MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 3590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	ATCTAT	2	12	1662	1673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020291	TGTAAA	2	12	2476	2487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816900
3	NC_020291	AATGTT	2	12	3202	3213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816902
4	NC_020291	TACAGT	2	12	4938	4949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816904
5	NC_020291	TTTGAT	2	12	5089	5100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816904
6	NC_020291	TTCATA	2	12	15629	15640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816907
7	NC_020291	TAAATT	2	12	18040	18051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020291	GATAGA	2	12	20479	20490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816911
9	NC_020291	TCAGTT	2	12	21295	21306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816911
10	NC_020291	TTAGAT	2	12	21454	21465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816911
11	NC_020291	TTAAAA	2	12	21712	21723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816911
12	NC_020291	ACTGAA	2	12	22927	22938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451816912
13	NC_020291	TAGAAA	2	12	23598	23609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816912
14	NC_020291	TTAGTA	2	12	24776	24787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816912
15	NC_020291	TTCATT	2	12	25905	25916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451816912
16	NC_020291	TACTAA	2	12	27351	27362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020291	AAATAA	2	12	28674	28685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451816915
18	NC_020291	GCAATT	2	12	29717	29728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020291	CTGAAG	2	12	30172	30183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816916
20	NC_020291	AAATAA	2	12	31067	31078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451816916
21	NC_020291	ACATAA	2	12	32570	32581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451816919
22	NC_020291	ATTAGC	2	12	34073	34084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020291	GAAATA	2	12	34549	34560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816922
24	NC_020291	TAATTA	2	12	34850	34861	50 %	50 %	0 %	0 %	451816923
25	NC_020291	TCAAGA	2	12	35043	35054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451816923
26	NC_020291	TAGTTA	2	12	35308	35319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816923
27	NC_020291	TTGAAA	2	12	38384	38395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816926
28	NC_020291	AAATGA	2	12	38605	38616	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816926
29	NC_020291	GATAAT	2	12	38660	38671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816926
30	NC_020291	AGAAAT	2	12	38997	39008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816926
31	NC_020291	AAAAGA	2	12	39089	39100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451816927
32	NC_020291	TAACTG	2	12	41192	41203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020291	TTATAA	2	12	41290	41301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020291	ATGGAA	2	12	42366	42377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816929
35	NC_020291	AAAGGT	2	12	44990	45001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816930
36	NC_020291	GATAAG	2	12	46709	46720	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816931
37	NC_020291	TATAAA	2	12	49082	49093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816933
38	NC_020291	AATTTA	2	12	49126	49137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020291	AAATAT	2	12	55523	55534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
40	NC_020291	CTATAA	2	12	55615	55626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451816939
41	NC_020291	TAGAAA	2	12	61789	61800	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816945
42	NC_020291	AATGTG	2	12	62890	62901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816945
43	NC_020291	GTCTAA	2	12	63284	63295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816945
44	NC_020291	AGGTGA	2	12	64316	64327	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451816945
45	NC_020291	AGAAAA	2	12	65222	65233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451816946
46	NC_020291	TTATTG	2	12	67051	67062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816947
47	NC_020291	ATTTTT	2	12	68077	68088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020291	AGATTT	2	12	69818	69829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816952
49	NC_020291	ATTTAG	2	12	69970	69981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816952
50	NC_020291	ATTTTG	2	12	70219	70230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816952
51	NC_020291	AATATT	2	12	71374	71385	50 %	50 %	0 %	0 %	451816953
52	NC_020291	TTTAGC	2	12	74526	74537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816954
53	NC_020291	GCAATT	2	12	76864	76875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816956
54	NC_020291	TAGTTG	2	12	76877	76888	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451816956
55	NC_020291	ACATTA	2	12	79328	79339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451816958
56	NC_020291	TGAAGA	2	12	87864	87875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816967
57	NC_020291	TTAAAT	2	12	88556	88567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020291	TTGTAA	2	12	89039	89050	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020291	CAGATG	2	12	91142	91153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816969
60	NC_020291	AGCACC	2	12	91704	91715	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451816969
61	NC_020291	AGTTAA	2	12	92202	92213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816969
62	NC_020291	AAGGCT	2	12	97474	97485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816975
63	NC_020291	ATAAAA	2	12	99406	99417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020291	AGAATA	2	12	101604	101615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816979
65	NC_020291	ATTATA	2	12	102106	102117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816981
66	NC_020291	TGATAC	2	12	106449	106460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816986
67	NC_020291	ATAGAA	2	12	106873	106884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816986
68	NC_020291	ATTAAA	2	12	107111	107122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020291	GTGTAT	2	12	108066	108077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451816987
70	NC_020291	AATTGA	2	12	111958	111969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020291	TATAAA	2	12	112051	112062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020291	TTAGAA	2	12	112237	112248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816991
73	NC_020291	AGATAA	2	12	116294	116305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816995
74	NC_020291	AAAGAA	2	12	116781	116792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451816995
75	NC_020291	TGGTGT	2	12	119521	119532	0 %	50 %	50 %	0 %	451816997
76	NC_020291	TAATGA	2	12	131600	131611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817008
77	NC_020291	ATAGTT	2	12	132298	132309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817008
78	NC_020291	ATTTTG	2	12	134233	134244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451817009
79	NC_020291	TAGTTG	2	12	134612	134623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451817010
80	NC_020291	TGTAGG	2	12	135817	135828	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451817011
81	NC_020291	AGTTAA	2	12	141443	141454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817015
82	NC_020291	TGTAAA	2	12	142053	142064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817016
83	NC_020291	GTAGAA	2	12	142252	142263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451817016
84	NC_020291	CAAAGA	2	12	142954	142965	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817016
85	NC_020291	GGAATG	2	12	143068	143079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451817016
86	NC_020291	TACATC	2	12	145693	145704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817018
87	NC_020291	AGTATT	2	12	148538	148549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817020
88	NC_020291	GTTTAT	2	12	154736	154747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451817021
89	NC_020291	CTAAAG	2	12	155317	155328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451817021
90	NC_020291	TCCTTT	2	12	155426	155437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451817021
91	NC_020291	TTGATC	2	12	156529	156540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451817023
92	NC_020291	ATAAAG	2	12	158359	158370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451817026
93	NC_020291	TTAAAA	2	12	158866	158877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817026
94	NC_020291	CAAAGT	2	12	160368	160379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020291	CAAAAA	2	12	160384	160395	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020291	AATGCA	2	12	160712	160723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451817030
97	NC_020291	CAAAGA	2	12	161302	161313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817031
98	NC_020291	AATAAA	2	12	162341	162352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817032
99	NC_020291	AAGGAA	2	12	163779	163790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817033
100	NC_020291	GGAATA	2	12	166714	166725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451817035
101	NC_020291	CATATG	2	12	166886	166897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451817035
102	NC_020291	AATTTA	2	12	167209	167220	50 %	50 %	0 %	0 %	451817035
103	NC_020291	TTAGAT	2	12	167482	167493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817035
104	NC_020291	AATTAA	2	12	169095	169106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817036
105	NC_020291	ATTAAA	2	12	169840	169851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020291	AGATGC	2	12	172163	172174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451817039
107	NC_020291	AAAAAT	2	12	175085	175096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817042
108	NC_020291	AATAAA	2	12	176037	176048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020291	TAAAAT	2	12	177888	177899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817046
110	NC_020291	ACTTCA	2	12	178559	178570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817048
111	NC_020291	ATCAGT	2	12	179633	179644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451817049
112	NC_020291	GGATTA	2	12	180695	180706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817051
113	NC_020291	TCAAGA	2	12	182567	182578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451817052
114	NC_020291	TAATGC	2	12	184262	184273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451817052
115	NC_020291	TGTAAA	2	12	187536	187547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817053
116	NC_020291	AAAAAT	2	12	188087	188098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817053
117	NC_020291	CAAGAA	2	12	189937	189948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817056
118	NC_020291	GTTGAA	2	12	190042	190053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817056
119	NC_020291	AAACTG	2	12	190118	190129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451817056
120	NC_020291	ATTCAA	2	12	190844	190855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451817056
121	NC_020291	ATTGAA	2	12	197339	197350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817065
122	NC_020291	AATGCT	2	12	200353	200364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451817073
123	NC_020291	GTTGGT	2	12	201043	201054	0 %	50 %	50 %	0 %	451817074
124	NC_020291	GTTGGA	2	12	201845	201856	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451817076
125	NC_020291	AGACTA	2	12	206852	206863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451817085
126	NC_020291	TATATT	2	12	207979	207990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020291	AAAATA	2	12	208532	208543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817088
128	NC_020291	GCAATG	2	12	211980	211991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451817092
129	NC_020291	TTAAGA	2	12	212125	212136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020291	TATAAA	2	12	212535	212546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817093
131	NC_020291	TAAAAT	2	12	215508	215519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817097
132	NC_020291	TAATTA	2	12	218624	218635	50 %	50 %	0 %	0 %	451817101
133	NC_020291	TAAAAA	2	12	219452	219463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817101
134	NC_020291	GATAAT	2	12	219967	219978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817102
135	NC_020291	TTAGAA	2	12	220072	220083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817102
136	NC_020291	GAATAT	2	12	222023	222034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817103
137	NC_020291	AGTTAT	2	12	222399	222410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817103
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140	NC_020291	TAATAG	2	12	227631	227642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817107
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146	NC_020291	TAAATT	2	12	234318	234329	50 %	50 %	0 %	0 %	451817113
147	NC_020291	GATTTA	2	12	236952	236963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817114
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149	NC_020291	ATTAAA	2	12	237923	237934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817114
150	NC_020291	TAAAGA	2	12	238196	238207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451817114
151	NC_020291	AATACA	2	12	239574	239585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451817116
152	NC_020291	GAGATA	2	12	242916	242927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451817120
153	NC_020291	TAAATT	2	12	243297	243308	50 %	50 %	0 %	0 %	451817120
154	NC_020291	TAAACT	2	12	244356	244367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451817122
155	NC_020291	ATTTAA	2	12	246032	246043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020291	AGTGGC	3	18	246250	246267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451817123
157	NC_020291	ATCAAC	2	12	247273	247284	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451817124
158	NC_020291	ATGAAA	2	12	247299	247310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451817124
159	NC_020291	AGATGG	2	12	247855	247866	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451817124
160	NC_020291	GTGAGA	2	12	249240	249251	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451817125
161	NC_020291	TTTGAA	2	12	250339	250350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817126
162	NC_020291	TCAAAT	2	12	250824	250835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451817126
163	NC_020291	ATTAGA	2	12	253014	253025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817129
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166	NC_020291	TAAAAA	2	12	255088	255099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020291	TATTGA	2	12	257633	257644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817133
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169	NC_020291	AAATTA	2	12	267194	267205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817139
170	NC_020291	TAATTT	2	12	267451	267462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020291	TAAGAG	2	12	268007	268018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451817140
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182	NC_020291	TTTCAT	2	12	277694	277705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451817146
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210	NC_020291	TATTTT	2	12	335125	335136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451817191
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220	NC_020291	CATCAG	2	12	354479	354490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451817206
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222	NC_020291	AGCCAT	2	12	358245	358256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451817211
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225	NC_020291	TTATCA	2	12	362596	362607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451817216
226	NC_020291	CTTGTG	2	12	365164	365175	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451817216
227	NC_020291	TTATGT	2	12	366903	366914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451817218
228	NC_020291	GGTATT	2	12	368948	368959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451817219
229	NC_020291	AGTTGA	2	12	369421	369432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817220
230	NC_020291	ATATTT	2	12	375038	375049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_020291	GTTAAT	2	12	375435	375446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_020291	ATGCAG	2	12	375877	375888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451817225
233	NC_020291	GACAAA	2	12	380637	380648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817229
234	NC_020291	TTACAT	2	12	385172	385183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451817233
235	NC_020291	ATTTTA	2	12	386213	386224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817234
236	NC_020291	ATTAAT	2	12	386374	386385	50 %	50 %	0 %	0 %	451817234
237	NC_020291	CTTTTT	2	12	387857	387868	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451817236
238	NC_020291	TTTATT	2	12	393456	393467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451817240
239	NC_020291	ATTTTA	2	12	394252	394263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817240
240	NC_020291	TGATTT	2	12	394511	394522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451817240
241	NC_020291	GATATT	2	12	395520	395531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817240
242	NC_020291	TTTATT	2	12	396657	396668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451817240
243	NC_020291	AGATAA	2	12	397308	397319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451817241
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246	NC_020291	GTAATT	2	12	404164	404175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817244
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339	NC_020291	AAAATA	2	12	546856	546867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817341
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344	NC_020291	AGAAGG	2	12	557527	557538	50 %	0 %	50 %	0 %	451817353
345	NC_020291	AAAATA	2	12	574481	574492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451817363
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350	NC_020291	TGATTT	2	12	589527	589538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451817377
351	NC_020291	CAGCTG	2	12	593152	593163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451817380
352	NC_020291	CAGAAA	2	12	595010	595021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817382
353	NC_020291	AAATTA	2	12	597730	597741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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355	NC_020291	TATATG	2	12	598867	598878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817384
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459	NC_020291	TTTAAA	2	12	791905	791916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_020291	AATTAA	2	12	791935	791946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_020291	TAAAAA	2	12	821871	821882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020291	AATTAG	2	12	874809	874820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817636

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