MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	ATTA	2	8	202	209	50 %	50 %	0 %	0 %	451822615
2	NC_020292	TTAT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	451822615
3	NC_020292	AAGA	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	451822615
4	NC_020292	AATT	2	8	1190	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	451822616
5	NC_020292	ATTT	2	8	1323	1330	25 %	75 %	0 %	0 %	451822617
6	NC_020292	CATT	2	8	1521	1528	25 %	50 %	0 %	25 %	451822617
7	NC_020292	ATTT	2	8	1721	1728	25 %	75 %	0 %	0 %	451822617
8	NC_020292	TCTA	2	8	2197	2204	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
9	NC_020292	TTTA	2	8	2239	2246	25 %	75 %	0 %	0 %	451822618
10	NC_020292	AAGA	2	8	2461	2468	75 %	0 %	25 %	0 %	451822618
11	NC_020292	CTTC	2	8	2483	2490	0 %	50 %	0 %	50 %	451822618
12	NC_020292	TCTA	2	8	2827	2834	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
13	NC_020292	TCAT	2	8	3455	3462	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
14	NC_020292	ACAA	2	8	4453	4460	75 %	0 %	0 %	25 %	451822619
15	NC_020292	ATTC	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	451822619
16	NC_020292	CAAC	2	8	5122	5129	50 %	0 %	0 %	50 %	451822619
17	NC_020292	TAAA	2	8	6531	6538	75 %	25 %	0 %	0 %	451822620
18	NC_020292	TTAA	2	8	7809	7816	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
19	NC_020292	AGAA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	451822621
20	NC_020292	AGAA	2	8	8429	8436	75 %	0 %	25 %	0 %	451822621
21	NC_020292	AATA	2	8	8454	8461	75 %	25 %	0 %	0 %	451822621
22	NC_020292	CTGC	2	8	8505	8512	0 %	25 %	25 %	50 %	451822621
23	NC_020292	CATA	2	8	8561	8568	50 %	25 %	0 %	25 %	451822621
24	NC_020292	AATG	2	8	9328	9335	50 %	25 %	25 %	0 %	451822622
25	NC_020292	CAAA	2	8	9353	9360	75 %	0 %	0 %	25 %	451822622
26	NC_020292	AAGC	2	8	9917	9924	50 %	0 %	25 %	25 %	451822622
27	NC_020292	ATTT	2	8	9966	9973	25 %	75 %	0 %	0 %	451822622
28	NC_020292	AAAT	2	8	10221	10228	75 %	25 %	0 %	0 %	451822622
29	NC_020292	ATTA	2	8	11197	11204	50 %	50 %	0 %	0 %	451822622
30	NC_020292	TAAT	2	8	12524	12531	50 %	50 %	0 %	0 %	451822623
31	NC_020292	TAAA	2	8	12632	12639	75 %	25 %	0 %	0 %	451822623
32	NC_020292	GAAA	2	8	13257	13264	75 %	0 %	25 %	0 %	451822624
33	NC_020292	GTAA	2	8	14195	14202	50 %	25 %	25 %	0 %	451822626
34	NC_020292	AATA	2	8	14777	14784	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
35	NC_020292	AAAT	2	8	14820	14827	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
36	NC_020292	ATAA	2	8	14915	14922	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
37	NC_020292	ATTT	2	8	16281	16288	25 %	75 %	0 %	0 %	451822629
38	NC_020292	ATTT	2	8	17052	17059	25 %	75 %	0 %	0 %	451822630
39	NC_020292	ATAG	2	8	17411	17418	50 %	25 %	25 %	0 %	451822630
40	NC_020292	GGCA	2	8	17953	17960	25 %	0 %	50 %	25 %	451822630
41	NC_020292	TATG	2	8	18178	18185	25 %	50 %	25 %	0 %	451822630
42	NC_020292	TTCT	2	8	18342	18349	0 %	75 %	0 %	25 %	451822630
43	NC_020292	CCTA	2	8	18937	18944	25 %	25 %	0 %	50 %	451822630
44	NC_020292	AAAG	2	8	19082	19089	75 %	0 %	25 %	0 %	451822630
45	NC_020292	CATT	2	8	19431	19438	25 %	50 %	0 %	25 %	451822630
46	NC_020292	AAAT	2	8	19717	19724	75 %	25 %	0 %	0 %	451822630
47	NC_020292	AGAT	2	8	19943	19950	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
48	NC_020292	AAGA	2	8	20079	20086	75 %	0 %	25 %	0 %	451822631
49	NC_020292	GAAA	2	8	20145	20152	75 %	0 %	25 %	0 %	451822631
50	NC_020292	AAAT	2	8	20381	20388	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
51	NC_020292	TAAA	2	8	20440	20447	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
52	NC_020292	GATG	2	8	20495	20502	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
53	NC_020292	GAAT	2	8	20710	20717	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
54	NC_020292	ATTA	2	8	20922	20929	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
55	NC_020292	AATA	2	8	21027	21034	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
56	NC_020292	TATT	3	12	21083	21094	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
57	NC_020292	TTTA	2	8	21137	21144	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
58	NC_020292	TAAT	2	8	21289	21296	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
59	NC_020292	GAAA	2	8	21342	21349	75 %	0 %	25 %	0 %	451822631
60	NC_020292	ATAA	2	8	21705	21712	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
61	NC_020292	GGAT	2	8	21905	21912	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
62	NC_020292	ATGA	2	8	21924	21931	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
63	NC_020292	ATGA	2	8	21972	21979	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
64	NC_020292	GGAT	2	8	22001	22008	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
65	NC_020292	ATTT	2	8	22064	22071	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
66	NC_020292	AAAT	2	8	22079	22086	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
67	NC_020292	TAAA	2	8	22138	22145	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
68	NC_020292	ATTT	2	8	22158	22165	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
69	NC_020292	TATT	2	8	22462	22469	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
70	NC_020292	AATT	2	8	22505	22512	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
71	NC_020292	ATAA	2	8	22578	22585	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
72	NC_020292	TAAA	2	8	22912	22919	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
73	NC_020292	ATGC	2	8	24050	24057	25 %	25 %	25 %	25 %	451822631
74	NC_020292	AATC	2	8	26381	26388	50 %	25 %	0 %	25 %	451822634
75	NC_020292	ACCA	2	8	26665	26672	50 %	0 %	0 %	50 %	451822634
76	NC_020292	TTAA	2	8	26768	26775	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
77	NC_020292	ATAA	2	8	27191	27198	75 %	25 %	0 %	0 %	451822634
78	NC_020292	AGAA	2	8	27518	27525	75 %	0 %	25 %	0 %	451822635
79	NC_020292	TAAA	2	8	27705	27712	75 %	25 %	0 %	0 %	451822635
80	NC_020292	GTTT	2	8	27952	27959	0 %	75 %	25 %	0 %	451822635
81	NC_020292	ATTA	2	8	28519	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
82	NC_020292	TATT	2	8	28849	28856	25 %	75 %	0 %	0 %	451822635
83	NC_020292	AAAG	2	8	28987	28994	75 %	0 %	25 %	0 %	451822635
84	NC_020292	AAAT	2	8	29862	29869	75 %	25 %	0 %	0 %	451822635
85	NC_020292	CAAA	2	8	30032	30039	75 %	0 %	0 %	25 %	451822635
86	NC_020292	AAAG	2	8	30512	30519	75 %	0 %	25 %	0 %	451822636
87	NC_020292	AAAT	2	8	30828	30835	75 %	25 %	0 %	0 %	451822636
88	NC_020292	TGAA	2	8	30921	30928	50 %	25 %	25 %	0 %	451822636
89	NC_020292	ATTA	2	8	31700	31707	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
90	NC_020292	TGAT	2	8	31921	31928	25 %	50 %	25 %	0 %	451822636
91	NC_020292	AAAC	2	8	32004	32011	75 %	0 %	0 %	25 %	451822637
92	NC_020292	TAAT	2	8	32014	32021	50 %	50 %	0 %	0 %	451822637
93	NC_020292	CAGA	2	8	32247	32254	50 %	0 %	25 %	25 %	451822637
94	NC_020292	ACAG	2	8	32308	32315	50 %	0 %	25 %	25 %	451822637
95	NC_020292	ATTT	2	8	32445	32452	25 %	75 %	0 %	0 %	451822637
96	NC_020292	AGAA	2	8	32534	32541	75 %	0 %	25 %	0 %	451822637
97	NC_020292	ACAG	2	8	32769	32776	50 %	0 %	25 %	25 %	451822638
98	NC_020292	AAGC	2	8	32916	32923	50 %	0 %	25 %	25 %	451822638
99	NC_020292	TCAA	2	8	33725	33732	50 %	25 %	0 %	25 %	451822638
100	NC_020292	CAAA	2	8	33839	33846	75 %	0 %	0 %	25 %	451822638
101	NC_020292	ATTT	2	8	34079	34086	25 %	75 %	0 %	0 %	451822638
102	NC_020292	AAGA	2	8	34958	34965	75 %	0 %	25 %	0 %	451822638
103	NC_020292	CTTT	2	8	36323	36330	0 %	75 %	0 %	25 %	451822640
104	NC_020292	TTGG	2	8	36544	36551	0 %	50 %	50 %	0 %	451822640
105	NC_020292	GATT	2	8	36669	36676	25 %	50 %	25 %	0 %	451822640
106	NC_020292	AAAG	2	8	36790	36797	75 %	0 %	25 %	0 %	451822640
107	NC_020292	TGCA	2	8	37197	37204	25 %	25 %	25 %	25 %	451822640
108	NC_020292	TTAT	2	8	37251	37258	25 %	75 %	0 %	0 %	451822640
109	NC_020292	TAAT	2	8	38360	38367	50 %	50 %	0 %	0 %	451822642
110	NC_020292	AACC	2	8	38399	38406	50 %	0 %	0 %	50 %	451822642
111	NC_020292	TAGA	2	8	38504	38511	50 %	25 %	25 %	0 %	451822642
112	NC_020292	TTTA	2	8	38935	38942	25 %	75 %	0 %	0 %	451822642
113	NC_020292	AATG	2	8	39192	39199	50 %	25 %	25 %	0 %	451822642
114	NC_020292	TTCT	2	8	39910	39917	0 %	75 %	0 %	25 %	451822644
115	NC_020292	GATT	2	8	39985	39992	25 %	50 %	25 %	0 %	451822644
116	NC_020292	AAAT	2	8	40643	40650	75 %	25 %	0 %	0 %	451822645
117	NC_020292	AAAG	2	8	40987	40994	75 %	0 %	25 %	0 %	451822645
118	NC_020292	TAAA	2	8	41536	41543	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
119	NC_020292	TTAT	2	8	42270	42277	25 %	75 %	0 %	0 %	451822646
120	NC_020292	AAAC	2	8	42432	42439	75 %	0 %	0 %	25 %	451822646
121	NC_020292	ATTA	2	8	42557	42564	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
122	NC_020292	ATTA	2	8	42714	42721	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
123	NC_020292	CATA	2	8	42845	42852	50 %	25 %	0 %	25 %	451822646
124	NC_020292	ATTT	2	8	43162	43169	25 %	75 %	0 %	0 %	451822646
125	NC_020292	GAAA	2	8	44781	44788	75 %	0 %	25 %	0 %	451822646
126	NC_020292	TAAA	2	8	45148	45155	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
127	NC_020292	AAAG	2	8	45474	45481	75 %	0 %	25 %	0 %	451822646
128	NC_020292	AATA	2	8	45596	45603	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
129	NC_020292	ATTA	2	8	45702	45709	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
130	NC_020292	TAAA	2	8	46009	46016	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
131	NC_020292	AAAT	2	8	46187	46194	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
132	NC_020292	ATAA	2	8	46221	46228	75 %	25 %	0 %	0 %	451822646
133	NC_020292	GTAA	2	8	46753	46760	50 %	25 %	25 %	0 %	451822647
134	NC_020292	ATTT	2	8	47471	47478	25 %	75 %	0 %	0 %	451822647
135	NC_020292	AAAG	2	8	47599	47606	75 %	0 %	25 %	0 %	451822647
136	NC_020292	GTTA	2	8	47688	47695	25 %	50 %	25 %	0 %	451822647
137	NC_020292	AATT	2	8	47940	47947	50 %	50 %	0 %	0 %	451822647
138	NC_020292	AGGG	2	8	48088	48095	25 %	0 %	75 %	0 %	451822647
139	NC_020292	AGAA	2	8	48261	48268	75 %	0 %	25 %	0 %	451822647
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.