MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	A	7	7	972	978	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
2	NC_020292	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
3	NC_020292	A	8	8	1033	1040	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
4	NC_020292	A	6	6	1109	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
5	NC_020292	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
6	NC_020292	A	6	6	1207	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
7	NC_020292	T	6	6	1285	1290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020292	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	451822617
9	NC_020292	T	6	6	1793	1798	0 %	100 %	0 %	0 %	451822617
10	NC_020292	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
11	NC_020292	T	6	6	2750	2755	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
12	NC_020292	T	7	7	2876	2882	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
13	NC_020292	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	451822618
14	NC_020292	T	6	6	2960	2965	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
15	NC_020292	T	8	8	3183	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
16	NC_020292	T	6	6	3395	3400	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
17	NC_020292	A	8	8	3563	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020292	T	6	6	3786	3791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020292	T	7	7	3828	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020292	A	6	6	3916	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020292	T	6	6	4069	4074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020292	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020292	T	6	6	6296	6301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020292	T	6	6	6627	6632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020292	A	8	8	7196	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020292	T	8	8	7204	7211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020292	T	6	6	7215	7220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020292	A	6	6	7276	7281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020292	T	10	10	7328	7337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020292	T	8	8	7356	7363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020292	T	7	7	8697	8703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020292	T	7	7	8806	8812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020292	A	6	6	9142	9147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020292	A	6	6	9268	9273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020292	A	6	6	9294	9299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020292	A	6	6	10067	10072	100 %	0 %	0 %	0 %	451822622
37	NC_020292	A	6	6	11051	11056	100 %	0 %	0 %	0 %	451822622
38	NC_020292	T	7	7	11821	11827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020292	A	6	6	12419	12424	100 %	0 %	0 %	0 %	451822623
40	NC_020292	T	6	6	12969	12974	0 %	100 %	0 %	0 %	451822624
41	NC_020292	A	6	6	13278	13283	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
42	NC_020292	A	6	6	13375	13380	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
43	NC_020292	A	6	6	13388	13393	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
44	NC_020292	T	6	6	13487	13492	0 %	100 %	0 %	0 %	451822625
45	NC_020292	A	6	6	13936	13941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020292	G	6	6	13942	13947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020292	A	7	7	14093	14099	100 %	0 %	0 %	0 %	451822626
48	NC_020292	A	7	7	14218	14224	100 %	0 %	0 %	0 %	451822626
49	NC_020292	T	7	7	14676	14682	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
50	NC_020292	A	6	6	15408	15413	100 %	0 %	0 %	0 %	451822627
51	NC_020292	T	7	7	15505	15511	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
52	NC_020292	A	7	7	15610	15616	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
53	NC_020292	A	7	7	15647	15653	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
54	NC_020292	A	6	6	15791	15796	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
55	NC_020292	A	6	6	15821	15826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020292	A	6	6	16054	16059	100 %	0 %	0 %	0 %	451822629
57	NC_020292	T	6	6	16286	16291	0 %	100 %	0 %	0 %	451822629
58	NC_020292	A	7	7	16536	16542	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
59	NC_020292	A	6	6	18767	18772	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
60	NC_020292	A	6	6	18952	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
61	NC_020292	A	6	6	19189	19194	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
62	NC_020292	A	6	6	20036	20041	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
63	NC_020292	A	6	6	20445	20450	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
64	NC_020292	A	6	6	21756	21761	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
65	NC_020292	A	6	6	21948	21953	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
66	NC_020292	A	7	7	23010	23016	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
67	NC_020292	A	7	7	23303	23309	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
68	NC_020292	A	6	6	23525	23530	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
69	NC_020292	T	6	6	23615	23620	0 %	100 %	0 %	0 %	451822631
70	NC_020292	A	7	7	24239	24245	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
71	NC_020292	A	6	6	24714	24719	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
72	NC_020292	A	7	7	24928	24934	100 %	0 %	0 %	0 %	451822632
73	NC_020292	A	7	7	25563	25569	100 %	0 %	0 %	0 %	451822633
74	NC_020292	A	6	6	25677	25682	100 %	0 %	0 %	0 %	451822633
75	NC_020292	A	7	7	27002	27008	100 %	0 %	0 %	0 %	451822634
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80	NC_020292	A	6	6	29231	29236	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
81	NC_020292	G	6	6	30339	30344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_020292	A	7	7	31721	31727	100 %	0 %	0 %	0 %	451822636
84	NC_020292	A	6	6	32423	32428	100 %	0 %	0 %	0 %	451822637
85	NC_020292	A	8	8	32614	32621	100 %	0 %	0 %	0 %	451822637
86	NC_020292	A	6	6	32752	32757	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
87	NC_020292	A	6	6	33183	33188	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
88	NC_020292	A	6	6	33530	33535	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
89	NC_020292	A	6	6	33810	33815	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
90	NC_020292	T	7	7	35978	35984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020292	A	6	6	36729	36734	100 %	0 %	0 %	0 %	451822640
92	NC_020292	A	6	6	37055	37060	100 %	0 %	0 %	0 %	451822640
93	NC_020292	A	6	6	37889	37894	100 %	0 %	0 %	0 %	451822641
94	NC_020292	A	6	6	38125	38130	100 %	0 %	0 %	0 %	451822641
95	NC_020292	A	7	7	38827	38833	100 %	0 %	0 %	0 %	451822642
96	NC_020292	A	6	6	39288	39293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020292	A	6	6	40330	40335	100 %	0 %	0 %	0 %	451822644
98	NC_020292	A	6	6	40405	40410	100 %	0 %	0 %	0 %	451822644
99	NC_020292	A	7	7	40499	40505	100 %	0 %	0 %	0 %	451822644
100	NC_020292	A	6	6	40636	40641	100 %	0 %	0 %	0 %	451822645
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104	NC_020292	A	7	7	41741	41747	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
105	NC_020292	A	6	6	42095	42100	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
106	NC_020292	A	6	6	43096	43101	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
107	NC_020292	A	6	6	43337	43342	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
108	NC_020292	A	7	7	43866	43872	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
109	NC_020292	A	6	6	43891	43896	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
110	NC_020292	A	6	6	44077	44082	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
111	NC_020292	A	6	6	44702	44707	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
112	NC_020292	A	7	7	44805	44811	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
113	NC_020292	A	6	6	45006	45011	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
114	NC_020292	A	6	6	45070	45075	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
115	NC_020292	A	6	6	45170	45175	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
116	NC_020292	T	6	6	45190	45195	0 %	100 %	0 %	0 %	451822646
117	NC_020292	A	6	6	45338	45343	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
118	NC_020292	A	7	7	45572	45578	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
119	NC_020292	A	6	6	45651	45656	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
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123	NC_020292	A	7	7	47145	47151	100 %	0 %	0 %	0 %	451822647
124	NC_020292	A	7	7	48736	48742	100 %	0 %	0 %	0 %	451822647
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126	NC_020292	A	6	6	50375	50380	100 %	0 %	0 %	0 %	451822647
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.