MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	CAGTT	2	10	1303	1312	20 %	40 %	20 %	20 %	451816789
2	NC_020297	AAGGT	2	10	1462	1471	40 %	20 %	40 %	0 %	451816789
3	NC_020297	AAACT	2	10	3112	3121	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020297	GCTGA	2	10	4167	4176	20 %	20 %	40 %	20 %	451816792
5	NC_020297	TGCCA	2	10	5502	5511	20 %	20 %	20 %	40 %	451816794
6	NC_020297	TCCAA	2	10	6406	6415	40 %	20 %	0 %	40 %	451816795
7	NC_020297	TGGGC	2	10	7230	7239	0 %	20 %	60 %	20 %	451816795
8	NC_020297	TCAAA	2	10	8485	8494	60 %	20 %	0 %	20 %	451816796
9	NC_020297	TCAAA	2	10	9128	9137	60 %	20 %	0 %	20 %	451816797
10	NC_020297	AGCTG	2	10	9161	9170	20 %	20 %	40 %	20 %	451816797
11	NC_020297	AAAGG	2	10	9875	9884	60 %	0 %	40 %	0 %	451816798
12	NC_020297	CAAAA	2	10	11530	11539	80 %	0 %	0 %	20 %	451816800
13	NC_020297	TTATT	2	10	15086	15095	20 %	80 %	0 %	0 %	451816802
14	NC_020297	AATGT	2	10	16252	16261	40 %	40 %	20 %	0 %	451816802
15	NC_020297	ATCTT	2	10	16654	16663	20 %	60 %	0 %	20 %	451816803
16	NC_020297	AGAAA	2	10	17204	17213	80 %	0 %	20 %	0 %	451816803
17	NC_020297	ACTTA	2	10	18015	18024	40 %	40 %	0 %	20 %	451816803
18	NC_020297	TATTC	2	10	18551	18560	20 %	60 %	0 %	20 %	451816804
19	NC_020297	CCATC	2	10	19203	19212	20 %	20 %	0 %	60 %	451816804
20	NC_020297	AAATT	2	10	19473	19482	60 %	40 %	0 %	0 %	451816804
21	NC_020297	AAATT	2	10	19800	19809	60 %	40 %	0 %	0 %	451816804
22	NC_020297	GGAAG	2	10	19858	19867	40 %	0 %	60 %	0 %	451816804
23	NC_020297	GAGAG	2	10	22379	22388	40 %	0 %	60 %	0 %	451816808
24	NC_020297	ATATA	2	10	22455	22464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020297	TGGTT	2	10	22605	22614	0 %	60 %	40 %	0 %	451816809
26	NC_020297	GAATT	2	10	22623	22632	40 %	40 %	20 %	0 %	451816809
27	NC_020297	AAAGA	2	10	22678	22687	80 %	0 %	20 %	0 %	451816809
28	NC_020297	TAAAT	2	10	22750	22759	60 %	40 %	0 %	0 %	451816809
29	NC_020297	CCTTG	2	10	23089	23098	0 %	40 %	20 %	40 %	451816810
30	NC_020297	CCTGC	2	10	23319	23328	0 %	20 %	20 %	60 %	451816810
31	NC_020297	AGCAA	2	10	24483	24492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020297	GAATT	2	10	24822	24831	40 %	40 %	20 %	0 %	451816813
33	NC_020297	AAAAC	2	10	25271	25280	80 %	0 %	0 %	20 %	451816814
34	NC_020297	TGGGA	2	10	28536	28545	20 %	20 %	60 %	0 %	451816819
35	NC_020297	CGGAT	2	10	28743	28752	20 %	20 %	40 %	20 %	451816819
36	NC_020297	GGGGT	2	10	30422	30431	0 %	20 %	80 %	0 %	451816819
37	NC_020297	AACTG	2	10	31067	31076	40 %	20 %	20 %	20 %	451816819
38	NC_020297	GGCAA	2	10	31784	31793	40 %	0 %	40 %	20 %	451816821
39	NC_020297	TGAAC	2	10	31906	31915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020297	TGGTT	2	10	32305	32314	0 %	60 %	40 %	0 %	451816822
41	NC_020297	CTGAA	2	10	34082	34091	40 %	20 %	20 %	20 %	451816825
42	NC_020297	GGGGA	2	10	34480	34489	20 %	0 %	80 %	0 %	451816826
43	NC_020297	TTTGC	2	10	34734	34743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020297	GATTA	2	10	35784	35793	40 %	40 %	20 %	0 %	451816828
45	NC_020297	TGCCC	2	10	38051	38060	0 %	20 %	20 %	60 %	451816830
46	NC_020297	ATCGT	2	10	38545	38554	20 %	40 %	20 %	20 %	451816830
47	NC_020297	TGATC	2	10	43433	43442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020297	GGAAG	2	10	43674	43683	40 %	0 %	60 %	0 %	451816834
49	NC_020297	CTTAT	2	10	47054	47063	20 %	60 %	0 %	20 %	451816835
50	NC_020297	TTATT	2	10	47491	47500	20 %	80 %	0 %	0 %	451816837
51	NC_020297	AGGTT	2	10	48032	48041	20 %	40 %	40 %	0 %	451816838
52	NC_020297	ACAGG	2	10	48109	48118	40 %	0 %	40 %	20 %	451816838
53	NC_020297	GCTGA	2	10	58885	58894	20 %	20 %	40 %	20 %	451816851
54	NC_020297	TGCCA	2	10	60220	60229	20 %	20 %	20 %	40 %	451816853
55	NC_020297	TCCAA	2	10	61124	61133	40 %	20 %	0 %	40 %	451816854
56	NC_020297	TGGGC	2	10	61948	61957	0 %	20 %	60 %	20 %	451816854
57	NC_020297	TCAAA	2	10	63203	63212	60 %	20 %	0 %	20 %	451816855
58	NC_020297	TCAAA	2	10	63846	63855	60 %	20 %	0 %	20 %	451816856
59	NC_020297	AGCTG	2	10	63879	63888	20 %	20 %	40 %	20 %	451816856
60	NC_020297	AAAGG	2	10	64593	64602	60 %	0 %	40 %	0 %	451816857
61	NC_020297	CAAAA	2	10	66248	66257	80 %	0 %	0 %	20 %	451816859
62	NC_020297	TTATT	2	10	69804	69813	20 %	80 %	0 %	0 %	451816861
63	NC_020297	AATGT	2	10	70970	70979	40 %	40 %	20 %	0 %	451816861
64	NC_020297	ATCTT	2	10	71372	71381	20 %	60 %	0 %	20 %	451816862
65	NC_020297	AGAAA	2	10	71922	71931	80 %	0 %	20 %	0 %	451816862
66	NC_020297	ACTTA	2	10	72733	72742	40 %	40 %	0 %	20 %	451816862
67	NC_020297	TATTC	2	10	73269	73278	20 %	60 %	0 %	20 %	451816863
68	NC_020297	CCATC	2	10	73921	73930	20 %	20 %	0 %	60 %	451816863
69	NC_020297	AAATT	2	10	74191	74200	60 %	40 %	0 %	0 %	451816863
70	NC_020297	AAATT	2	10	74518	74527	60 %	40 %	0 %	0 %	451816863
71	NC_020297	GGAAG	2	10	74576	74585	40 %	0 %	60 %	0 %	451816863
72	NC_020297	GAGAG	2	10	77097	77106	40 %	0 %	60 %	0 %	451816867
73	NC_020297	ATATA	2	10	77173	77182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020297	TGGTT	2	10	77323	77332	0 %	60 %	40 %	0 %	451816868
75	NC_020297	GAATT	2	10	77341	77350	40 %	40 %	20 %	0 %	451816868
76	NC_020297	AAAGA	2	10	77396	77405	80 %	0 %	20 %	0 %	451816868
77	NC_020297	TAAAT	2	10	77468	77477	60 %	40 %	0 %	0 %	451816868
78	NC_020297	CCTTG	2	10	77807	77816	0 %	40 %	20 %	40 %	451816869
79	NC_020297	CCTGC	2	10	78037	78046	0 %	20 %	20 %	60 %	451816869
80	NC_020297	AGCAA	2	10	79201	79210	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020297	GAATT	2	10	79540	79549	40 %	40 %	20 %	0 %	451816872
82	NC_020297	AAAAC	2	10	79989	79998	80 %	0 %	0 %	20 %	451816873
83	NC_020297	AAAGG	2	10	82654	82663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020297	GGAGT	2	10	83835	83844	20 %	20 %	60 %	0 %	451816878
85	NC_020297	GGGGT	2	10	85485	85494	0 %	20 %	80 %	0 %	451816878
86	NC_020297	AACTG	2	10	86130	86139	40 %	20 %	20 %	20 %	451816878
87	NC_020297	TTTTG	2	10	87182	87191	0 %	80 %	20 %	0 %	451816880
88	NC_020297	TTTCA	2	10	88862	88871	20 %	60 %	0 %	20 %	451816883
89	NC_020297	TTTGA	2	10	91390	91399	20 %	60 %	20 %	0 %	451816885
90	NC_020297	AGCCA	2	10	92798	92807	40 %	0 %	20 %	40 %	451816886
91	NC_020297	CCAAT	2	10	92862	92871	40 %	20 %	0 %	40 %	451816886
92	NC_020297	TAAAT	2	10	94698	94707	60 %	40 %	0 %	0 %	451816889
93	NC_020297	GTTCA	2	10	95082	95091	20 %	40 %	20 %	20 %	451816890
94	NC_020297	AGAAA	2	10	98081	98090	80 %	0 %	20 %	0 %	451816891
95	NC_020297	TCAGA	2	10	98356	98365	40 %	20 %	20 %	20 %	451816891
96	NC_020297	TTTGC	2	10	100556	100565	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020297	CGAAT	2	10	101950	101959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020297	GACTG	2	10	104877	104886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020297	CTGCC	2	10	104994	105003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.