MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	AG	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	451816789
2	NC_020297	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	451816789
3	NC_020297	CT	3	6	10210	10215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020297	AG	3	6	11719	11724	50 %	0 %	50 %	0 %	451816800
5	NC_020297	AG	3	6	12148	12153	50 %	0 %	50 %	0 %	451816800
6	NC_020297	AT	3	6	15002	15007	50 %	50 %	0 %	0 %	451816801
7	NC_020297	TA	3	6	15598	15603	50 %	50 %	0 %	0 %	451816802
8	NC_020297	AT	3	6	16123	16128	50 %	50 %	0 %	0 %	451816802
9	NC_020297	CT	3	6	16507	16512	0 %	50 %	0 %	50 %	451816803
10	NC_020297	AT	3	6	16975	16980	50 %	50 %	0 %	0 %	451816803
11	NC_020297	AT	3	6	17524	17529	50 %	50 %	0 %	0 %	451816803
12	NC_020297	CT	3	6	19065	19070	0 %	50 %	0 %	50 %	451816804
13	NC_020297	TG	3	6	20358	20363	0 %	50 %	50 %	0 %	451816804
14	NC_020297	AT	3	6	21492	21497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020297	GT	3	6	22534	22539	0 %	50 %	50 %	0 %	451816809
16	NC_020297	TG	3	6	22817	22822	0 %	50 %	50 %	0 %	451816809
17	NC_020297	CT	4	8	23350	23357	0 %	50 %	0 %	50 %	451816810
18	NC_020297	TC	3	6	23560	23565	0 %	50 %	0 %	50 %	451816810
19	NC_020297	TC	3	6	25582	25587	0 %	50 %	0 %	50 %	451816815
20	NC_020297	CT	3	6	27465	27470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020297	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	451816819
22	NC_020297	GA	3	6	33431	33436	50 %	0 %	50 %	0 %	451816824
23	NC_020297	AT	3	6	34802	34807	50 %	50 %	0 %	0 %	451816827
24	NC_020297	TC	3	6	41700	41705	0 %	50 %	0 %	50 %	451816831
25	NC_020297	CT	3	6	41950	41955	0 %	50 %	0 %	50 %	451816831
26	NC_020297	GA	3	6	42871	42876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020297	TC	3	6	44296	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	451816835
28	NC_020297	TG	4	8	44574	44581	0 %	50 %	50 %	0 %	451816835
29	NC_020297	AG	3	6	46094	46099	50 %	0 %	50 %	0 %	451816835
30	NC_020297	TG	4	8	47078	47085	0 %	50 %	50 %	0 %	451816835
31	NC_020297	AT	3	6	48360	48365	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
32	NC_020297	AT	3	6	48987	48992	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
33	NC_020297	TA	3	6	50588	50593	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
34	NC_020297	AT	3	6	50800	50805	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
35	NC_020297	CT	4	8	52876	52883	0 %	50 %	0 %	50 %	451816841
36	NC_020297	CA	4	8	52910	52917	50 %	0 %	0 %	50 %	451816841
37	NC_020297	TC	4	8	56076	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	451816846
38	NC_020297	TG	3	6	57559	57564	0 %	50 %	50 %	0 %	451816848
39	NC_020297	TC	3	6	57631	57636	0 %	50 %	0 %	50 %	451816848
40	NC_020297	CT	3	6	64928	64933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020297	AG	3	6	66437	66442	50 %	0 %	50 %	0 %	451816859
42	NC_020297	AG	3	6	66866	66871	50 %	0 %	50 %	0 %	451816859
43	NC_020297	AT	3	6	69720	69725	50 %	50 %	0 %	0 %	451816860
44	NC_020297	TA	3	6	70316	70321	50 %	50 %	0 %	0 %	451816861
45	NC_020297	AT	3	6	70841	70846	50 %	50 %	0 %	0 %	451816861
46	NC_020297	CT	3	6	71225	71230	0 %	50 %	0 %	50 %	451816862
47	NC_020297	AT	3	6	71693	71698	50 %	50 %	0 %	0 %	451816862
48	NC_020297	AT	3	6	72242	72247	50 %	50 %	0 %	0 %	451816862
49	NC_020297	CT	3	6	73783	73788	0 %	50 %	0 %	50 %	451816863
50	NC_020297	TG	3	6	75076	75081	0 %	50 %	50 %	0 %	451816863
51	NC_020297	AT	3	6	76210	76215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020297	GT	3	6	77252	77257	0 %	50 %	50 %	0 %	451816868
53	NC_020297	TG	3	6	77535	77540	0 %	50 %	50 %	0 %	451816868
54	NC_020297	CT	4	8	78068	78075	0 %	50 %	0 %	50 %	451816869
55	NC_020297	TC	3	6	78278	78283	0 %	50 %	0 %	50 %	451816869
56	NC_020297	TC	3	6	80300	80305	0 %	50 %	0 %	50 %	451816874
57	NC_020297	CT	3	6	82183	82188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020297	TG	3	6	89060	89065	0 %	50 %	50 %	0 %	451816883
59	NC_020297	AT	3	6	91112	91117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816885
60	NC_020297	AG	3	6	93218	93223	50 %	0 %	50 %	0 %	451816886
61	NC_020297	GT	3	6	95394	95399	0 %	50 %	50 %	0 %	451816890
62	NC_020297	TA	3	6	95985	95990	50 %	50 %	0 %	0 %	451816890
63	NC_020297	TC	3	6	96504	96509	0 %	50 %	0 %	50 %	451816890
64	NC_020297	TA	3	6	98578	98583	50 %	50 %	0 %	0 %	451816891
65	NC_020297	AT	3	6	99713	99718	50 %	50 %	0 %	0 %	451816893
66	NC_020297	AG	3	6	100179	100184	50 %	0 %	50 %	0 %	451816893
67	NC_020297	TG	3	6	100499	100504	0 %	50 %	50 %	0 %	451816893
68	NC_020297	AG	3	6	100644	100649	50 %	0 %	50 %	0 %	451816894
69	NC_020297	TA	3	6	101105	101110	50 %	50 %	0 %	0 %	451816894
70	NC_020297	AT	3	6	102029	102034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020297	AT	3	6	102236	102241	50 %	50 %	0 %	0 %	451816895
72	NC_020297	TC	3	6	102514	102519	0 %	50 %	0 %	50 %	451816895
73	NC_020297	AT	3	6	102945	102950	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896
74	NC_020297	AT	3	6	103369	103374	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896
75	NC_020297	AT	3	6	104736	104741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020297	TC	3	6	104905	104910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.