MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	TAAT	2	8	11	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020292	TCTA	2	8	1273	1280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020292	CTTA	2	8	1818	1825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020292	ATTT	2	8	3793	3800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020292	ATTT	2	8	3963	3970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020292	CATT	2	8	4219	4226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020292	TATT	2	8	5888	5895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020292	TTAT	2	8	6038	6045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020292	TGAA	2	8	6145	6152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020292	ATTT	2	8	6216	6223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020292	CTTA	2	8	6731	6738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020292	CTTT	2	8	6783	6790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020292	CTTT	2	8	6913	6920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020292	ATTA	2	8	7123	7130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020292	TATT	2	8	7172	7179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020292	ATTA	2	8	8790	8797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020292	ATTA	2	8	8889	8896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	GTAA	2	8	9037	9044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020292	TAAT	3	12	9063	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020292	AAAT	2	8	9249	9256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020292	ATTT	2	8	9306	9313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020292	TAAT	2	8	12124	12131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	TAAT	2	8	12866	12873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020292	CTGC	2	8	12919	12926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020292	AAAG	2	8	14503	14510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020292	GAAA	2	8	24731	24738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	TTCT	2	8	35939	35946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020292	TTGA	2	8	66687	66694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020292	TAAA	2	8	69720	69727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020292	ATTA	2	8	71230	71237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020292	TAAA	2	8	80956	80963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020292	AGAA	2	8	94447	94454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020292	AGGC	2	8	104865	104872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020292	TGAT	2	8	107025	107032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020292	ATTT	2	8	108278	108285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020292	TAAA	2	8	108958	108965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020292	TACA	2	8	109003	109010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020292	TAAA	2	8	109423	109430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020292	CTAA	2	8	109529	109536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020292	CTAT	2	8	109546	109553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020292	TTTA	2	8	113536	113543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020292	TTTA	2	8	113604	113611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020292	ATTT	2	8	113736	113743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020292	TTCT	2	8	113759	113766	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020292	ATAA	3	12	113884	113895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020292	ATTT	2	8	113987	113994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020292	TTAT	2	8	114014	114021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020292	CTTA	2	8	114070	114077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020292	TATT	2	8	120304	120311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020292	TATT	2	8	125516	125523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020292	TTGT	2	8	125638	125645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020292	ATAC	2	8	126313	126320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020292	CTTA	2	8	132623	132630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020292	AGTA	2	8	132726	132733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020292	TTAT	2	8	132792	132799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020292	TAAT	2	8	133003	133010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020292	TAAT	2	8	133086	133093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020292	TAAA	2	8	134621	134628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020292	TTAA	2	8	135568	135575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020292	TAAT	2	8	135684	135691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020292	ATTT	2	8	135735	135742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.