MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020294	TTTTTC	2	12	3293	3304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822724
2	NC_020294	AATAAA	2	12	3336	3347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451822724
3	NC_020294	CTGATG	2	12	4147	4158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451822724
4	NC_020294	TCAAAT	2	12	6253	6264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822726
5	NC_020294	ATTTTT	2	12	10259	10270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822728
6	NC_020294	TTTTCT	2	12	10491	10502	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822728
7	NC_020294	AATGTT	2	12	10515	10526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822728
8	NC_020294	TGCATA	2	12	11152	11163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822729
9	NC_020294	GTATTT	2	12	12800	12811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822730
10	NC_020294	CCCTTG	2	12	17787	17798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451822734
11	NC_020294	TGAGGA	2	12	17822	17833	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451822734
12	NC_020294	TTTTCT	2	12	19407	19418	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822737
13	NC_020294	AATTAA	2	12	20121	20132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822738
14	NC_020294	ATGGTT	2	12	21761	21772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822741
15	NC_020294	ATTTTG	2	12	25233	25244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822744
16	NC_020294	TATTTA	2	12	26552	26563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822746
17	NC_020294	CAGTTA	2	12	26942	26953	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822746
18	NC_020294	AAAGTG	2	12	27530	27541	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451822747
19	NC_020294	TCCTTG	2	12	30256	30267	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451822750
20	NC_020294	CTTTAG	2	12	35019	35030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822755
21	NC_020294	TATTGA	2	12	38378	38389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822757
22	NC_020294	ATCTAA	2	12	45667	45678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822763
23	NC_020294	TTTTGA	2	12	46858	46869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822765
24	NC_020294	TTTTAT	2	12	51433	51444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822769
25	NC_020294	TAAGAA	2	12	52628	52639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822772
26	NC_020294	ATATCT	2	12	57619	57630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451822777
27	NC_020294	TGCATC	2	12	61217	61228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451822779
28	NC_020294	TATCAT	2	12	62057	62068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451822780
29	NC_020294	GTCTTG	2	12	64111	64122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451822781
30	NC_020294	TTTAAT	2	12	65419	65430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822782
31	NC_020294	ATTTTT	2	12	70108	70119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822788
32	NC_020294	TGCATT	2	12	70863	70874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822788
33	NC_020294	TAAATT	2	12	70914	70925	50 %	50 %	0 %	0 %	451822788
34	NC_020294	TATTTT	2	12	71821	71832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822789
35	NC_020294	ATAAAG	2	12	73649	73660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822790
36	NC_020294	CTAGTT	2	12	75401	75412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822793
37	NC_020294	CTATAG	2	12	79991	80002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822796
38	NC_020294	CAGAAA	2	12	80315	80326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451822796
39	NC_020294	CTTCTG	2	12	89572	89583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451822802
40	NC_020294	AGTGAT	2	12	91857	91868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822804
41	NC_020294	AAATTT	2	12	93203	93214	50 %	50 %	0 %	0 %	451822805
42	NC_020294	ATCAGA	2	12	97803	97814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451822807
43	NC_020294	ACATCT	2	12	97870	97881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822807
44	NC_020294	TAAAAA	2	12	98106	98117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451822807
45	NC_020294	TACTTC	2	12	98439	98450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451822807
46	NC_020294	TCACCA	2	12	101632	101643	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451822810
47	NC_020294	GGATAG	2	12	104909	104920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451822813
48	NC_020294	ATAAAT	2	12	105724	105735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822814
49	NC_020294	ATATAG	2	12	108252	108263	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822817
50	NC_020294	ATACAT	2	12	110520	110531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822820
51	NC_020294	TAATTA	2	12	115140	115151	50 %	50 %	0 %	0 %	451822823
52	NC_020294	CATAGT	2	12	118167	118178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822826
53	NC_020294	TGGCAT	2	12	119592	119603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451822827
54	NC_020294	GTTTCT	2	12	123250	123261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451822831
55	NC_020294	TAATAT	2	12	124521	124532	50 %	50 %	0 %	0 %	451822832
56	NC_020294	TATTTT	2	12	131423	131434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822838
57	NC_020294	TCTAAG	2	12	132494	132505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822839
58	NC_020294	AGAAAG	2	12	137203	137214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822843
59	NC_020294	ATTTAA	2	12	137890	137901	50 %	50 %	0 %	0 %	451822843
60	NC_020294	TATTAA	2	12	137926	137937	50 %	50 %	0 %	0 %	451822843
61	NC_020294	ATTATA	2	12	139386	139397	50 %	50 %	0 %	0 %	451822844
62	NC_020294	AGTTTG	2	12	140749	140760	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822845
63	NC_020294	AGCTGG	2	12	141235	141246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451822846
64	NC_020294	GTTCCA	2	12	141305	141316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451822846
65	NC_020294	AGAATC	2	12	141492	141503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451822846
66	NC_020294	TTAGAT	2	12	143440	143451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822848
67	NC_020294	GTTTCT	2	12	146127	146138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451822850
68	NC_020294	GATGTA	2	12	147429	147440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822850
69	NC_020294	GTTTAG	2	12	147619	147630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822850
70	NC_020294	ATCTAG	2	12	148180	148191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822851
71	NC_020294	TCTAAT	2	12	149943	149954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451822851
72	NC_020294	TCAAAT	2	12	150081	150092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822851
73	NC_020294	GTATTG	2	12	151497	151508	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822852
74	NC_020294	ATGTTT	2	12	151768	151779	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822852
75	NC_020294	AAAATA	2	12	153114	153125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451822853
76	NC_020294	GAGCCA	2	12	153343	153354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822854
77	NC_020294	TAAGAA	2	12	160661	160672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822860
78	NC_020294	TTTTAT	2	12	167292	167303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822864
79	NC_020294	TTTTAT	2	12	168257	168268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822866
80	NC_020294	ATTGGT	2	12	174132	174143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822869
81	NC_020294	TTATTT	2	12	175179	175190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822871
82	NC_020294	TAAATA	2	12	177308	177319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822873
83	NC_020294	TTAGTT	2	12	178837	178848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822874
84	NC_020294	AGATGA	2	12	178923	178934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451822874
85	NC_020294	AGTATA	2	12	179649	179660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822875
86	NC_020294	TTTTCT	2	12	196027	196038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822886
87	NC_020294	TTCATT	2	12	197453	197464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822888
88	NC_020294	ATTGGT	2	12	198663	198674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822888
89	NC_020294	AATGAT	2	12	204785	204796	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822896
90	NC_020294	TTATTT	2	12	205998	206009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822897
91	NC_020294	AATATC	2	12	207496	207507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822898
92	NC_020294	TATGTT	2	12	208238	208249	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822899
93	NC_020294	ATTGTA	2	12	211529	211540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822902
94	NC_020294	TAAATT	2	12	213809	213820	50 %	50 %	0 %	0 %	451822903
95	NC_020294	TTCTTA	2	12	217719	217730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822906
96	NC_020294	AGTTGG	2	12	219564	219575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451822907
97	NC_020294	GATTCT	2	12	223214	223225	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822911
98	NC_020294	GAAGAG	2	12	223491	223502	50 %	0 %	50 %	0 %	451822911
99	NC_020294	ATTTTA	2	12	229150	229161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822913
100	NC_020294	TATTTT	2	12	229541	229552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822913
101	NC_020294	TTCTTT	2	12	240906	240917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822920
102	NC_020294	TATTAA	2	12	250039	250050	50 %	50 %	0 %	0 %	451822928
103	NC_020294	TATTTT	2	12	252481	252492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822931
104	NC_020294	ATCTTT	2	12	254641	254652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822933
105	NC_020294	ATAGTG	2	12	254922	254933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822933
106	NC_020294	TTCTAT	2	12	259505	259516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822938
107	NC_020294	AGATTT	2	12	261186	261197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822939
108	NC_020294	TATTTT	2	12	264282	264293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822943
109	NC_020294	TTTCAG	2	12	265030	265041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822944
110	NC_020294	CTATAA	2	12	266330	266341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822945
111	NC_020294	CATATA	2	12	269679	269690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822947
112	NC_020294	AGCTGG	2	12	272598	272609	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451822950
113	NC_020294	ATGGAT	2	12	278829	278840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822954
114	NC_020294	AAATTC	2	12	279635	279646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451822955
115	NC_020294	ATTGCT	2	12	283028	283039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822958
116	NC_020294	AGATAA	2	12	283198	283209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822958
117	NC_020294	ATTGAA	2	12	283749	283760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822959
118	NC_020294	ACACCA	2	12	286948	286959	50 %	0 %	0 %	50 %	451822960
119	NC_020294	GAATTA	2	12	291997	292008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822966
120	NC_020294	AGATAA	2	12	294425	294436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822968
121	NC_020294	AGTTGT	2	12	295405	295416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451822970
122	NC_020294	TAATTT	2	12	295443	295454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822970
123	NC_020294	TGGATA	2	12	299555	299566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822975
124	NC_020294	TTTAGT	2	12	301664	301675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822978
125	NC_020294	ATATTT	2	12	302070	302081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822978
126	NC_020294	ATTAAT	2	12	302666	302677	50 %	50 %	0 %	0 %	451822979
127	NC_020294	AATGTT	2	12	302934	302945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822980
128	NC_020294	TAAATA	2	12	303250	303261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822980
129	NC_020294	TCATGG	2	12	304026	304037	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451822981
130	NC_020294	ATATAG	2	12	305586	305597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822983
131	NC_020294	TTAAAA	2	12	309798	309809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822986
132	NC_020294	TAGGGG	2	12	312390	312401	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	451822990
133	NC_020294	TTCTTT	2	12	316385	316396	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451822993
134	NC_020294	CTGCTA	2	12	316697	316708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451822993
135	NC_020294	TTAATT	2	12	316862	316873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822993
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137	NC_020294	AACCTC	2	12	318148	318159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451822996
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139	NC_020294	CATCTG	2	12	320040	320051	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451822997
140	NC_020294	TTATTG	2	12	320226	320237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822997
141	NC_020294	AATATT	2	12	323371	323382	50 %	50 %	0 %	0 %	451823001
142	NC_020294	AATTTT	2	12	323565	323576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451823001
143	NC_020294	GATTGA	2	12	329164	329175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451823007
144	NC_020294	GGTATA	2	12	330610	330621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451823009
145	NC_020294	AAAACA	2	12	330699	330710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451823009
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147	NC_020294	AGATTT	2	12	333426	333437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451823011
148	NC_020294	ATTTTA	2	12	334246	334257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451823013
149	NC_020294	GCAATG	2	12	335654	335665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451823014
150	NC_020294	TTGGTC	2	12	335979	335990	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451823014
151	NC_020294	AATATT	3	18	339619	339636	50 %	50 %	0 %	0 %	451823016
152	NC_020294	ATATAG	2	12	340328	340339	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451823016
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157	NC_020294	TCTTGA	2	12	347617	347628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451823021
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159	NC_020294	GAGTCT	2	12	349012	349023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451823023
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165	NC_020294	TAAAAA	2	12	358943	358954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451823029
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180	NC_020294	CCAGTA	2	12	396193	396204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451823066
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189	NC_020294	TTTATA	2	12	421153	421164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451823089
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220	NC_020294	ACCAAC	2	12	479864	479875	50 %	0 %	0 %	50 %	451823137
221	NC_020294	AATTAT	2	12	480028	480039	50 %	50 %	0 %	0 %	451823138
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232	NC_020294	TTTTGC	2	12	508296	508307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451823156
233	NC_020294	AACAAA	2	12	508814	508825	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451823157
234	NC_020294	TTATAA	2	12	514206	514217	50 %	50 %	0 %	0 %	451823163
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236	NC_020294	AATCAT	2	12	515682	515693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451823165
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349	NC_020294	TATTTT	2	12	756427	756438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451823380
350	NC_020294	AATTCA	2	12	757171	757182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451823381
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353	NC_020294	CAAAGA	2	12	758748	758759	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451823382
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405	NC_020294	CATGAA	2	12	832155	832166	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451823461

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.