MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020296	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	451816545
2	NC_020296	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	451816546
3	NC_020296	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
4	NC_020296	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	451816548
5	NC_020296	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
6	NC_020296	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	451816548
7	NC_020296	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	451816548
8	NC_020296	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
9	NC_020296	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
10	NC_020296	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
11	NC_020296	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	451816548
12	NC_020296	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
13	NC_020296	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
14	NC_020296	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
15	NC_020296	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
16	NC_020296	AAGT	2	8	8287	8294	50 %	25 %	25 %	0 %	451816548
17	NC_020296	CAAT	2	8	8317	8324	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
18	NC_020296	GTCC	2	8	8357	8364	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
19	NC_020296	GAAG	2	8	9314	9321	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
20	NC_020296	TGGA	2	8	9951	9958	25 %	25 %	50 %	0 %	451816548
21	NC_020296	TGTT	2	8	10491	10498	0 %	75 %	25 %	0 %	451816548
22	NC_020296	TACA	2	8	10807	10814	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
23	NC_020296	TCAA	2	8	10960	10967	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
24	NC_020296	GGCG	2	8	11083	11090	0 %	0 %	75 %	25 %	451816548
25	NC_020296	CAGG	2	8	11606	11613	25 %	0 %	50 %	25 %	451816548
26	NC_020296	AGCA	2	8	12223	12230	50 %	0 %	25 %	25 %	451816548
27	NC_020296	CCAA	2	8	12235	12242	50 %	0 %	0 %	50 %	451816548
28	NC_020296	AGCG	2	8	12685	12692	25 %	0 %	50 %	25 %	451816548
29	NC_020296	ACCA	2	8	13007	13014	50 %	0 %	0 %	50 %	451816548
30	NC_020296	CCGG	2	8	13555	13562	0 %	0 %	50 %	50 %	451816548
31	NC_020296	GAGC	2	8	13617	13624	25 %	0 %	50 %	25 %	451816548
32	NC_020296	GTAT	2	8	13686	13693	25 %	50 %	25 %	0 %	451816548
33	NC_020296	TCAA	2	8	16069	16076	50 %	25 %	0 %	25 %	451816552
34	NC_020296	GGCA	2	8	16622	16629	25 %	0 %	50 %	25 %	451816553
35	NC_020296	TCAT	2	8	17291	17298	25 %	50 %	0 %	25 %	451816554
36	NC_020296	TTAA	2	8	17338	17345	50 %	50 %	0 %	0 %	451816554
37	NC_020296	TATT	2	8	18489	18496	25 %	75 %	0 %	0 %	451816555
38	NC_020296	CCAA	2	8	18763	18770	50 %	0 %	0 %	50 %	451816555
39	NC_020296	GATC	2	8	19857	19864	25 %	25 %	25 %	25 %	451816556
40	NC_020296	ATTT	2	8	20498	20505	25 %	75 %	0 %	0 %	451816556
41	NC_020296	TAAT	2	8	20672	20679	50 %	50 %	0 %	0 %	451816557
42	NC_020296	CTTT	2	8	22302	22309	0 %	75 %	0 %	25 %	451816559
43	NC_020296	CAAA	2	8	22788	22795	75 %	0 %	0 %	25 %	451816559
44	NC_020296	TATT	2	8	22835	22842	25 %	75 %	0 %	0 %	451816559
45	NC_020296	CTAT	2	8	23556	23563	25 %	50 %	0 %	25 %	451816560
46	NC_020296	AGCT	2	8	24558	24565	25 %	25 %	25 %	25 %	451816564
47	NC_020296	CTTT	2	8	25318	25325	0 %	75 %	0 %	25 %	451816565
48	NC_020296	AATT	2	8	25358	25365	50 %	50 %	0 %	0 %	451816565
49	NC_020296	ATGA	2	8	25572	25579	50 %	25 %	25 %	0 %	451816565
50	NC_020296	CAAT	2	8	25661	25668	50 %	25 %	0 %	25 %	451816565
51	NC_020296	AATT	2	8	27272	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	451816567
52	NC_020296	AAAC	2	8	27550	27557	75 %	0 %	0 %	25 %	451816567
53	NC_020296	CTTT	2	8	28620	28627	0 %	75 %	0 %	25 %	451816569
54	NC_020296	TAAA	2	8	28813	28820	75 %	25 %	0 %	0 %	451816569
55	NC_020296	TCAA	2	8	29633	29640	50 %	25 %	0 %	25 %	451816569
56	NC_020296	ATTT	2	8	30167	30174	25 %	75 %	0 %	0 %	451816569
57	NC_020296	CTGC	2	8	30326	30333	0 %	25 %	25 %	50 %	451816570
58	NC_020296	TAAA	2	8	30760	30767	75 %	25 %	0 %	0 %	451816571
59	NC_020296	AACC	2	8	30840	30847	50 %	0 %	0 %	50 %	451816571
60	NC_020296	AAAG	2	8	31533	31540	75 %	0 %	25 %	0 %	451816572
61	NC_020296	GAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	50 %	0 %	451816572
62	NC_020296	AAAG	2	8	31856	31863	75 %	0 %	25 %	0 %	451816572
63	NC_020296	GTCA	2	8	32633	32640	25 %	25 %	25 %	25 %	451816573
64	NC_020296	CAGG	2	8	32804	32811	25 %	0 %	50 %	25 %	451816573
65	NC_020296	CCAA	2	8	32934	32941	50 %	0 %	0 %	50 %	451816574
66	NC_020296	GTAA	2	8	33099	33106	50 %	25 %	25 %	0 %	451816575
67	NC_020296	CTCC	2	8	33212	33219	0 %	25 %	0 %	75 %	451816575
68	NC_020296	TAGA	2	8	33713	33720	50 %	25 %	25 %	0 %	451816576
69	NC_020296	ATTA	2	8	33890	33897	50 %	50 %	0 %	0 %	451816576
70	NC_020296	GGCA	2	8	34150	34157	25 %	0 %	50 %	25 %	451816577
71	NC_020296	GTTT	2	8	34203	34210	0 %	75 %	25 %	0 %	451816577
72	NC_020296	TAGA	2	8	34765	34772	50 %	25 %	25 %	0 %	451816578
73	NC_020296	CAAC	2	8	34860	34867	50 %	0 %	0 %	50 %	451816578
74	NC_020296	TCCC	2	8	34870	34877	0 %	25 %	0 %	75 %	451816578
75	NC_020296	TGGT	2	8	35549	35556	0 %	50 %	50 %	0 %	451816579
76	NC_020296	GGCC	2	8	35889	35896	0 %	0 %	50 %	50 %	451816579
77	NC_020296	ATTC	2	8	36792	36799	25 %	50 %	0 %	25 %	451816580
78	NC_020296	GAAA	2	8	36908	36915	75 %	0 %	25 %	0 %	451816581
79	NC_020296	GGGA	2	8	37007	37014	25 %	0 %	75 %	0 %	451816581
80	NC_020296	TCAA	2	8	37249	37256	50 %	25 %	0 %	25 %	451816581
81	NC_020296	TACT	2	8	37600	37607	25 %	50 %	0 %	25 %	451816581
82	NC_020296	TGTT	2	8	37861	37868	0 %	75 %	25 %	0 %	451816581
83	NC_020296	GAGT	2	8	37997	38004	25 %	25 %	50 %	0 %	451816581
84	NC_020296	AGTT	2	8	38117	38124	25 %	50 %	25 %	0 %	451816581
85	NC_020296	AATA	2	8	38476	38483	75 %	25 %	0 %	0 %	451816582
86	NC_020296	TTGG	2	8	39439	39446	0 %	50 %	50 %	0 %	451816583
87	NC_020296	TACC	2	8	39574	39581	25 %	25 %	0 %	50 %	451816583
88	NC_020296	GCTT	2	8	39632	39639	0 %	50 %	25 %	25 %	451816583
89	NC_020296	CGTT	2	8	40550	40557	0 %	50 %	25 %	25 %	451816585
90	NC_020296	TTGC	2	8	40861	40868	0 %	50 %	25 %	25 %	451816585
91	NC_020296	GATC	2	8	40902	40909	25 %	25 %	25 %	25 %	451816585
92	NC_020296	CGAT	2	8	40973	40980	25 %	25 %	25 %	25 %	451816585
93	NC_020296	ATAA	2	8	40996	41003	75 %	25 %	0 %	0 %	451816585
94	NC_020296	TTCT	2	8	41489	41496	0 %	75 %	0 %	25 %	451816586
95	NC_020296	AACC	2	8	41538	41545	50 %	0 %	0 %	50 %	451816586
96	NC_020296	ATAG	2	8	41611	41618	50 %	25 %	25 %	0 %	451816586
97	NC_020296	ATCA	2	8	41924	41931	50 %	25 %	0 %	25 %	451816586
98	NC_020296	TCCA	2	8	42631	42638	25 %	25 %	0 %	50 %	451816587
99	NC_020296	CATG	2	8	42639	42646	25 %	25 %	25 %	25 %	451816587
100	NC_020296	ATGG	2	8	42724	42731	25 %	25 %	50 %	0 %	451816587
101	NC_020296	ATTG	2	8	43633	43640	25 %	50 %	25 %	0 %	451816589
102	NC_020296	CCAG	2	8	43837	43844	25 %	0 %	25 %	50 %	451816589
103	NC_020296	TGCC	2	8	44367	44374	0 %	25 %	25 %	50 %	451816590
104	NC_020296	GCCC	2	8	44854	44861	0 %	0 %	25 %	75 %	451816590
105	NC_020296	TAAT	2	8	45225	45232	50 %	50 %	0 %	0 %	451816590
106	NC_020296	GAAA	2	8	45795	45802	75 %	0 %	25 %	0 %	451816590
107	NC_020296	CTCG	2	8	46544	46551	0 %	25 %	25 %	50 %	451816591
108	NC_020296	GTTT	2	8	48075	48082	0 %	75 %	25 %	0 %	451816592
109	NC_020296	AAAT	2	8	48115	48122	75 %	25 %	0 %	0 %	451816592
110	NC_020296	AGCC	2	8	48472	48479	25 %	0 %	25 %	50 %	451816593
111	NC_020296	AATT	2	8	48690	48697	50 %	50 %	0 %	0 %	451816593
112	NC_020296	CGGT	2	8	49020	49027	0 %	25 %	50 %	25 %	451816593
113	NC_020296	ATTG	2	8	49532	49539	25 %	50 %	25 %	0 %	451816593
114	NC_020296	AGAC	2	8	50214	50221	50 %	0 %	25 %	25 %	451816595
115	NC_020296	AAAG	2	8	50239	50246	75 %	0 %	25 %	0 %	451816595
116	NC_020296	CAGC	2	8	50336	50343	25 %	0 %	25 %	50 %	451816595
117	NC_020296	TATC	2	8	50530	50537	25 %	50 %	0 %	25 %	451816595
118	NC_020296	ATCG	2	8	50612	50619	25 %	25 %	25 %	25 %	451816595
119	NC_020296	CTTT	2	8	51073	51080	0 %	75 %	0 %	25 %	451816595
120	NC_020296	TGGG	2	8	52011	52018	0 %	25 %	75 %	0 %	451816595
121	NC_020296	AGCC	2	8	52180	52187	25 %	0 %	25 %	50 %	451816595
122	NC_020296	AATA	2	8	52801	52808	75 %	25 %	0 %	0 %	451816596
123	NC_020296	TTAT	2	8	53125	53132	25 %	75 %	0 %	0 %	451816597
124	NC_020296	CAAT	2	8	53409	53416	50 %	25 %	0 %	25 %	451816597
125	NC_020296	AAAG	2	8	53736	53743	75 %	0 %	25 %	0 %	451816597
126	NC_020296	CAAA	2	8	53984	53991	75 %	0 %	0 %	25 %	451816597
127	NC_020296	CAAG	2	8	54613	54620	50 %	0 %	25 %	25 %	451816598
128	NC_020296	TCTG	2	8	54856	54863	0 %	50 %	25 %	25 %	451816598
129	NC_020296	ACCT	2	8	56848	56855	25 %	25 %	0 %	50 %	451816600
130	NC_020296	AAAG	2	8	57208	57215	75 %	0 %	25 %	0 %	451816600
131	NC_020296	TTCC	2	8	58345	58352	0 %	50 %	0 %	50 %	451816601
132	NC_020296	CAGT	2	8	58518	58525	25 %	25 %	25 %	25 %	451816601
133	NC_020296	GTTT	2	8	59812	59819	0 %	75 %	25 %	0 %	451816601
134	NC_020296	GCTC	2	8	60025	60032	0 %	25 %	25 %	50 %	451816601
135	NC_020296	TGGT	2	8	60110	60117	0 %	50 %	50 %	0 %	451816601
136	NC_020296	CCAT	2	8	60985	60992	25 %	25 %	0 %	50 %	451816602
137	NC_020296	TCAT	2	8	61728	61735	25 %	50 %	0 %	25 %	451816603
138	NC_020296	CCAT	2	8	61851	61858	25 %	25 %	0 %	50 %	451816603
139	NC_020296	TTGA	2	8	61988	61995	25 %	50 %	25 %	0 %	451816603
140	NC_020296	TGTC	2	8	62128	62135	0 %	50 %	25 %	25 %	451816603
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.