MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	A	7	7	972	978	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
2	NC_020292	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
3	NC_020292	A	8	8	1033	1040	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
4	NC_020292	A	6	6	1109	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
5	NC_020292	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
6	NC_020292	A	6	6	1207	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
7	NC_020292	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	451822617
8	NC_020292	T	6	6	1793	1798	0 %	100 %	0 %	0 %	451822617
9	NC_020292	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
10	NC_020292	T	6	6	2750	2755	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
11	NC_020292	T	7	7	2876	2882	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
12	NC_020292	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	451822618
13	NC_020292	T	6	6	2960	2965	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
14	NC_020292	T	8	8	3183	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
15	NC_020292	T	6	6	3395	3400	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
16	NC_020292	A	6	6	10067	10072	100 %	0 %	0 %	0 %	451822622
17	NC_020292	A	6	6	11051	11056	100 %	0 %	0 %	0 %	451822622
18	NC_020292	A	6	6	12419	12424	100 %	0 %	0 %	0 %	451822623
19	NC_020292	T	6	6	12969	12974	0 %	100 %	0 %	0 %	451822624
20	NC_020292	A	6	6	13278	13283	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
21	NC_020292	A	6	6	13375	13380	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
22	NC_020292	A	6	6	13388	13393	100 %	0 %	0 %	0 %	451822624
23	NC_020292	T	6	6	13487	13492	0 %	100 %	0 %	0 %	451822625
24	NC_020292	A	7	7	14093	14099	100 %	0 %	0 %	0 %	451822626
25	NC_020292	A	7	7	14218	14224	100 %	0 %	0 %	0 %	451822626
26	NC_020292	T	7	7	14676	14682	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
27	NC_020292	A	6	6	15408	15413	100 %	0 %	0 %	0 %	451822627
28	NC_020292	T	7	7	15505	15511	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
29	NC_020292	A	7	7	15610	15616	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
30	NC_020292	A	7	7	15647	15653	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
31	NC_020292	A	6	6	15791	15796	100 %	0 %	0 %	0 %	451822628
32	NC_020292	A	6	6	16054	16059	100 %	0 %	0 %	0 %	451822629
33	NC_020292	T	6	6	16286	16291	0 %	100 %	0 %	0 %	451822629
34	NC_020292	A	7	7	16536	16542	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
35	NC_020292	A	6	6	18767	18772	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
36	NC_020292	A	6	6	18952	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
37	NC_020292	A	6	6	19189	19194	100 %	0 %	0 %	0 %	451822630
38	NC_020292	A	6	6	20036	20041	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
39	NC_020292	A	6	6	20445	20450	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
40	NC_020292	A	6	6	21756	21761	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
41	NC_020292	A	6	6	21948	21953	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
42	NC_020292	A	7	7	23010	23016	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
43	NC_020292	A	7	7	23303	23309	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
44	NC_020292	A	6	6	23525	23530	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
45	NC_020292	T	6	6	23615	23620	0 %	100 %	0 %	0 %	451822631
46	NC_020292	A	7	7	24239	24245	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
47	NC_020292	A	6	6	24714	24719	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
48	NC_020292	A	7	7	24928	24934	100 %	0 %	0 %	0 %	451822632
49	NC_020292	A	7	7	25563	25569	100 %	0 %	0 %	0 %	451822633
50	NC_020292	A	6	6	25677	25682	100 %	0 %	0 %	0 %	451822633
51	NC_020292	A	7	7	27002	27008	100 %	0 %	0 %	0 %	451822634
52	NC_020292	T	6	6	27348	27353	0 %	100 %	0 %	0 %	451822634
53	NC_020292	A	6	6	27787	27792	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
54	NC_020292	T	6	6	28628	28633	0 %	100 %	0 %	0 %	451822635
55	NC_020292	A	7	7	28951	28957	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
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60	NC_020292	A	8	8	32614	32621	100 %	0 %	0 %	0 %	451822637
61	NC_020292	A	6	6	32752	32757	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
62	NC_020292	A	6	6	33183	33188	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
63	NC_020292	A	6	6	33530	33535	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
64	NC_020292	A	6	6	33810	33815	100 %	0 %	0 %	0 %	451822638
65	NC_020292	A	6	6	36729	36734	100 %	0 %	0 %	0 %	451822640
66	NC_020292	A	6	6	37055	37060	100 %	0 %	0 %	0 %	451822640
67	NC_020292	A	6	6	37889	37894	100 %	0 %	0 %	0 %	451822641
68	NC_020292	A	6	6	38125	38130	100 %	0 %	0 %	0 %	451822641
69	NC_020292	A	7	7	38827	38833	100 %	0 %	0 %	0 %	451822642
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71	NC_020292	A	6	6	40405	40410	100 %	0 %	0 %	0 %	451822644
72	NC_020292	A	7	7	40499	40505	100 %	0 %	0 %	0 %	451822644
73	NC_020292	A	6	6	40636	40641	100 %	0 %	0 %	0 %	451822645
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81	NC_020292	A	7	7	43866	43872	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
82	NC_020292	A	6	6	43891	43896	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
83	NC_020292	A	6	6	44077	44082	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
84	NC_020292	A	6	6	44702	44707	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
85	NC_020292	A	7	7	44805	44811	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
86	NC_020292	A	6	6	45006	45011	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
87	NC_020292	A	6	6	45070	45075	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
88	NC_020292	A	6	6	45170	45175	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
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91	NC_020292	A	7	7	45572	45578	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
92	NC_020292	A	6	6	45651	45656	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
93	NC_020292	A	6	6	45736	45741	100 %	0 %	0 %	0 %	451822646
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111	NC_020292	T	6	6	55314	55319	0 %	100 %	0 %	0 %	451822652
112	NC_020292	A	7	7	55505	55511	100 %	0 %	0 %	0 %	451822652
113	NC_020292	A	6	6	55567	55572	100 %	0 %	0 %	0 %	451822652
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126	NC_020292	T	6	6	63143	63148	0 %	100 %	0 %	0 %	451822654
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129	NC_020292	A	6	6	64902	64907	100 %	0 %	0 %	0 %	451822655
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135	NC_020292	A	6	6	67229	67234	100 %	0 %	0 %	0 %	451822658
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142	NC_020292	A	8	8	71318	71325	100 %	0 %	0 %	0 %	451822662
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.