MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020292	ATA	2	6	93	98	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020292	TAA	2	6	1249	1254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020292	ATA	2	6	1309	1314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020292	TAT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020292	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020292	TTA	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020292	TAT	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020292	CAA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020292	TAT	3	9	3543	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020292	TAA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020292	TAT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020292	AAT	2	6	3849	3854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020292	TTA	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020292	ATT	2	6	3875	3880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020292	TAA	2	6	3928	3933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020292	TTG	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020292	ATT	3	9	4167	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020292	TAT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020292	TAA	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020292	TAT	3	9	5713	5721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	TAC	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020292	TAA	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020292	TTA	2	6	5944	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020292	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	GTA	2	6	6094	6099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020292	ATT	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020292	AAC	2	6	6235	6240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020292	ATT	2	6	6246	6251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020292	TAT	2	6	6291	6296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020292	TAT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020292	TAT	2	6	6872	6877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020292	TAC	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020292	AAT	3	9	7004	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020292	ATT	2	6	7021	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020292	TAA	2	6	7166	7171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020292	AGG	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020292	AAC	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020292	TAT	2	6	8855	8860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020292	ATA	2	6	9045	9050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020292	ATA	2	6	9101	9106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020292	ATT	2	6	9127	9132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020292	TAG	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020292	ATT	2	6	9243	9248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020292	TTA	2	6	9300	9305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020292	AGG	2	6	9315	9320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020292	ATT	2	6	11636	11641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020292	ATA	2	6	11669	11674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020292	CTA	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020292	ACC	2	6	11917	11922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020292	AGG	2	6	12199	12204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020292	ATT	2	6	12708	12713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020292	ATT	2	6	12757	12762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020292	TTG	2	6	12796	12801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020292	TAT	2	6	12816	12821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020292	GGA	2	6	15574	15579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020292	TAT	2	6	15837	15842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020292	ATT	2	6	15854	15859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020292	TAA	2	6	15862	15867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020292	ATT	2	6	15881	15886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020292	ATG	2	6	15900	15905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020292	AAG	2	6	30321	30326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020292	CTC	2	6	35033	35038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020292	ATA	2	6	35910	35915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020292	ATT	2	6	35933	35938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020292	ATA	2	6	39278	39283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020292	TAA	2	6	39284	39289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020292	AGG	2	6	39300	39305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020292	AGG	2	6	65799	65804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020292	ATA	2	6	71198	71203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020292	AAG	2	6	71221	71226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020292	ATA	2	6	71271	71276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020292	GTG	2	6	73786	73791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020292	CAT	2	6	75340	75345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020292	AGG	2	6	75372	75377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020292	AGC	2	6	76756	76761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020292	AGG	2	6	76767	76772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020292	TGA	2	6	80866	80871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020292	AAT	2	6	80992	80997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020292	TTA	2	6	81022	81027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020292	CCA	2	6	82262	82267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020292	GGA	3	9	82320	82328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020292	GGT	2	6	82410	82415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020292	GAT	2	6	82422	82427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020292	ATT	2	6	83483	83488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020292	ATG	2	6	83498	83503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020292	TAA	2	6	83560	83565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020292	ATT	3	9	83566	83574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020292	CTA	2	6	83614	83619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020292	GAA	2	6	87170	87175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020292	ACA	2	6	94337	94342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020292	GCT	2	6	94391	94396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020292	TAT	2	6	94397	94402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020292	GGA	2	6	94965	94970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020292	ATA	2	6	96142	96147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020292	TAG	2	6	96166	96171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020292	TAT	2	6	96206	96211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020292	ATT	2	6	96223	96228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020292	ATT	2	6	104711	104716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020292	AAG	2	6	104828	104833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020292	GTG	2	6	105221	105226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020292	TAC	2	6	105878	105883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020292	AAG	2	6	105943	105948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020292	AAT	2	6	105957	105962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020292	ATT	2	6	105986	105991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020292	TGT	2	6	108130	108135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020292	CTT	2	6	108139	108144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020292	ACA	2	6	108305	108310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020292	AAT	2	6	108420	108425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020292	ATC	2	6	108444	108449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020292	ACT	2	6	109017	109022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020292	TAA	2	6	109089	109094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020292	ATA	2	6	109172	109177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020292	TAA	2	6	109209	109214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020292	TGT	2	6	109340	109345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020292	TAG	2	6	109373	109378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020292	ATT	2	6	109497	109502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020292	TAT	2	6	109511	109516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020292	ATC	2	6	110215	110220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020292	TCT	2	6	110255	110260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020292	GAA	2	6	110277	110282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020292	TAT	2	6	113348	113353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020292	AAT	2	6	113369	113374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020292	TCT	2	6	113412	113417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020292	TCA	2	6	113717	113722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020292	CAA	2	6	113769	113774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020292	ATA	2	6	113833	113838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020292	ATT	2	6	113897	113902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020292	TTG	2	6	113911	113916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020292	GCT	2	6	114029	114034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020292	ATT	2	6	114053	114058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020292	AGC	2	6	114129	114134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020292	ATT	2	6	114175	114180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020292	TAT	2	6	114208	114213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020292	TCA	2	6	114307	114312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020292	TAT	2	6	114369	114374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020292	TCC	2	6	114902	114907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020292	TAA	3	9	118929	118937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020292	TCC	2	6	119284	119289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020292	CCT	2	6	120252	120257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020292	TAT	2	6	120260	120265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_020292	ATA	2	6	120339	120344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_020292	ATA	2	6	125613	125618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020292	ACA	2	6	125709	125714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_020292	ATA	2	6	125734	125739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_020292	TTA	2	6	131096	131101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.