MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020293	CGTC	2	8	1913	1920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020293	TGAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020293	CGAG	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020293	GGCT	2	8	2472	2479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020293	TGCG	2	8	2740	2747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020293	CGAC	2	8	11474	11481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020293	GCGG	2	8	16373	16380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020293	GGGC	2	8	16514	16521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020293	CTGC	2	8	16548	16555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020293	CTGC	2	8	16863	16870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020293	CGGT	2	8	16998	17005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020293	GCCC	2	8	17626	17633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020293	CGGC	2	8	17747	17754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020293	CGGG	2	8	19791	19798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020293	CGGG	2	8	19846	19853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020293	TCGG	2	8	20041	20048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020293	GCCG	2	8	25505	25512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020293	ACGT	2	8	25533	25540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020293	CGGG	2	8	25957	25964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020293	AACG	2	8	29223	29230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020293	GCCC	2	8	34221	34228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_020293	GGGC	2	8	34237	34244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020293	GCGG	2	8	34697	34704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020293	GCGG	2	8	40231	40238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020293	CGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020293	CGGG	2	8	41304	41311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020293	CCGG	2	8	41344	41351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020293	GGGA	2	8	43140	43147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020293	CGGG	2	8	46427	46434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020293	GCAC	2	8	47820	47827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020293	CGGG	2	8	47856	47863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020293	CCGG	2	8	47929	47936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020293	CCGG	2	8	48044	48051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020293	GCCC	2	8	48170	48177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020293	CCGG	2	8	48250	48257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020293	GGGC	2	8	53699	53706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020293	CCCG	2	8	53867	53874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_020293	CCTC	2	8	53912	53919	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_020293	GGCG	2	8	53926	53933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020293	GACC	2	8	57029	57036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020293	CAGC	2	8	62551	62558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020293	CGAG	2	8	68050	68057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020293	GCCG	2	8	71548	71555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020293	GGGC	2	8	71582	71589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020293	CAGG	2	8	73139	73146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.