MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020293	GTCC	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	457866852
2	NC_020293	GTCG	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	457866852
3	NC_020293	GCGG	2	8	1264	1271	0 %	0 %	75 %	25 %	457866852
4	NC_020293	GGCC	2	8	1285	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
5	NC_020293	CGTC	2	8	1913	1920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020293	TGAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020293	CGAG	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020293	GGCT	2	8	2472	2479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020293	TGCG	2	8	2740	2747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020293	CGCC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	25 %	75 %	457866853
11	NC_020293	CCGG	3	12	3149	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	457866853
12	NC_020293	TCCT	2	8	3307	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	457866853
13	NC_020293	CGGC	2	8	3477	3484	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
14	NC_020293	CGCC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	25 %	75 %	457866854
15	NC_020293	CCGG	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
16	NC_020293	ACCC	2	8	4172	4179	25 %	0 %	0 %	75 %	457866854
17	NC_020293	GCGG	2	8	4241	4248	0 %	0 %	75 %	25 %	457866854
18	NC_020293	CAGT	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	457866854
19	NC_020293	CCGG	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
20	NC_020293	CGGC	2	8	6362	6369	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
21	NC_020293	GTAA	2	8	6811	6818	50 %	25 %	25 %	0 %	457866856
22	NC_020293	GCCG	2	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
23	NC_020293	ACGG	2	8	7706	7713	25 %	0 %	50 %	25 %	457866857
24	NC_020293	CGGT	2	8	7800	7807	0 %	25 %	50 %	25 %	457866857
25	NC_020293	GGGT	2	8	7884	7891	0 %	25 %	75 %	0 %	457866857
26	NC_020293	CGGC	2	8	8721	8728	0 %	0 %	50 %	50 %	457866858
27	NC_020293	GGCG	2	8	8905	8912	0 %	0 %	75 %	25 %	457866858
28	NC_020293	GCGG	2	8	8945	8952	0 %	0 %	75 %	25 %	457866858
29	NC_020293	GACG	2	8	9504	9511	25 %	0 %	50 %	25 %	457866859
30	NC_020293	TGCG	2	8	10071	10078	0 %	25 %	50 %	25 %	457866859
31	NC_020293	CGGC	2	8	10836	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	457866861
32	NC_020293	CGAC	2	8	11474	11481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020293	GCTG	2	8	12225	12232	0 %	25 %	50 %	25 %	457866862
34	NC_020293	CGCC	2	8	12341	12348	0 %	0 %	25 %	75 %	457866862
35	NC_020293	GCCG	2	8	12814	12821	0 %	0 %	50 %	50 %	457866863
36	NC_020293	GCTG	2	8	13077	13084	0 %	25 %	50 %	25 %	457866863
37	NC_020293	CGGC	2	8	13739	13746	0 %	0 %	50 %	50 %	457866864
38	NC_020293	CGCC	2	8	13749	13756	0 %	0 %	25 %	75 %	457866864
39	NC_020293	CCGG	2	8	13820	13827	0 %	0 %	50 %	50 %	457866864
40	NC_020293	CGTC	2	8	13889	13896	0 %	25 %	25 %	50 %	457866864
41	NC_020293	GACG	2	8	14548	14555	25 %	0 %	50 %	25 %	457866865
42	NC_020293	CTCG	2	8	14832	14839	0 %	25 %	25 %	50 %	457866865
43	NC_020293	CCCG	2	8	15182	15189	0 %	0 %	25 %	75 %	457866866
44	NC_020293	GCCG	2	8	15256	15263	0 %	0 %	50 %	50 %	457866866
45	NC_020293	CACG	2	8	15371	15378	25 %	0 %	25 %	50 %	457866866
46	NC_020293	CCGG	2	8	16243	16250	0 %	0 %	50 %	50 %	457866866
47	NC_020293	GCGG	2	8	16373	16380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020293	GGGC	2	8	16514	16521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020293	CTGC	2	8	16548	16555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020293	CTGC	2	8	16863	16870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020293	CGGT	2	8	16998	17005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020293	CCGG	2	8	17062	17069	0 %	0 %	50 %	50 %	457866867
53	NC_020293	GCGG	2	8	17474	17481	0 %	0 %	75 %	25 %	457866867
54	NC_020293	GCCC	2	8	17626	17633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_020293	CGGC	2	8	17747	17754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020293	CGGC	2	8	18722	18729	0 %	0 %	50 %	50 %	457866869
57	NC_020293	GCTG	2	8	18805	18812	0 %	25 %	50 %	25 %	457866869
58	NC_020293	TCGC	2	8	18942	18949	0 %	25 %	25 %	50 %	457866869
59	NC_020293	GTGC	2	8	19124	19131	0 %	25 %	50 %	25 %	457866869
60	NC_020293	GGGC	2	8	19265	19272	0 %	0 %	75 %	25 %	457866869
61	NC_020293	GGCG	2	8	19348	19355	0 %	0 %	75 %	25 %	457866869
62	NC_020293	CGGC	2	8	19471	19478	0 %	0 %	50 %	50 %	457866869
63	NC_020293	CGGG	2	8	19791	19798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020293	CGGG	2	8	19846	19853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020293	TCGG	2	8	20041	20048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020293	GCCG	2	8	20276	20283	0 %	0 %	50 %	50 %	457866870
67	NC_020293	ATGG	2	8	20616	20623	25 %	25 %	50 %	0 %	457866871
68	NC_020293	AGCC	2	8	20820	20827	25 %	0 %	25 %	50 %	457866871
69	NC_020293	TCGC	2	8	21009	21016	0 %	25 %	25 %	50 %	457866872
70	NC_020293	CGGC	2	8	21531	21538	0 %	0 %	50 %	50 %	457866872
71	NC_020293	GTGG	2	8	21693	21700	0 %	25 %	75 %	0 %	457866873
72	NC_020293	GGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	75 %	25 %	457866873
73	NC_020293	GGCG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	75 %	25 %	457866873
74	NC_020293	GTGC	2	8	22031	22038	0 %	25 %	50 %	25 %	457866873
75	NC_020293	CTGC	2	8	22172	22179	0 %	25 %	25 %	50 %	457866873
76	NC_020293	CCGG	2	8	22628	22635	0 %	0 %	50 %	50 %	457866873
77	NC_020293	CGGC	2	8	22979	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	457866874
78	NC_020293	TGGG	2	8	23648	23655	0 %	25 %	75 %	0 %	457866875
79	NC_020293	CCGG	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	457866875
80	NC_020293	GAGT	2	8	24547	24554	25 %	25 %	50 %	0 %	457866875
81	NC_020293	CGGC	2	8	24825	24832	0 %	0 %	50 %	50 %	457866875
82	NC_020293	GGTG	2	8	24834	24841	0 %	25 %	75 %	0 %	457866875
83	NC_020293	GCCG	2	8	25505	25512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020293	ACGT	2	8	25533	25540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020293	GCGG	2	8	25666	25673	0 %	0 %	75 %	25 %	457866877
86	NC_020293	CGGG	2	8	25817	25824	0 %	0 %	75 %	25 %	457866877
87	NC_020293	CGGG	2	8	25957	25964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020293	TCCG	2	8	26343	26350	0 %	25 %	25 %	50 %	457866880
89	NC_020293	GGGC	2	8	26415	26422	0 %	0 %	75 %	25 %	457866880
90	NC_020293	CGGC	2	8	26544	26551	0 %	0 %	50 %	50 %	457866879
91	NC_020293	GGGC	2	8	26852	26859	0 %	0 %	75 %	25 %	457866881
92	NC_020293	GAAG	2	8	28603	28610	50 %	0 %	50 %	0 %	457866882
93	NC_020293	AGCG	2	8	28613	28620	25 %	0 %	50 %	25 %	457866882
94	NC_020293	GAAG	2	8	28720	28727	50 %	0 %	50 %	0 %	457866882
95	NC_020293	GACG	2	8	28987	28994	25 %	0 %	50 %	25 %	457866882
96	NC_020293	CGGC	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	457866882
97	NC_020293	AACG	2	8	29223	29230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020293	ACAG	2	8	29269	29276	50 %	0 %	25 %	25 %	457866883
99	NC_020293	CCCG	2	8	29475	29482	0 %	0 %	25 %	75 %	457866883
100	NC_020293	ACCT	2	8	29855	29862	25 %	25 %	0 %	50 %	457866883
101	NC_020293	CCGG	2	8	30618	30625	0 %	0 %	50 %	50 %	457866883
102	NC_020293	CCCT	2	8	30718	30725	0 %	25 %	0 %	75 %	457866883
103	NC_020293	CGGC	2	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	457866883
104	NC_020293	TGGA	2	8	31897	31904	25 %	25 %	50 %	0 %	457866884
105	NC_020293	GCCG	2	8	32324	32331	0 %	0 %	50 %	50 %	457866884
106	NC_020293	CTGA	2	8	32345	32352	25 %	25 %	25 %	25 %	457866884
107	NC_020293	GGCC	2	8	32569	32576	0 %	0 %	50 %	50 %	457866885
108	NC_020293	CGCC	2	8	32641	32648	0 %	0 %	25 %	75 %	457866885
109	NC_020293	CCGC	2	8	33116	33123	0 %	0 %	25 %	75 %	457866885
110	NC_020293	ACGG	2	8	33146	33153	25 %	0 %	50 %	25 %	457866885
111	NC_020293	CCGG	2	8	33354	33361	0 %	0 %	50 %	50 %	457866885
112	NC_020293	CGGT	2	8	33825	33832	0 %	25 %	50 %	25 %	457866886
113	NC_020293	CTGG	2	8	34008	34015	0 %	25 %	50 %	25 %	457866886
114	NC_020293	TGCT	2	8	34031	34038	0 %	50 %	25 %	25 %	457866886
115	NC_020293	GCCC	2	8	34221	34228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_020293	GGGC	2	8	34237	34244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020293	CGGT	2	8	34434	34441	0 %	25 %	50 %	25 %	457866887
118	NC_020293	TCGG	2	8	34593	34600	0 %	25 %	50 %	25 %	457866887
119	NC_020293	CGGC	2	8	34633	34640	0 %	0 %	50 %	50 %	457866887
120	NC_020293	GCGG	2	8	34697	34704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020293	GGGC	2	8	34814	34821	0 %	0 %	75 %	25 %	457866888
122	NC_020293	ACGG	2	8	35071	35078	25 %	0 %	50 %	25 %	457866888
123	NC_020293	ACGG	2	8	35086	35093	25 %	0 %	50 %	25 %	457866888
124	NC_020293	CTTC	2	8	35651	35658	0 %	50 %	0 %	50 %	457866888
125	NC_020293	CGGC	2	8	35788	35795	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
126	NC_020293	CGTC	2	8	36170	36177	0 %	25 %	25 %	50 %	457866888
127	NC_020293	GGTG	2	8	36872	36879	0 %	25 %	75 %	0 %	457866888
128	NC_020293	ACGT	2	8	37036	37043	25 %	25 %	25 %	25 %	457866888
129	NC_020293	CCGG	2	8	37233	37240	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
130	NC_020293	GCAC	2	8	37276	37283	25 %	0 %	25 %	50 %	457866888
131	NC_020293	GAGG	2	8	37482	37489	25 %	0 %	75 %	0 %	457866888
132	NC_020293	CCGG	2	8	37645	37652	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
133	NC_020293	GCCG	2	8	37965	37972	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
134	NC_020293	GCCC	2	8	38336	38343	0 %	0 %	25 %	75 %	457866888
135	NC_020293	GGTC	2	8	38939	38946	0 %	25 %	50 %	25 %	457866888
136	NC_020293	CTGC	2	8	39003	39010	0 %	25 %	25 %	50 %	457866888
137	NC_020293	CGCC	2	8	39152	39159	0 %	0 %	25 %	75 %	457866888
138	NC_020293	CCCG	2	8	39378	39385	0 %	0 %	25 %	75 %	457866888
139	NC_020293	TCGA	2	8	39685	39692	25 %	25 %	25 %	25 %	457866888
140	NC_020293	GCGG	2	8	40231	40238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020293	CGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020293	GGGC	2	8	41033	41040	0 %	0 %	75 %	25 %	457866889
143	NC_020293	GGGA	2	8	41065	41072	25 %	0 %	75 %	0 %	457866889
144	NC_020293	CGGG	2	8	41304	41311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.