MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020296	T	6	6	55	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020296	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	451816544
3	NC_020296	T	7	7	489	495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020296	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	451816545
5	NC_020296	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020296	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020296	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
8	NC_020296	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
9	NC_020296	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
10	NC_020296	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
11	NC_020296	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	451816548
12	NC_020296	C	7	7	7516	7522	0 %	0 %	0 %	100 %	451816548
13	NC_020296	A	6	6	7825	7830	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
14	NC_020296	A	6	6	7964	7969	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
15	NC_020296	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
16	NC_020296	A	7	7	9247	9253	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
17	NC_020296	T	6	6	9873	9878	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
18	NC_020296	A	6	6	10636	10641	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
19	NC_020296	T	6	6	11298	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
20	NC_020296	G	6	6	12864	12869	0 %	0 %	100 %	0 %	451816548
21	NC_020296	T	6	6	13232	13237	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
22	NC_020296	T	6	6	13281	13286	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
23	NC_020296	T	6	6	14322	14327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020296	T	7	7	15133	15139	0 %	100 %	0 %	0 %	451816549
25	NC_020296	T	7	7	15153	15159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020296	T	7	7	15195	15201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020296	A	6	6	16796	16801	100 %	0 %	0 %	0 %	451816553
28	NC_020296	A	6	6	17221	17226	100 %	0 %	0 %	0 %	451816554
29	NC_020296	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	451816554
30	NC_020296	A	7	7	17720	17726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020296	T	7	7	17865	17871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020296	A	6	6	17979	17984	100 %	0 %	0 %	0 %	451816555
33	NC_020296	T	7	7	18016	18022	0 %	100 %	0 %	0 %	451816555
34	NC_020296	A	6	6	18056	18061	100 %	0 %	0 %	0 %	451816555
35	NC_020296	A	6	6	18405	18410	100 %	0 %	0 %	0 %	451816555
36	NC_020296	A	7	7	18809	18815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020296	T	6	6	19043	19048	0 %	100 %	0 %	0 %	451816556
38	NC_020296	T	7	7	19250	19256	0 %	100 %	0 %	0 %	451816556
39	NC_020296	A	6	6	19259	19264	100 %	0 %	0 %	0 %	451816556
40	NC_020296	T	6	6	19910	19915	0 %	100 %	0 %	0 %	451816556
41	NC_020296	A	7	7	20613	20619	100 %	0 %	0 %	0 %	451816557
42	NC_020296	T	6	6	20647	20652	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
43	NC_020296	A	6	6	20962	20967	100 %	0 %	0 %	0 %	451816557
44	NC_020296	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
45	NC_020296	A	6	6	21085	21090	100 %	0 %	0 %	0 %	451816557
46	NC_020296	T	7	7	21328	21334	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
47	NC_020296	T	6	6	21351	21356	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
48	NC_020296	T	7	7	21375	21381	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
49	NC_020296	T	6	6	21426	21431	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
50	NC_020296	T	6	6	22179	22184	0 %	100 %	0 %	0 %	451816559
51	NC_020296	C	6	6	23875	23880	0 %	0 %	0 %	100 %	451816561
52	NC_020296	A	6	6	24212	24217	100 %	0 %	0 %	0 %	451816563
53	NC_020296	A	6	6	25282	25287	100 %	0 %	0 %	0 %	451816565
54	NC_020296	T	6	6	26371	26376	0 %	100 %	0 %	0 %	451816566
55	NC_020296	A	6	6	27216	27221	100 %	0 %	0 %	0 %	451816567
56	NC_020296	T	6	6	27763	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020296	T	6	6	27796	27801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020296	T	6	6	28312	28317	0 %	100 %	0 %	0 %	451816569
59	NC_020296	A	6	6	28473	28478	100 %	0 %	0 %	0 %	451816569
60	NC_020296	T	7	7	28851	28857	0 %	100 %	0 %	0 %	451816569
61	NC_020296	T	6	6	29301	29306	0 %	100 %	0 %	0 %	451816569
62	NC_020296	A	6	6	29503	29508	100 %	0 %	0 %	0 %	451816569
63	NC_020296	T	6	6	30172	30177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020296	T	6	6	30196	30201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020296	A	6	6	30765	30770	100 %	0 %	0 %	0 %	451816571
66	NC_020296	G	7	7	31004	31010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020296	A	6	6	31417	31422	100 %	0 %	0 %	0 %	451816572
68	NC_020296	A	8	8	31633	31640	100 %	0 %	0 %	0 %	451816572
69	NC_020296	A	6	6	31715	31720	100 %	0 %	0 %	0 %	451816572
70	NC_020296	A	7	7	32168	32174	100 %	0 %	0 %	0 %	451816573
71	NC_020296	A	6	6	33303	33308	100 %	0 %	0 %	0 %	451816575
72	NC_020296	T	6	6	33484	33489	0 %	100 %	0 %	0 %	451816576
73	NC_020296	T	6	6	34137	34142	0 %	100 %	0 %	0 %	451816577
74	NC_020296	C	6	6	34553	34558	0 %	0 %	0 %	100 %	451816577
75	NC_020296	A	7	7	34725	34731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020296	T	6	6	36125	36130	0 %	100 %	0 %	0 %	451816579
77	NC_020296	C	6	6	36378	36383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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81	NC_020296	A	6	6	37484	37489	100 %	0 %	0 %	0 %	451816581
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83	NC_020296	G	8	8	37647	37654	0 %	0 %	100 %	0 %	451816581
84	NC_020296	T	6	6	38123	38128	0 %	100 %	0 %	0 %	451816581
85	NC_020296	A	6	6	38156	38161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020296	T	6	6	38986	38991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020296	A	6	6	39096	39101	100 %	0 %	0 %	0 %	451816583
88	NC_020296	A	6	6	39230	39235	100 %	0 %	0 %	0 %	451816583
89	NC_020296	T	6	6	40069	40074	0 %	100 %	0 %	0 %	451816584
90	NC_020296	T	7	7	40224	40230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92	NC_020296	T	6	6	40573	40578	0 %	100 %	0 %	0 %	451816585
93	NC_020296	A	6	6	40807	40812	100 %	0 %	0 %	0 %	451816585
94	NC_020296	A	6	6	41168	41173	100 %	0 %	0 %	0 %	451816585
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96	NC_020296	C	7	7	41667	41673	0 %	0 %	0 %	100 %	451816586
97	NC_020296	G	6	6	42322	42327	0 %	0 %	100 %	0 %	451816586
98	NC_020296	A	6	6	42429	42434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020296	A	6	6	43024	43029	100 %	0 %	0 %	0 %	451816587
100	NC_020296	C	6	6	43254	43259	0 %	0 %	0 %	100 %	451816588
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102	NC_020296	A	6	6	43716	43721	100 %	0 %	0 %	0 %	451816589
103	NC_020296	T	7	7	44479	44485	0 %	100 %	0 %	0 %	451816590
104	NC_020296	A	6	6	44963	44968	100 %	0 %	0 %	0 %	451816590
105	NC_020296	A	6	6	45101	45106	100 %	0 %	0 %	0 %	451816590
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108	NC_020296	G	6	6	46403	46408	0 %	0 %	100 %	0 %	451816591
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111	NC_020296	C	6	6	48069	48074	0 %	0 %	0 %	100 %	451816592
112	NC_020296	T	6	6	48995	49000	0 %	100 %	0 %	0 %	451816593
113	NC_020296	A	7	7	49282	49288	100 %	0 %	0 %	0 %	451816593
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115	NC_020296	A	6	6	50845	50850	100 %	0 %	0 %	0 %	451816595
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123	NC_020296	A	6	6	55621	55626	100 %	0 %	0 %	0 %	451816599
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126	NC_020296	G	9	9	56649	56657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_020296	T	7	7	67089	67095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020296	A	6	6	67119	67124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.