MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020296	TTAC	2	8	1913	1920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020296	TCTA	2	8	2489	2496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020296	GTCT	2	8	14170	14177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020296	CCGG	2	8	14542	14549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020296	TAAA	2	8	15523	15530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020296	CTTT	2	8	15558	15565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020296	TAAT	2	8	17758	17765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020296	ATTT	2	8	17800	17807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020296	TAGT	2	8	27836	27843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020296	CAAA	2	8	31084	31091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020296	GGAG	2	8	31388	31395	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020296	CTCC	2	8	36372	36379	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020296	TGTC	2	8	38216	38223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020296	TTTA	2	8	38751	38758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020296	TAAT	2	8	38850	38857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020296	TCAA	2	8	49677	49684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020296	CTGA	2	8	65318	65325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020296	CAAG	2	8	66465	66472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020296	GTCA	2	8	66622	66629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020296	AATT	2	8	66652	66659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020296	AACA	2	8	66668	66675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020296	TTAT	2	8	67997	68004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020296	TTCT	2	8	68627	68634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020296	GTTA	2	8	68678	68685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020296	TAAC	2	8	68842	68849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020296	ATCG	2	8	68880	68887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020296	CTTT	2	8	68951	68958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020296	GGTG	2	8	70831	70838	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020296	TAAA	2	8	71061	71068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020296	AATC	2	8	72237	72244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020296	TATC	2	8	74279	74286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020296	TTGA	2	8	74430	74437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020296	TGGT	2	8	75946	75953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020296	TGAT	2	8	79496	79503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020296	ATCT	2	8	80641	80648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020296	CTGC	2	8	80660	80667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020296	GCAA	2	8	81903	81910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020296	ATGT	2	8	82079	82086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020296	CCAA	2	8	84428	84435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020296	TCTT	2	8	87099	87106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020296	AAAT	2	8	87112	87119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020296	AAAG	2	8	87337	87344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020296	GGGC	2	8	87552	87559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020296	ATTA	2	8	88087	88094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020296	TAAA	2	8	90643	90650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020296	CTTT	2	8	90678	90685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020296	TTAC	2	8	94887	94894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020296	TAGA	2	8	95596	95603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020296	TATC	2	8	99999	100006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020296	CTTT	2	8	100411	100418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020296	AAGT	2	8	102366	102373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020296	TAAA	2	8	102530	102537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020296	CAAT	2	8	103248	103255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020296	GCCT	2	8	103272	103279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020296	TCTA	2	8	105434	105441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020296	GGGA	2	8	109966	109973	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020296	GATT	2	8	110346	110353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020296	ATCT	2	8	113590	113597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020296	CTGC	2	8	113612	113619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020296	ATAA	2	8	114435	114442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020296	ATAA	2	8	115334	115341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020296	TTCT	2	8	117026	117033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020296	TTTG	2	8	117038	117045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020296	GAAC	2	8	117292	117299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020296	TAGA	2	8	117399	117406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020296	TCAT	2	8	118105	118112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020296	GGTT	2	8	118604	118611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.