NC_020299	TTTTTA	2	12	169083	169094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936276
55	NC_020299	TTTCTG	2	12	171890	171901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451936277
56	NC_020299	TAAATT	2	12	175084	175095	50 %	50 %	0 %	0 %	451936279
57	NC_020299	GTATCT	2	12	178465	178476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451936282
58	NC_020299	AAATAA	2	12	179115	179126	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936282
59	NC_020299	ATCTCC	2	12	179675	179686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451936283
60	NC_020299	GCTATT	2	12	180725	180736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451936284
61	NC_020299	TTTTAT	2	12	191824	191835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936290
62	NC_020299	TATTTC	2	12	193641	193652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936291
63	NC_020299	TTAGCT	2	12	197696	197707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451936295
64	NC_020299	TTTTTC	2	12	202988	202999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451936300
65	NC_020299	GATTTT	2	12	203103	203114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451936300
66	NC_020299	TGATGG	2	12	203549	203560	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451936300
67	NC_020299	GAGAAA	2	12	205745	205756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451936301
68	NC_020299	CCATTG	2	12	209192	209203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451936304
69	NC_020299	ATCGTG	2	12	215932	215943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936308
70	NC_020299	AAGAGG	2	12	216169	216180	50 %	0 %	50 %	0 %	451936308
71	NC_020299	GCGTAA	2	12	220346	220357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451936309
72	NC_020299	TAATTG	2	12	233087	233098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451936316
73	NC_020299	GGTATT	2	12	234957	234968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451936318
74	NC_020299	TGTTGA	2	12	237534	237545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451936320
75	NC_020299	TGATAT	2	12	239880	239891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451936323
76	NC_020299	TATCTA	2	12	244097	244108	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451936327
77	NC_020299	AGCATT	2	12	244380	244391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936327
78	NC_020299	GTCAAG	2	12	245273	245284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451936327
79	NC_020299	TTTTAT	2	12	254546	254557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936337
80	NC_020299	TATTAA	2	12	255625	255636	50 %	50 %	0 %	0 %	451936338
81	NC_020299	TTAATA	2	12	256092	256103	50 %	50 %	0 %	0 %	451936339
82	NC_020299	TATATC	2	12	258252	258263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451936340
83	NC_020299	AGCACA	2	12	263819	263830	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451936343
84	NC_020299	GAATCT	2	12	267658	267669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936347
85	NC_020299	TTCTTT	2	12	269585	269596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451936349
86	NC_020299	AATAAA	2	12	269889	269900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936349
87	NC_020299	AATATT	2	12	272814	272825	50 %	50 %	0 %	0 %	451936352
88	NC_020299	ATAAAT	2	12	273378	273389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451936352
89	NC_020299	TAATGG	2	12	280740	280751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451936358
90	NC_020299	TGTGGT	2	12	281298	281309	0 %	50 %	50 %	0 %	451936359
91	NC_020299	TAGATT	2	12	290103	290114	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451936369
92	NC_020299	ATTTCA	2	12	290523	290534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451936369
93	NC_020299	AATATA	2	12	292142	292153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451936371
94	NC_020299	TTAAAT	2	12	292563	292574	50 %	50 %	0 %	0 %	451936372
95	NC_020299	TAAAGA	2	12	297689	297700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936376
96	NC_020299	GTTTAT	2	12	299617	299628	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451936377
97	NC_020299	TGGATC	2	12	302310	302321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451936381
98	NC_020299	TAATTT	2	12	303963	303974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451936382
99	NC_020299	ATTTTT	2	12	304445	304456	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936384
100	NC_020299	CATAAT	2	12	304546	304557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451936384
101	NC_020299	TCTATT	2	12	304731	304742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451936384
102	NC_020299	ATTGAT	2	12	304938	304949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451936384
103	NC_020299	TATTAA	2	12	307210	307221	50 %	50 %	0 %	0 %	451936386
104	NC_020299	AAAGAT	2	12	309088	309099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936388
105	NC_020299	ATAAAA	2	12	320055	320066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936399
106	NC_020299	AATGGA	2	12	322844	322855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451936403
107	NC_020299	TAAAGA	2	12	327729	327740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936405
108	NC_020299	GAATAA	2	12	330938	330949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936407
109	NC_020299	TCAATA	2	12	333171	333182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451936409
110	NC_020299	GTATAG	2	12	338216	338227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451936413
111	NC_020299	AATATA	2	12	339838	339849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451936413
112	NC_020299	GCAATA	2	12	340100	340111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451936413
113	NC_020299	ATTTTT	2	12	347481	347492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936420
114	NC_020299	TGATAC	2	12	348973	348984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451936422
115	NC_020299	CAGGAA	2	12	349986	349997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451936423
116	NC_020299	TAAAGA	2	12	350751	350762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451936424
117	NC_020299	TTGTAG	2	12	358948	358959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451936432
118	NC_020299	TTATTT	3	18	362328	362345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451936434
119	NC_020299	ATTTAT	2	12	362348	362359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451936434
120	NC_020299	TTCTTT	2	12	362382	362393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451936434
121	NC_020299	ATTCCC	2	12	368434	368445	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451936442
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230	NC_020299	AAAATA	2	12	605607	605618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451936640
231	NC_020299	AGATGC	2	12	607190	607201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451936641
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234	NC_020299	CTACAG	2	12	608827	608838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451936642
235	NC_020299	GCATCA	2	12	609842	609853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451936643
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.