MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020299	TAAA	2	8	8383	8390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020299	ATCA	2	8	8481	8488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020299	ATTT	2	8	14074	14081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020299	TGAT	2	8	14245	14252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020299	TTTA	2	8	16283	16290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020299	ATGT	2	8	16481	16488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020299	TTAA	2	8	32283	32290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020299	TAGT	2	8	32519	32526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020299	TTTA	2	8	33436	33443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020299	TTTA	2	8	33463	33470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020299	TATT	2	8	36151	36158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020299	ACTA	2	8	36344	36351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020299	TTAT	2	8	36621	36628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020299	TTAT	2	8	36892	36899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020299	TTGT	2	8	38484	38491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020299	AATT	2	8	38547	38554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020299	TATT	2	8	38617	38624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020299	AAAT	2	8	44692	44699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020299	TATT	2	8	45955	45962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020299	GATA	2	8	46687	46694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020299	ATCT	2	8	46855	46862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020299	TTTA	2	8	49165	49172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020299	TGTT	2	8	49249	49256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020299	ATAA	2	8	49286	49293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020299	GTTT	2	8	49388	49395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020299	TGAT	2	8	49452	49459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020299	TATT	2	8	49584	49591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020299	ATTA	2	8	49760	49767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020299	TTAA	2	8	49922	49929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020299	ATAA	2	8	50155	50162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020299	AGGC	2	8	50213	50220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020299	TCTT	2	8	50248	50255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020299	TGAT	2	8	50336	50343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020299	ATTT	2	8	50351	50358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020299	TATT	2	8	51831	51838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020299	ATTA	2	8	58975	58982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020299	TTAT	2	8	62001	62008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020299	TGCT	2	8	67942	67949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020299	TAAA	2	8	75193	75200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020299	AAAT	2	8	76785	76792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020299	TTAT	2	8	76795	76802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020299	TAAT	2	8	79731	79738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020299	TTAC	2	8	83863	83870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020299	AATT	2	8	83910	83917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020299	ATAA	2	8	97061	97068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020299	ATTT	2	8	101451	101458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020299	ATTA	2	8	102160	102167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020299	AAAT	2	8	102209	102216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020299	AATT	2	8	102223	102230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020299	TTGT	2	8	102378	102385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020299	CTGT	2	8	102389	102396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020299	TAAT	2	8	104700	104707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020299	ATAA	2	8	104797	104804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020299	TAAT	2	8	104808	104815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020299	TCCT	2	8	106427	106434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020299	TATT	2	8	108179	108186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020299	AAAT	2	8	112980	112987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020299	AATA	2	8	112994	113001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020299	TATG	2	8	113365	113372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020299	ATTA	2	8	113473	113480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020299	TCAC	2	8	113569	113576	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020299	TTTA	2	8	113648	113655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020299	TTAT	2	8	121046	121053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020299	TATT	2	8	123596	123603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020299	TTTA	2	8	133639	133646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020299	ATTA	2	8	134447	134454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020299	TTAT	2	8	140396	140403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020299	ATAA	2	8	140404	140411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020299	TTAA	2	8	140455	140462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020299	ATTT	2	8	140503	140510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020299	TAAT	2	8	140525	140532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020299	CATA	2	8	140564	140571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020299	TATT	2	8	140579	140586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020299	ATTA	2	8	152482	152489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020299	ATTT	2	8	154762	154769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020299	TAAT	2	8	155391	155398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020299	ATAA	2	8	156426	156433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020299	ATTT	2	8	160965	160972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020299	ATTT	2	8	161100	161107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020299	ATTT	2	8	161698	161705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020299	TAAT	2	8	167380	167387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020299	ATGG	2	8	168934	168941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020299	ATTA	2	8	171644	171651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020299	TTTC	2	8	171805	171812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020299	ATTA	3	12	177229	177240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020299	GTAA	2	8	177887	177894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020299	TAAG	2	8	183450	183457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020299	ATAA	2	8	183721	183728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020299	ATTA	2	8	186095	186102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020299	TTAA	2	8	186130	186137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020299	ATGA	2	8	186888	186895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020299	TACC	2	8	187394	187401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020299	ACTG	2	8	188635	188642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020299	GCGA	2	8	188732	188739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020299	AAAG	2	8	189567	189574	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020299	TTAT	2	8	191406	191413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020299	TAAA	2	8	192730	192737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020299	TATT	2	8	196161	196168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020299	TTAT	2	8	196244	196251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020299	TAAT	2	8	200183	200190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020299	TATT	2	8	202653	202660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020299	GTTT	2	8	202883	202890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020299	GATT	3	12	207624	207635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020299	TATT	2	8	210396	210403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020299	TAAT	2	8	210743	210750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020299	GTTT	2	8	213202	213209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020299	TAGT	2	8	213278	213285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020299	AGAA	2	8	213671	213678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020299	ATCT	2	8	214002	214009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020299	TGAG	2	8	214101	214108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020299	GTAC	2	8	214415	214422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020299	TATC	2	8	214480	214487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020299	TAAT	2	8	214509	214516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020299	ATTT	2	8	214583	214590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020299	ATTA	2	8	218431	218438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020299	TATT	2	8	218541	218548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020299	GCTT	2	8	218691	218698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020299	AAGA	2	8	218958	218965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020299	TTAA	2	8	219137	219144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020299	ATAA	2	8	219314	219321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020299	TTGT	2	8	219354	219361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020299	ATTT	2	8	219408	219415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020299	ATAA	2	8	219768	219775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020299	ATTA	2	8	221420	221427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020299	TTAA	2	8	221455	221462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020299	ATGA	2	8	222213	222220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020299	TACC	2	8	222719	222726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020299	ACTG	2	8	223960	223967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020299	GCGA	2	8	224057	224064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020299	AAAG	2	8	224892	224899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020299	TTAT	2	8	226731	226738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020299	TTTG	2	8	230909	230916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020299	TTAA	2	8	231225	231232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020299	TATT	2	8	234194	234201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020299	TATT	2	8	246027	246034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020299	TAGG	2	8	246055	246062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020299	TTTG	2	8	247162	247169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020299	TTAA	2	8	247177	247184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020299	TTTA	2	8	247197	247204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020299	TTAA	2	8	248429	248436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020299	GCAT	2	8	250198	250205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020299	ATTT	2	8	250268	250275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020299	ATTT	2	8	253901	253908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020299	TAAA	2	8	260324	260331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020299	ATAG	2	8	261421	261428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020299	TATT	2	8	269002	269009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020299	TATT	2	8	272301	272308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020299	TTTA	2	8	272315	272322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020299	TATT	2	8	278715	278722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020299	AATT	2	8	281329	281336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020299	TATT	2	8	286834	286841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_020299	TAAA	2	8	287061	287068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.