MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	AG	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	451816789
2	NC_020297	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	451816789
3	NC_020297	AG	3	6	11719	11724	50 %	0 %	50 %	0 %	451816800
4	NC_020297	AG	3	6	12148	12153	50 %	0 %	50 %	0 %	451816800
5	NC_020297	AT	3	6	15002	15007	50 %	50 %	0 %	0 %	451816801
6	NC_020297	TA	3	6	15598	15603	50 %	50 %	0 %	0 %	451816802
7	NC_020297	AT	3	6	16123	16128	50 %	50 %	0 %	0 %	451816802
8	NC_020297	CT	3	6	16507	16512	0 %	50 %	0 %	50 %	451816803
9	NC_020297	AT	3	6	16975	16980	50 %	50 %	0 %	0 %	451816803
10	NC_020297	AT	3	6	17524	17529	50 %	50 %	0 %	0 %	451816803
11	NC_020297	CT	3	6	19065	19070	0 %	50 %	0 %	50 %	451816804
12	NC_020297	TG	3	6	20358	20363	0 %	50 %	50 %	0 %	451816804
13	NC_020297	GT	3	6	22534	22539	0 %	50 %	50 %	0 %	451816809
14	NC_020297	TG	3	6	22817	22822	0 %	50 %	50 %	0 %	451816809
15	NC_020297	CT	4	8	23350	23357	0 %	50 %	0 %	50 %	451816810
16	NC_020297	TC	3	6	23560	23565	0 %	50 %	0 %	50 %	451816810
17	NC_020297	TC	3	6	25582	25587	0 %	50 %	0 %	50 %	451816815
18	NC_020297	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	451816819
19	NC_020297	GA	3	6	33431	33436	50 %	0 %	50 %	0 %	451816824
20	NC_020297	AT	3	6	34802	34807	50 %	50 %	0 %	0 %	451816827
21	NC_020297	TC	3	6	41700	41705	0 %	50 %	0 %	50 %	451816831
22	NC_020297	CT	3	6	41950	41955	0 %	50 %	0 %	50 %	451816831
23	NC_020297	TC	3	6	44296	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	451816835
24	NC_020297	TG	4	8	44574	44581	0 %	50 %	50 %	0 %	451816835
25	NC_020297	AG	3	6	46094	46099	50 %	0 %	50 %	0 %	451816835
26	NC_020297	TG	4	8	47078	47085	0 %	50 %	50 %	0 %	451816835
27	NC_020297	AT	3	6	48360	48365	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
28	NC_020297	AT	3	6	48987	48992	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
29	NC_020297	TA	3	6	50588	50593	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
30	NC_020297	AT	3	6	50800	50805	50 %	50 %	0 %	0 %	451816838
31	NC_020297	CT	4	8	52876	52883	0 %	50 %	0 %	50 %	451816841
32	NC_020297	CA	4	8	52910	52917	50 %	0 %	0 %	50 %	451816841
33	NC_020297	TC	4	8	56076	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	451816846
34	NC_020297	TG	3	6	57559	57564	0 %	50 %	50 %	0 %	451816848
35	NC_020297	TC	3	6	57631	57636	0 %	50 %	0 %	50 %	451816848
36	NC_020297	AG	3	6	66437	66442	50 %	0 %	50 %	0 %	451816859
37	NC_020297	AG	3	6	66866	66871	50 %	0 %	50 %	0 %	451816859
38	NC_020297	AT	3	6	69720	69725	50 %	50 %	0 %	0 %	451816860
39	NC_020297	TA	3	6	70316	70321	50 %	50 %	0 %	0 %	451816861
40	NC_020297	AT	3	6	70841	70846	50 %	50 %	0 %	0 %	451816861
41	NC_020297	CT	3	6	71225	71230	0 %	50 %	0 %	50 %	451816862
42	NC_020297	AT	3	6	71693	71698	50 %	50 %	0 %	0 %	451816862
43	NC_020297	AT	3	6	72242	72247	50 %	50 %	0 %	0 %	451816862
44	NC_020297	CT	3	6	73783	73788	0 %	50 %	0 %	50 %	451816863
45	NC_020297	TG	3	6	75076	75081	0 %	50 %	50 %	0 %	451816863
46	NC_020297	GT	3	6	77252	77257	0 %	50 %	50 %	0 %	451816868
47	NC_020297	TG	3	6	77535	77540	0 %	50 %	50 %	0 %	451816868
48	NC_020297	CT	4	8	78068	78075	0 %	50 %	0 %	50 %	451816869
49	NC_020297	TC	3	6	78278	78283	0 %	50 %	0 %	50 %	451816869
50	NC_020297	TC	3	6	80300	80305	0 %	50 %	0 %	50 %	451816874
51	NC_020297	TG	3	6	89060	89065	0 %	50 %	50 %	0 %	451816883
52	NC_020297	AT	3	6	91112	91117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816885
53	NC_020297	AG	3	6	93218	93223	50 %	0 %	50 %	0 %	451816886
54	NC_020297	GT	3	6	95394	95399	0 %	50 %	50 %	0 %	451816890
55	NC_020297	TA	3	6	95985	95990	50 %	50 %	0 %	0 %	451816890
56	NC_020297	TC	3	6	96504	96509	0 %	50 %	0 %	50 %	451816890
57	NC_020297	TA	3	6	98578	98583	50 %	50 %	0 %	0 %	451816891
58	NC_020297	AT	3	6	99713	99718	50 %	50 %	0 %	0 %	451816893
59	NC_020297	AG	3	6	100179	100184	50 %	0 %	50 %	0 %	451816893
60	NC_020297	TG	3	6	100499	100504	0 %	50 %	50 %	0 %	451816893
61	NC_020297	AG	3	6	100644	100649	50 %	0 %	50 %	0 %	451816894
62	NC_020297	TA	3	6	101105	101110	50 %	50 %	0 %	0 %	451816894
63	NC_020297	AT	3	6	102236	102241	50 %	50 %	0 %	0 %	451816895
64	NC_020297	TC	3	6	102514	102519	0 %	50 %	0 %	50 %	451816895
65	NC_020297	AT	3	6	102945	102950	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896
66	NC_020297	AT	3	6	103369	103374	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.