MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020293	CG	3	6	35	40	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
2	NC_020293	GC	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
3	NC_020293	CG	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
4	NC_020293	CG	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
5	NC_020293	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	457866852
6	NC_020293	TG	3	6	3502	3507	0 %	50 %	50 %	0 %	457866854
7	NC_020293	CG	3	6	3752	3757	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
8	NC_020293	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	457866854
9	NC_020293	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
10	NC_020293	TG	3	6	4852	4857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020293	GC	3	6	5210	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	457866855
12	NC_020293	TC	4	8	5471	5478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020293	CG	3	6	5765	5770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020293	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
15	NC_020293	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
16	NC_020293	GC	3	6	7274	7279	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
17	NC_020293	GC	3	6	7596	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
18	NC_020293	GC	3	6	9316	9321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020293	AG	3	6	9604	9609	50 %	0 %	50 %	0 %	457866859
20	NC_020293	GC	3	6	10293	10298	0 %	0 %	50 %	50 %	457866860
21	NC_020293	GC	3	6	11150	11155	0 %	0 %	50 %	50 %	457866861
22	NC_020293	TC	3	6	11465	11470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020293	GC	3	6	11511	11516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020293	CG	3	6	11621	11626	0 %	0 %	50 %	50 %	457866862
25	NC_020293	GC	3	6	12077	12082	0 %	0 %	50 %	50 %	457866862
26	NC_020293	CG	3	6	12455	12460	0 %	0 %	50 %	50 %	457866862
27	NC_020293	CG	4	8	13069	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	457866863
28	NC_020293	TC	3	6	14136	14141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020293	GC	3	6	15200	15205	0 %	0 %	50 %	50 %	457866866
30	NC_020293	GC	4	8	16523	16530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020293	CG	3	6	16975	16980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020293	GC	3	6	17581	17586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020293	GC	3	6	18277	18282	0 %	0 %	50 %	50 %	457866869
34	NC_020293	GC	3	6	19303	19308	0 %	0 %	50 %	50 %	457866869
35	NC_020293	GC	3	6	19516	19521	0 %	0 %	50 %	50 %	457866869
36	NC_020293	CG	4	8	22774	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	457866874
37	NC_020293	CG	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	457866874
38	NC_020293	CG	4	8	23673	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	457866875
39	NC_020293	CG	3	6	23899	23904	0 %	0 %	50 %	50 %	457866875
40	NC_020293	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	457866875
41	NC_020293	GC	3	6	25114	25119	0 %	0 %	50 %	50 %	457866876
42	NC_020293	GC	3	6	25298	25303	0 %	0 %	50 %	50 %	457866876
43	NC_020293	CG	3	6	25358	25363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020293	CG	3	6	25890	25895	0 %	0 %	50 %	50 %	457866877
45	NC_020293	GC	3	6	26179	26184	0 %	0 %	50 %	50 %	457866880
46	NC_020293	GA	3	6	26467	26472	50 %	0 %	50 %	0 %	457866880
47	NC_020293	GA	3	6	26570	26575	50 %	0 %	50 %	0 %	457866879
48	NC_020293	CT	3	6	26603	26608	0 %	50 %	0 %	50 %	457866879
49	NC_020293	CG	3	6	26924	26929	0 %	0 %	50 %	50 %	457866881
50	NC_020293	GC	3	6	27729	27734	0 %	0 %	50 %	50 %	457866882
51	NC_020293	GC	3	6	28249	28254	0 %	0 %	50 %	50 %	457866882
52	NC_020293	GC	3	6	28794	28799	0 %	0 %	50 %	50 %	457866882
53	NC_020293	CG	3	6	28898	28903	0 %	0 %	50 %	50 %	457866882
54	NC_020293	GC	3	6	30040	30045	0 %	0 %	50 %	50 %	457866883
55	NC_020293	GC	3	6	30305	30310	0 %	0 %	50 %	50 %	457866883
56	NC_020293	CG	3	6	30402	30407	0 %	0 %	50 %	50 %	457866883
57	NC_020293	CA	3	6	30540	30545	50 %	0 %	0 %	50 %	457866883
58	NC_020293	CG	3	6	32560	32565	0 %	0 %	50 %	50 %	457866885
59	NC_020293	CG	3	6	32927	32932	0 %	0 %	50 %	50 %	457866885
60	NC_020293	GC	3	6	33549	33554	0 %	0 %	50 %	50 %	457866886
61	NC_020293	AG	3	6	33869	33874	50 %	0 %	50 %	0 %	457866886
62	NC_020293	GT	3	6	33899	33904	0 %	50 %	50 %	0 %	457866886
63	NC_020293	CG	3	6	34212	34217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020293	GC	3	6	34395	34400	0 %	0 %	50 %	50 %	457866887
65	NC_020293	GC	3	6	35005	35010	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
66	NC_020293	GC	3	6	35491	35496	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
67	NC_020293	CG	3	6	35528	35533	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
68	NC_020293	GC	3	6	35599	35604	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
69	NC_020293	GC	3	6	35679	35684	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
70	NC_020293	GC	3	6	35970	35975	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
71	NC_020293	CG	4	8	37298	37305	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
72	NC_020293	GC	3	6	37390	37395	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
73	NC_020293	GC	3	6	37682	37687	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
74	NC_020293	GC	3	6	38206	38211	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
75	NC_020293	CG	3	6	38579	38584	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
76	NC_020293	GC	3	6	38608	38613	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
77	NC_020293	CG	3	6	38777	38782	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
78	NC_020293	CG	3	6	39227	39232	0 %	0 %	50 %	50 %	457866888
79	NC_020293	AG	3	6	39892	39897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020293	AG	3	6	40003	40008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020293	GC	3	6	40014	40019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020293	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020293	GC	3	6	40736	40741	0 %	0 %	50 %	50 %	457866889
84	NC_020293	CG	3	6	41528	41533	0 %	0 %	50 %	50 %	457866890
85	NC_020293	CA	3	6	41894	41899	50 %	0 %	0 %	50 %	457866891
86	NC_020293	GC	3	6	42452	42457	0 %	0 %	50 %	50 %	457866892
87	NC_020293	GC	3	6	42734	42739	0 %	0 %	50 %	50 %	457866893
88	NC_020293	GC	3	6	43563	43568	0 %	0 %	50 %	50 %	457866894
89	NC_020293	CG	3	6	43596	43601	0 %	0 %	50 %	50 %	457866894
90	NC_020293	CG	3	6	44284	44289	0 %	0 %	50 %	50 %	457866896
91	NC_020293	CG	3	6	44804	44809	0 %	0 %	50 %	50 %	457866896
92	NC_020293	GC	3	6	45397	45402	0 %	0 %	50 %	50 %	457866898
93	NC_020293	CG	3	6	45768	45773	0 %	0 %	50 %	50 %	457866898
94	NC_020293	CG	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	457866898
95	NC_020293	CG	3	6	46095	46100	0 %	0 %	50 %	50 %	457866898
96	NC_020293	GC	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	457866899
97	NC_020293	TG	3	6	46720	46725	0 %	50 %	50 %	0 %	457866899
98	NC_020293	GC	3	6	46981	46986	0 %	0 %	50 %	50 %	457866899
99	NC_020293	GC	3	6	47459	47464	0 %	0 %	50 %	50 %	457866899
100	NC_020293	GC	4	8	47554	47561	0 %	0 %	50 %	50 %	457866899
101	NC_020293	GA	3	6	48736	48741	50 %	0 %	50 %	0 %	457866901
102	NC_020293	CG	4	8	48883	48890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020293	GC	4	8	49692	49699	0 %	0 %	50 %	50 %	457866902
104	NC_020293	CG	3	6	50045	50050	0 %	0 %	50 %	50 %	457866903
105	NC_020293	AC	3	6	50229	50234	50 %	0 %	0 %	50 %	457866904
106	NC_020293	GC	3	6	50438	50443	0 %	0 %	50 %	50 %	457866904
107	NC_020293	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	457866904
108	NC_020293	GT	3	6	51672	51677	0 %	50 %	50 %	0 %	457866905
109	NC_020293	CG	3	6	52030	52035	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
110	NC_020293	CG	3	6	52449	52454	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
111	NC_020293	GC	3	6	52486	52491	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
112	NC_020293	GC	3	6	52729	52734	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
113	NC_020293	CA	3	6	53299	53304	50 %	0 %	0 %	50 %	457866905
114	NC_020293	GC	3	6	53365	53370	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
115	NC_020293	GC	3	6	53563	53568	0 %	0 %	50 %	50 %	457866905
116	NC_020293	GT	3	6	53848	53853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020293	GC	3	6	54106	54111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020293	GC	3	6	54364	54369	0 %	0 %	50 %	50 %	457866906
119	NC_020293	CG	3	6	55189	55194	0 %	0 %	50 %	50 %	457866907
120	NC_020293	TC	3	6	56455	56460	0 %	50 %	0 %	50 %	457866908
121	NC_020293	GC	3	6	57041	57046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020293	CG	4	8	57375	57382	0 %	0 %	50 %	50 %	457866909
123	NC_020293	TG	3	6	58435	58440	0 %	50 %	50 %	0 %	457866909
124	NC_020293	CG	3	6	59305	59310	0 %	0 %	50 %	50 %	457866910
125	NC_020293	GC	3	6	59652	59657	0 %	0 %	50 %	50 %	457866911
126	NC_020293	CG	4	8	59786	59793	0 %	0 %	50 %	50 %	457866911
127	NC_020293	CG	3	6	59802	59807	0 %	0 %	50 %	50 %	457866911
128	NC_020293	GC	3	6	60642	60647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020293	GA	3	6	60778	60783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020293	GC	3	6	60788	60793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020293	GC	3	6	61203	61208	0 %	0 %	50 %	50 %	457866912
132	NC_020293	CG	3	6	61664	61669	0 %	0 %	50 %	50 %	457866912
133	NC_020293	CG	3	6	61963	61968	0 %	0 %	50 %	50 %	457866912
134	NC_020293	GC	3	6	63965	63970	0 %	0 %	50 %	50 %	457866915
135	NC_020293	GC	4	8	64269	64276	0 %	0 %	50 %	50 %	457866916
136	NC_020293	CG	4	8	64319	64326	0 %	0 %	50 %	50 %	457866916
137	NC_020293	GC	3	6	64696	64701	0 %	0 %	50 %	50 %	457866917
138	NC_020293	CG	4	8	65132	65139	0 %	0 %	50 %	50 %	457866917
139	NC_020293	GC	3	6	65960	65965	0 %	0 %	50 %	50 %	457866918
140	NC_020293	CA	3	6	66089	66094	50 %	0 %	0 %	50 %	457866918
141	NC_020293	CT	3	6	67841	67846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020293	TC	3	6	68746	68751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020293	AG	3	6	69800	69805	50 %	0 %	50 %	0 %	457866923
144	NC_020293	TG	3	6	71246	71251	0 %	50 %	50 %	0 %	457866925
145	NC_020293	GC	3	6	71620	71625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020293	TG	3	6	71806	71811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020293	CA	3	6	71834	71839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020293	CG	3	6	72190	72195	0 %	0 %	50 %	50 %	457866926
149	NC_020293	GC	3	6	72287	72292	0 %	0 %	50 %	50 %	457866926
150	NC_020293	GC	3	6	72575	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	457866926
151	NC_020293	AG	3	6	73217	73222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020293	GC	3	6	73244	73249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.