MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	AT	4	8	1163	1170	50 %	50 %	0 %	0 %	451822616
2	NC_020292	CT	4	8	1255	1262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020292	AT	3	6	1807	1812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020292	AT	3	6	2109	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
5	NC_020292	AG	3	6	2339	2344	50 %	0 %	50 %	0 %	451822618
6	NC_020292	TA	3	6	2821	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
7	NC_020292	AT	3	6	3006	3011	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
8	NC_020292	TC	3	6	3116	3121	0 %	50 %	0 %	50 %	451822618
9	NC_020292	TA	3	6	3716	3721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020292	AT	3	6	3740	3745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020292	AT	4	8	3758	3765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020292	TA	3	6	3779	3784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020292	TA	5	10	3838	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020292	TA	4	8	3859	3866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020292	TA	3	6	3884	3889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020292	AT	3	6	4205	4210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020292	GA	3	6	4245	4250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	GT	3	6	4663	4668	0 %	50 %	50 %	0 %	451822619
19	NC_020292	TA	3	6	5140	5145	50 %	50 %	0 %	0 %	451822619
20	NC_020292	TA	4	8	5765	5772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020292	TA	3	6	6006	6011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020292	TA	3	6	6016	6021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	TA	3	6	6025	6030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020292	TA	3	6	6210	6215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020292	AT	3	6	6553	6558	50 %	50 %	0 %	0 %	451822620
26	NC_020292	TA	3	6	6606	6611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	TA	3	6	7148	7153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020292	TA	3	6	7650	7655	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
29	NC_020292	TA	3	6	7665	7670	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
30	NC_020292	AT	4	8	8007	8014	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
31	NC_020292	TA	3	6	8637	8642	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
32	NC_020292	TA	3	6	8924	8929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020292	TA	3	6	8994	8999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020292	AT	3	6	9085	9090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020292	AT	4	8	9181	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020292	AT	4	8	10718	10725	50 %	50 %	0 %	0 %	451822622
37	NC_020292	AG	3	6	11277	11282	50 %	0 %	50 %	0 %	451822622
38	NC_020292	AT	3	6	11590	11595	50 %	50 %	0 %	0 %	451822622
39	NC_020292	TA	3	6	12028	12033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020292	AG	3	6	12412	12417	50 %	0 %	50 %	0 %	451822623
41	NC_020292	TA	3	6	12425	12430	50 %	50 %	0 %	0 %	451822623
42	NC_020292	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	451822623
43	NC_020292	TA	3	6	12699	12704	50 %	50 %	0 %	0 %	451822623
44	NC_020292	TA	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020292	TA	3	6	12980	12985	50 %	50 %	0 %	0 %	451822624
46	NC_020292	AT	4	8	14568	14575	50 %	50 %	0 %	0 %	451822627
47	NC_020292	AT	3	6	15341	15346	50 %	50 %	0 %	0 %	451822627
48	NC_020292	TA	4	8	16479	16486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020292	AT	3	6	17713	17718	50 %	50 %	0 %	0 %	451822630
50	NC_020292	AG	3	6	18093	18098	50 %	0 %	50 %	0 %	451822630
51	NC_020292	AT	3	6	18724	18729	50 %	50 %	0 %	0 %	451822630
52	NC_020292	TA	5	10	19645	19654	50 %	50 %	0 %	0 %	451822630
53	NC_020292	TA	3	6	19990	19995	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
54	NC_020292	AT	3	6	20282	20287	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
55	NC_020292	AT	3	6	20324	20329	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
56	NC_020292	AT	3	6	20578	20583	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
57	NC_020292	TA	3	6	20778	20783	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
58	NC_020292	AT	3	6	20789	20794	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
59	NC_020292	TA	4	8	20971	20978	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
60	NC_020292	TA	3	6	21222	21227	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
61	NC_020292	TA	3	6	21382	21387	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
62	NC_020292	TA	3	6	22125	22130	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
63	NC_020292	AT	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
64	NC_020292	AT	3	6	23124	23129	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
65	NC_020292	CA	3	6	23701	23706	50 %	0 %	0 %	50 %	451822631
66	NC_020292	AT	3	6	23841	23846	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
67	NC_020292	GA	3	6	23924	23929	50 %	0 %	50 %	0 %	451822631
68	NC_020292	AT	3	6	23942	23947	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
69	NC_020292	AT	4	8	24104	24111	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
70	NC_020292	TC	3	6	25152	25157	0 %	50 %	0 %	50 %	451822633
71	NC_020292	TA	3	6	25254	25259	50 %	50 %	0 %	0 %	451822633
72	NC_020292	GA	3	6	25794	25799	50 %	0 %	50 %	0 %	451822633
73	NC_020292	AT	3	6	25801	25806	50 %	50 %	0 %	0 %	451822633
74	NC_020292	TA	3	6	25985	25990	50 %	50 %	0 %	0 %	451822633
75	NC_020292	AT	3	6	26308	26313	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
76	NC_020292	AT	3	6	26448	26453	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
77	NC_020292	AT	3	6	26925	26930	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
78	NC_020292	AT	3	6	26939	26944	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
79	NC_020292	AT	3	6	26994	26999	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
80	NC_020292	TA	3	6	27651	27656	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
81	NC_020292	TA	5	10	28316	28325	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
82	NC_020292	AT	3	6	28336	28341	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
83	NC_020292	TA	3	6	28877	28882	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
84	NC_020292	AT	3	6	29158	29163	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
85	NC_020292	TA	3	6	30692	30697	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
86	NC_020292	AT	3	6	30962	30967	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
87	NC_020292	AT	3	6	31123	31128	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
88	NC_020292	TG	3	6	31358	31363	0 %	50 %	50 %	0 %	451822636
89	NC_020292	AT	4	8	31368	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
90	NC_020292	TA	3	6	31395	31400	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
91	NC_020292	AT	3	6	31684	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
92	NC_020292	TA	3	6	31854	31859	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
93	NC_020292	AG	3	6	31864	31869	50 %	0 %	50 %	0 %	451822636
94	NC_020292	AT	3	6	32586	32591	50 %	50 %	0 %	0 %	451822637
95	NC_020292	AT	3	6	33747	33752	50 %	50 %	0 %	0 %	451822638
96	NC_020292	TA	3	6	33868	33873	50 %	50 %	0 %	0 %	451822638
97	NC_020292	TA	3	6	33932	33937	50 %	50 %	0 %	0 %	451822638
98	NC_020292	AG	3	6	34063	34068	50 %	0 %	50 %	0 %	451822638
99	NC_020292	TA	3	6	34404	34409	50 %	50 %	0 %	0 %	451822638
100	NC_020292	GA	3	6	34754	34759	50 %	0 %	50 %	0 %	451822638
101	NC_020292	AT	3	6	34772	34777	50 %	50 %	0 %	0 %	451822638
102	NC_020292	AT	3	6	35066	35071	50 %	50 %	0 %	0 %	451822639
103	NC_020292	AG	3	6	35308	35313	50 %	0 %	50 %	0 %	451822639
104	NC_020292	TA	3	6	36140	36145	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
105	NC_020292	TA	3	6	36377	36382	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
106	NC_020292	TA	3	6	36436	36441	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
107	NC_020292	TA	3	6	36584	36589	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
108	NC_020292	AT	3	6	36996	37001	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
109	NC_020292	TA	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
110	NC_020292	TA	3	6	37269	37274	50 %	50 %	0 %	0 %	451822640
111	NC_020292	GA	3	6	37366	37371	50 %	0 %	50 %	0 %	451822640
112	NC_020292	AT	4	8	37437	37444	50 %	50 %	0 %	0 %	451822641
113	NC_020292	TA	4	8	37477	37484	50 %	50 %	0 %	0 %	451822641
114	NC_020292	TA	3	6	37652	37657	50 %	50 %	0 %	0 %	451822641
115	NC_020292	AT	3	6	38119	38124	50 %	50 %	0 %	0 %	451822641
116	NC_020292	TA	3	6	38177	38182	50 %	50 %	0 %	0 %	451822642
117	NC_020292	GA	3	6	38465	38470	50 %	0 %	50 %	0 %	451822642
118	NC_020292	TA	3	6	38677	38682	50 %	50 %	0 %	0 %	451822642
119	NC_020292	AT	3	6	38979	38984	50 %	50 %	0 %	0 %	451822642
120	NC_020292	AT	3	6	39214	39219	50 %	50 %	0 %	0 %	451822642
121	NC_020292	AT	3	6	39628	39633	50 %	50 %	0 %	0 %	451822643
122	NC_020292	GA	3	6	39937	39942	50 %	0 %	50 %	0 %	451822644
123	NC_020292	AT	4	8	39948	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	451822644
124	NC_020292	AT	3	6	41451	41456	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
125	NC_020292	TA	3	6	41641	41646	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
126	NC_020292	TA	3	6	41956	41961	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
127	NC_020292	AT	3	6	42088	42093	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
128	NC_020292	AT	3	6	42362	42367	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
129	NC_020292	AT	3	6	43000	43005	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
130	NC_020292	AT	3	6	43034	43039	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
131	NC_020292	TA	3	6	43153	43158	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
132	NC_020292	AT	3	6	43701	43706	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
133	NC_020292	AT	3	6	43723	43728	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
134	NC_020292	GA	3	6	44376	44381	50 %	0 %	50 %	0 %	451822646
135	NC_020292	TA	3	6	44556	44561	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
136	NC_020292	TA	3	6	44800	44805	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
137	NC_020292	AT	3	6	44946	44951	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
138	NC_020292	AT	3	6	45085	45090	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
139	NC_020292	AT	3	6	45179	45184	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
140	NC_020292	TA	3	6	45442	45447	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
141	NC_020292	AT	3	6	45990	45995	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
142	NC_020292	TA	3	6	46086	46091	50 %	50 %	0 %	0 %	451822646
143	NC_020292	TA	3	6	46894	46899	50 %	50 %	0 %	0 %	451822647
144	NC_020292	AT	3	6	46900	46905	50 %	50 %	0 %	0 %	451822647
145	NC_020292	AT	4	8	47345	47352	50 %	50 %	0 %	0 %	451822647
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432	NC_020292	AT	3	6	135598	135603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_020292	AT	3	6	135699	135704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_020292	AT	4	8	135745	135752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_020292	TA	3	6	135893	135898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_020292	TA	3	6	135923	135928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_020292	AT	3	6	136062	136067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_020292	TA	3	6	136130	136135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.