MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	ATTTT	2	10	2147	2156	20 %	80 %	0 %	0 %	451822618
2	NC_020292	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	451822618
3	NC_020292	AATTT	2	10	4574	4583	40 %	60 %	0 %	0 %	451822619
4	NC_020292	ATTAT	2	10	10360	10369	40 %	60 %	0 %	0 %	451822622
5	NC_020292	GAAGA	2	10	10836	10845	60 %	0 %	40 %	0 %	451822622
6	NC_020292	TCTAA	2	10	14165	14174	40 %	40 %	0 %	20 %	451822626
7	NC_020292	TCTTA	2	10	15312	15321	20 %	60 %	0 %	20 %	451822627
8	NC_020292	TAAAG	2	10	15985	15994	60 %	20 %	20 %	0 %	451822629
9	NC_020292	AAAAT	2	10	16497	16506	80 %	20 %	0 %	0 %	451822630
10	NC_020292	TTACA	2	10	18613	18622	40 %	40 %	0 %	20 %	451822630
11	NC_020292	ATTAA	2	10	18629	18638	60 %	40 %	0 %	0 %	451822630
12	NC_020292	CATTT	2	10	20162	20171	20 %	60 %	0 %	20 %	451822631
13	NC_020292	AATAC	2	10	22316	22325	60 %	20 %	0 %	20 %	451822631
14	NC_020292	ATTAT	2	10	24211	24220	40 %	60 %	0 %	0 %	451822631
15	NC_020292	GACTG	2	10	24814	24823	20 %	20 %	40 %	20 %	451822632
16	NC_020292	GAATA	2	10	25509	25518	60 %	20 %	20 %	0 %	451822633
17	NC_020292	TAATG	2	10	25854	25863	40 %	40 %	20 %	0 %	451822633
18	NC_020292	TTAAA	2	10	26087	26096	60 %	40 %	0 %	0 %	451822633
19	NC_020292	TGTAT	2	10	26686	26695	20 %	60 %	20 %	0 %	451822634
20	NC_020292	ATTTT	2	10	28389	28398	20 %	80 %	0 %	0 %	451822635
21	NC_020292	AAGTT	2	10	29433	29442	40 %	40 %	20 %	0 %	451822635
22	NC_020292	TAAAT	2	10	30247	30256	60 %	40 %	0 %	0 %	451822635
23	NC_020292	ATTTA	2	10	30792	30801	40 %	60 %	0 %	0 %	451822636
24	NC_020292	AGATT	2	10	34833	34842	40 %	40 %	20 %	0 %	451822638
25	NC_020292	TAAAT	2	10	36735	36744	60 %	40 %	0 %	0 %	451822640
26	NC_020292	AGATT	2	10	37943	37952	40 %	40 %	20 %	0 %	451822641
27	NC_020292	TACAA	2	10	38032	38041	60 %	20 %	0 %	20 %	451822641
28	NC_020292	GCCTT	2	10	38426	38435	0 %	40 %	20 %	40 %	451822642
29	NC_020292	ATGCA	2	10	39749	39758	40 %	20 %	20 %	20 %	451822643
30	NC_020292	TAATG	2	10	39788	39797	40 %	40 %	20 %	0 %	451822643
31	NC_020292	AGTCA	2	10	40705	40714	40 %	20 %	20 %	20 %	451822645
32	NC_020292	AAAAT	2	10	40787	40796	80 %	20 %	0 %	0 %	451822645
33	NC_020292	TCAAA	2	10	40822	40831	60 %	20 %	0 %	20 %	451822645
34	NC_020292	AAAAT	2	10	40976	40985	80 %	20 %	0 %	0 %	451822645
35	NC_020292	AATAA	2	10	41499	41508	80 %	20 %	0 %	0 %	451822646
36	NC_020292	ATTTA	2	10	42485	42494	40 %	60 %	0 %	0 %	451822646
37	NC_020292	ATATG	2	10	43046	43055	40 %	40 %	20 %	0 %	451822646
38	NC_020292	TAAAA	2	10	43247	43256	80 %	20 %	0 %	0 %	451822646
39	NC_020292	TAAAG	2	10	43439	43448	60 %	20 %	20 %	0 %	451822646
40	NC_020292	ATGAA	2	10	43489	43498	60 %	20 %	20 %	0 %	451822646
41	NC_020292	GTATT	2	10	43948	43957	20 %	60 %	20 %	0 %	451822646
42	NC_020292	ATTGC	2	10	45114	45123	20 %	40 %	20 %	20 %	451822646
43	NC_020292	AAGAA	2	10	45281	45290	80 %	0 %	20 %	0 %	451822646
44	NC_020292	ATACA	2	10	45322	45331	60 %	20 %	0 %	20 %	451822646
45	NC_020292	GCAGA	2	10	46392	46401	40 %	0 %	40 %	20 %	451822646
46	NC_020292	TTAAA	2	10	48590	48599	60 %	40 %	0 %	0 %	451822647
47	NC_020292	ATATA	2	10	49383	49392	60 %	40 %	0 %	0 %	451822647
48	NC_020292	CAGTA	2	10	49782	49791	40 %	20 %	20 %	20 %	451822647
49	NC_020292	AATTT	2	10	50954	50963	40 %	60 %	0 %	0 %	451822647
50	NC_020292	CAAAG	2	10	51311	51320	60 %	0 %	20 %	20 %	451822647
51	NC_020292	TGAAA	2	10	54478	54487	60 %	20 %	20 %	0 %	451822651
52	NC_020292	AATTA	2	10	54651	54660	60 %	40 %	0 %	0 %	451822651
53	NC_020292	TATGA	2	10	55180	55189	40 %	40 %	20 %	0 %	451822652
54	NC_020292	AAAAT	2	10	55328	55337	80 %	20 %	0 %	0 %	451822652
55	NC_020292	TAATT	2	10	55674	55683	40 %	60 %	0 %	0 %	451822652
56	NC_020292	ACAAA	2	10	56166	56175	80 %	0 %	0 %	20 %	451822653
57	NC_020292	ATATT	2	10	56543	56552	40 %	60 %	0 %	0 %	451822653
58	NC_020292	AACTT	2	10	57042	57051	40 %	40 %	0 %	20 %	451822653
59	NC_020292	CTATA	2	10	57668	57677	40 %	40 %	0 %	20 %	451822653
60	NC_020292	TATAT	2	10	59225	59234	40 %	60 %	0 %	0 %	451822653
61	NC_020292	TGGAT	2	10	59855	59864	20 %	40 %	40 %	0 %	451822653
62	NC_020292	TATTT	2	10	60274	60283	20 %	80 %	0 %	0 %	451822654
63	NC_020292	AAATA	2	10	60745	60754	80 %	20 %	0 %	0 %	451822654
64	NC_020292	AAAAG	2	10	64763	64772	80 %	0 %	20 %	0 %	451822655
65	NC_020292	TAACT	2	10	65411	65420	40 %	40 %	0 %	20 %	451822656
66	NC_020292	TACCG	2	10	66244	66253	20 %	20 %	20 %	40 %	451822657
67	NC_020292	ATAAG	2	10	66837	66846	60 %	20 %	20 %	0 %	451822658
68	NC_020292	TAATA	2	10	66856	66865	60 %	40 %	0 %	0 %	451822658
69	NC_020292	TATCA	2	10	67315	67324	40 %	40 %	0 %	20 %	451822658
70	NC_020292	AATAA	2	10	67798	67807	80 %	20 %	0 %	0 %	451822659
71	NC_020292	ATGAT	2	10	68946	68955	40 %	40 %	20 %	0 %	451822660
72	NC_020292	CATTA	2	10	69063	69072	40 %	40 %	0 %	20 %	451822660
73	NC_020292	ATGGA	2	10	70002	70011	40 %	20 %	40 %	0 %	451822661
74	NC_020292	TATAT	2	10	72108	72117	40 %	60 %	0 %	0 %	451822662
75	NC_020292	GATAA	2	10	72689	72698	60 %	20 %	20 %	0 %	451822662
76	NC_020292	TATAT	2	10	73008	73017	40 %	60 %	0 %	0 %	451822662
77	NC_020292	AATAT	2	10	73697	73706	60 %	40 %	0 %	0 %	451822663
78	NC_020292	ATTTA	2	10	75080	75089	40 %	60 %	0 %	0 %	451822666
79	NC_020292	TTATA	2	10	76446	76455	40 %	60 %	0 %	0 %	451822667
80	NC_020292	TAAAT	2	10	76542	76551	60 %	40 %	0 %	0 %	451822667
81	NC_020292	TTTAA	2	10	76945	76954	40 %	60 %	0 %	0 %	451822668
82	NC_020292	TAAAT	2	10	78789	78798	60 %	40 %	0 %	0 %	451822669
83	NC_020292	TAAAA	2	10	78858	78867	80 %	20 %	0 %	0 %	451822669
84	NC_020292	TAAAT	2	10	80389	80398	60 %	40 %	0 %	0 %	451822670
85	NC_020292	AATTT	2	10	83311	83320	40 %	60 %	0 %	0 %	451822672
86	NC_020292	AAATG	2	10	84620	84629	60 %	20 %	20 %	0 %	451822674
87	NC_020292	GAAAT	2	10	85110	85119	60 %	20 %	20 %	0 %	451822674
88	NC_020292	AAAGC	2	10	85573	85582	60 %	0 %	20 %	20 %	451822674
89	NC_020292	GAAAA	2	10	85639	85648	80 %	0 %	20 %	0 %	451822674
90	NC_020292	ATATT	2	10	86497	86506	40 %	60 %	0 %	0 %	451822675
91	NC_020292	TAGAA	2	10	90423	90432	60 %	20 %	20 %	0 %	451822677
92	NC_020292	TACAA	2	10	91097	91106	60 %	20 %	0 %	20 %	451822678
93	NC_020292	GTGGG	2	10	92002	92011	0 %	20 %	80 %	0 %	451822678
94	NC_020292	CAGCA	2	10	92559	92568	40 %	0 %	20 %	40 %	451822679
95	NC_020292	CTTAA	2	10	94111	94120	40 %	40 %	0 %	20 %	451822681
96	NC_020292	TATTT	2	10	97242	97251	20 %	80 %	0 %	0 %	451822684
97	NC_020292	GATAG	2	10	97423	97432	40 %	20 %	40 %	0 %	451822684
98	NC_020292	AAAAC	2	10	100349	100358	80 %	0 %	0 %	20 %	451822686
99	NC_020292	TAAAT	2	10	104267	104276	60 %	40 %	0 %	0 %	451822688
100	NC_020292	CTTCA	2	10	105358	105367	20 %	40 %	0 %	40 %	451822690
101	NC_020292	CTGTT	2	10	107252	107261	0 %	60 %	20 %	20 %	451822693
102	NC_020292	ATTTA	2	10	107294	107303	40 %	60 %	0 %	0 %	451822693
103	NC_020292	CTAAT	2	10	110284	110293	40 %	40 %	0 %	20 %	451822696
104	NC_020292	CTTCT	2	10	110470	110479	0 %	60 %	0 %	40 %	451822696
105	NC_020292	AAGTA	2	10	112468	112477	60 %	20 %	20 %	0 %	451822696
106	NC_020292	ATTTT	2	10	114925	114934	20 %	80 %	0 %	0 %	451822698
107	NC_020292	TTCTT	2	10	116109	116118	0 %	80 %	0 %	20 %	451822700
108	NC_020292	TACTG	2	10	116931	116940	20 %	40 %	20 %	20 %	451822700
109	NC_020292	ATTTC	2	10	118675	118684	20 %	60 %	0 %	20 %	451822700
110	NC_020292	TAATC	2	10	118988	118997	40 %	40 %	0 %	20 %	451822701
111	NC_020292	TTTTG	2	10	125240	125249	0 %	80 %	20 %	0 %	451822706
112	NC_020292	ATTTT	2	10	127850	127859	20 %	80 %	0 %	0 %	451822708
113	NC_020292	CTATT	2	10	129171	129180	20 %	60 %	0 %	20 %	451822709
114	NC_020292	TATTT	2	10	130855	130864	20 %	80 %	0 %	0 %	451822712
115	NC_020292	TTCAA	2	10	130880	130889	40 %	40 %	0 %	20 %	451822712
116	NC_020292	ATTGA	2	10	131365	131374	40 %	40 %	20 %	0 %	451822713
117	NC_020292	AACCC	2	10	131606	131615	40 %	0 %	0 %	60 %	451822714
118	NC_020292	AATTT	2	10	132099	132108	40 %	60 %	0 %	0 %	451822715
119	NC_020292	TCTTT	2	10	132174	132183	0 %	80 %	0 %	20 %	451822715
120	NC_020292	AAAAT	2	10	133123	133132	80 %	20 %	0 %	0 %	451822716
121	NC_020292	TTTTG	2	10	134208	134217	0 %	80 %	20 %	0 %	451822717
122	NC_020292	TTTCA	2	10	134433	134442	20 %	60 %	0 %	20 %	451822717

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.