MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	TAACA	2	10	1882	1891	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020292	TTTTA	2	10	5975	5984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020292	TAAAT	2	10	7052	7061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020292	TAAAA	2	10	11652	11661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020292	ATAAG	2	10	11678	11687	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020292	TAAAC	2	10	12717	12726	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020292	TTCTT	2	10	12898	12907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020292	AATTA	2	10	15546	15555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020292	TTATC	2	10	80913	80922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020292	ATAAA	2	10	80975	80984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020292	CCTAA	2	10	108433	108442	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020292	ACCCC	2	10	108989	108998	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
13	NC_020292	ATATT	2	10	109478	109487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020292	TAATT	2	10	113421	113430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020292	ATTAA	2	10	113874	113883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020292	TAAAA	2	10	113961	113970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020292	ATTTT	2	10	115787	115796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	ATAAA	2	10	118957	118966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020292	TATAA	2	10	124464	124473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020292	TTCAA	2	10	125499	125508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020292	ACACT	2	10	126344	126353	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020292	TAAAA	2	10	129504	129513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	TAAAA	2	10	134569	134578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020292	CTATA	2	10	134942	134951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020292	CTTTC	2	10	135555	135564	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020292	GATTG	2	10	135651	135660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	TATAA	2	10	135819	135828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020292	TAAAT	2	10	135851	135860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.