MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	CT	4	8	1255	1262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020292	AT	3	6	1807	1812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020292	TA	3	6	3716	3721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020292	AT	3	6	3740	3745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020292	AT	4	8	3758	3765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020292	TA	3	6	3779	3784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020292	TA	5	10	3838	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020292	TA	4	8	3859	3866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020292	TA	3	6	3884	3889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020292	AT	3	6	4205	4210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020292	GA	3	6	4245	4250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020292	TA	4	8	5765	5772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020292	TA	3	6	6006	6011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020292	TA	3	6	6016	6021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020292	TA	3	6	6025	6030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020292	TA	3	6	6210	6215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020292	TA	3	6	6606	6611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	TA	3	6	7148	7153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020292	TA	3	6	8924	8929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020292	TA	3	6	8994	8999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020292	AT	3	6	9085	9090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020292	AT	4	8	9181	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	TA	3	6	12028	12033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020292	TA	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020292	TA	4	8	16479	16486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020292	GA	3	6	54252	54257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	AT	3	6	69734	69739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020292	TA	3	6	69765	69770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020292	AT	3	6	71182	71187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020292	GA	3	6	81114	81119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020292	TA	4	8	104733	104740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020292	TA	4	8	104817	104824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020292	AG	3	6	105947	105952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020292	AT	3	6	108223	108228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020292	AT	3	6	108234	108239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020292	TA	3	6	108394	108399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020292	TA	3	6	108946	108951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020292	AT	4	8	109297	109304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020292	TA	3	6	109314	109319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020292	TA	3	6	113362	113367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020292	AT	4	8	113437	113444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020292	TA	5	10	113456	113465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020292	AC	3	6	113684	113689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020292	AT	3	6	113775	113780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020292	TA	3	6	113784	113789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020292	AT	3	6	113953	113958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020292	AT	3	6	114020	114025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020292	AG	3	6	114047	114052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020292	TA	3	6	114407	114412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020292	AT	3	6	120280	120285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020292	TA	3	6	125476	125481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020292	AT	3	6	125490	125495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020292	AT	3	6	125663	125668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020292	TA	3	6	125670	125675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020292	AT	4	8	125693	125700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020292	AT	3	6	125703	125708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020292	TA	4	8	130656	130663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020292	TA	3	6	131084	131089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020292	TA	5	10	132495	132504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020292	TA	5	10	132515	132524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020292	AT	3	6	132540	132545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020292	TA	3	6	132563	132568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020292	TA	5	10	132810	132819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020292	TA	3	6	132852	132857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020292	TA	3	6	132864	132869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020292	TA	3	6	132877	132882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020292	AT	3	6	132966	132971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020292	AT	3	6	133029	133034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020292	AT	4	8	134491	134498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020292	TA	3	6	134587	134592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020292	AG	3	6	135009	135014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020292	TC	3	6	135037	135042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020292	AT	3	6	135598	135603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020292	AT	3	6	135699	135704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020292	AT	4	8	135745	135752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020292	TA	3	6	135893	135898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020292	TA	3	6	135923	135928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020292	AT	3	6	136062	136067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020292	TA	3	6	136130	136135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.