MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 1359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020297	CTG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020297	CGA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020297	CCG	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020297	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020297	TCT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020297	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
8	NC_020297	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
9	NC_020297	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816789
10	NC_020297	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816789
11	NC_020297	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
12	NC_020297	AGG	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816789
13	NC_020297	TCC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816789
14	NC_020297	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816789
15	NC_020297	CAG	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816789
16	NC_020297	TTG	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816789
17	NC_020297	GCC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816789
18	NC_020297	ATG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816789
19	NC_020297	TGG	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
20	NC_020297	GAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
21	NC_020297	CGG	2	6	1937	1942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
22	NC_020297	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816789
23	NC_020297	TTA	2	6	1965	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
24	NC_020297	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
25	NC_020297	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
26	NC_020297	TGG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
27	NC_020297	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816789
28	NC_020297	CGC	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816789
29	NC_020297	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
30	NC_020297	CGG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
31	NC_020297	CAT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816789
32	NC_020297	GCG	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
33	NC_020297	GTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020297	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020297	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020297	CAG	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020297	ATT	2	6	3481	3486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020297	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816790
39	NC_020297	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816790
40	NC_020297	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816790
41	NC_020297	ACA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816791
42	NC_020297	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816791
43	NC_020297	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816792
44	NC_020297	GCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
45	NC_020297	CTG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816792
46	NC_020297	CGG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
47	NC_020297	GGC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
48	NC_020297	CTG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816793
49	NC_020297	CGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816793
50	NC_020297	CGA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816793
51	NC_020297	GGC	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816793
52	NC_020297	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816793
53	NC_020297	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816793
54	NC_020297	GGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816793
55	NC_020297	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
56	NC_020297	GGC	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
57	NC_020297	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816794
58	NC_020297	CCG	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
59	NC_020297	GCC	2	6	5668	5673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
60	NC_020297	TGG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
61	NC_020297	CGG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
62	NC_020297	GTG	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
63	NC_020297	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816794
64	NC_020297	GGT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
65	NC_020297	CAT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816794
66	NC_020297	CCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
67	NC_020297	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816794
68	NC_020297	TGA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816794
69	NC_020297	GGA	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816794
70	NC_020297	GCC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020297	ACC	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020297	AGT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
73	NC_020297	CAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
74	NC_020297	TGG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816795
75	NC_020297	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
76	NC_020297	GGC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816795
77	NC_020297	ACT	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
78	NC_020297	GGA	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816795
79	NC_020297	CCA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816795
80	NC_020297	CAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816795
81	NC_020297	TGA	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
82	NC_020297	CAC	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816795
83	NC_020297	TGA	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
84	NC_020297	GCG	2	6	7210	7215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816795
85	NC_020297	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816795
86	NC_020297	GAG	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816795
87	NC_020297	ATT	2	6	7482	7487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020297	CTC	2	6	7527	7532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020297	GGA	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020297	GGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816796
91	NC_020297	ACT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816796
92	NC_020297	AAT	2	6	7658	7663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816796
93	NC_020297	ACT	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816796
94	NC_020297	AAG	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816796
95	NC_020297	CCT	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816796
96	NC_020297	GAA	2	6	7913	7918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816796
97	NC_020297	GCC	2	6	8107	8112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816796
98	NC_020297	CCG	2	6	8224	8229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816796
99	NC_020297	GGC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816796
100	NC_020297	ACC	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816796
101	NC_020297	CCG	2	6	8359	8364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816796
102	NC_020297	GGA	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816796
103	NC_020297	GGA	2	6	8461	8466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816796
104	NC_020297	CGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816796
105	NC_020297	ACT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816796
106	NC_020297	GAA	2	6	8607	8612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020297	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816797
108	NC_020297	ACA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816797
109	NC_020297	CAA	2	6	8742	8747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816797
110	NC_020297	CAC	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816797
111	NC_020297	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816797
112	NC_020297	AAT	2	6	8994	8999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816797
113	NC_020297	CGC	2	6	9080	9085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816797
114	NC_020297	CAA	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816797
115	NC_020297	GTA	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816797
116	NC_020297	GAA	2	6	9216	9221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816797
117	NC_020297	GAG	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816797
118	NC_020297	GGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816797
119	NC_020297	AAT	2	6	9445	9450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816797
120	NC_020297	AGG	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816798
121	NC_020297	ACT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816798
122	NC_020297	GAT	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816798
123	NC_020297	TGG	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816798
124	NC_020297	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816798
125	NC_020297	TCA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816798
126	NC_020297	CAC	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_020297	ATG	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816799
128	NC_020297	GTG	2	6	10668	10673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816799
129	NC_020297	ACT	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816799
130	NC_020297	AGG	2	6	10813	10818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816799
131	NC_020297	TTA	2	6	10997	11002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020297	ATT	2	6	11026	11031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020297	ATA	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_020297	GGC	2	6	21273	21278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816805
260	NC_020297	ATT	2	6	21683	21688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816806
261	NC_020297	GCA	2	6	21735	21740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816806
262	NC_020297	AAG	2	6	21818	21823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020297	GTC	3	9	21858	21866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816807
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379	NC_020297	GAA	2	6	32026	32031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_020297	CCT	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816822
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