MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 5220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	ATTAT	2	10	836	845	40 %	60 %	0 %	0 %	451816899
2	NC_020291	AAAAT	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	451816899
3	NC_020291	TAGAT	2	10	3363	3372	40 %	40 %	20 %	0 %	451816902
4	NC_020291	ATATT	2	10	3617	3626	40 %	60 %	0 %	0 %	451816902
5	NC_020291	AGATA	2	10	3723	3732	60 %	20 %	20 %	0 %	451816902
6	NC_020291	ATACA	2	10	4318	4327	60 %	20 %	0 %	20 %	451816903
7	NC_020291	CAATT	2	10	4746	4755	40 %	40 %	0 %	20 %	451816904
8	NC_020291	CAATT	2	10	6275	6284	40 %	40 %	0 %	20 %	451816904
9	NC_020291	ATTAT	2	10	14676	14685	40 %	60 %	0 %	0 %	451816906
10	NC_020291	TTAAA	2	10	14940	14949	60 %	40 %	0 %	0 %	451816906
11	NC_020291	TTAAT	2	10	15668	15677	40 %	60 %	0 %	0 %	451816907
12	NC_020291	AAAAT	2	10	18794	18803	80 %	20 %	0 %	0 %	451816911
13	NC_020291	TATAA	2	10	19048	19057	60 %	40 %	0 %	0 %	451816911
14	NC_020291	GATAG	2	10	21439	21448	40 %	20 %	40 %	0 %	451816911
15	NC_020291	TATAT	2	10	21624	21633	40 %	60 %	0 %	0 %	451816911
16	NC_020291	AAGAA	2	10	25391	25400	80 %	0 %	20 %	0 %	451816912
17	NC_020291	GATAT	2	10	25759	25768	40 %	40 %	20 %	0 %	451816912
18	NC_020291	TACTT	2	10	26040	26049	20 %	60 %	0 %	20 %	451816913
19	NC_020291	TTTAT	2	10	26833	26842	20 %	80 %	0 %	0 %	451816913
20	NC_020291	ATTTT	2	10	28142	28151	20 %	80 %	0 %	0 %	451816915
21	NC_020291	AATTT	2	10	28510	28519	40 %	60 %	0 %	0 %	451816915
22	NC_020291	AAAAG	2	10	31112	31121	80 %	0 %	20 %	0 %	451816916
23	NC_020291	GAAAA	2	10	32586	32595	80 %	0 %	20 %	0 %	451816919
24	NC_020291	AACTT	2	10	33565	33574	40 %	40 %	0 %	20 %	451816921
25	NC_020291	ATTAT	2	10	34293	34302	40 %	60 %	0 %	0 %	451816922
26	NC_020291	TTTTG	2	10	35686	35695	0 %	80 %	20 %	0 %	451816923
27	NC_020291	AGTTC	2	10	36012	36021	20 %	40 %	20 %	20 %	451816923
28	NC_020291	AATAG	2	10	38219	38228	60 %	20 %	20 %	0 %	451816926
29	NC_020291	ATGGT	2	10	41898	41907	20 %	40 %	40 %	0 %	451816929
30	NC_020291	ATGTA	2	10	43774	43783	40 %	40 %	20 %	0 %	451816930
31	NC_020291	TAGAA	2	10	44263	44272	60 %	20 %	20 %	0 %	451816930
32	NC_020291	AAAAG	2	10	44812	44821	80 %	0 %	20 %	0 %	451816930
33	NC_020291	ATTCA	2	10	45398	45407	40 %	40 %	0 %	20 %	451816930
34	NC_020291	GTAAG	2	10	45477	45486	40 %	20 %	40 %	0 %	451816930
35	NC_020291	TTAAA	2	10	46512	46521	60 %	40 %	0 %	0 %	451816931
36	NC_020291	ATTAA	2	10	46903	46912	60 %	40 %	0 %	0 %	451816932
37	NC_020291	AGTGG	2	10	49378	49387	20 %	20 %	60 %	0 %	451816934
38	NC_020291	AAAGT	2	10	50139	50148	60 %	20 %	20 %	0 %	451816935
39	NC_020291	TAGAA	2	10	51402	51411	60 %	20 %	20 %	0 %	451816937
40	NC_020291	AATAT	2	10	52730	52739	60 %	40 %	0 %	0 %	451816937
41	NC_020291	AATAG	2	10	53845	53854	60 %	20 %	20 %	0 %	451816937
42	NC_020291	TAAAT	2	10	54243	54252	60 %	40 %	0 %	0 %	451816938
43	NC_020291	AATTG	2	10	55185	55194	40 %	40 %	20 %	0 %	451816938
44	NC_020291	TAAAA	3	15	55501	55515	80 %	20 %	0 %	0 %	451816939
45	NC_020291	TAATA	2	10	58181	58190	60 %	40 %	0 %	0 %	451816941
46	NC_020291	TTTAA	2	10	58925	58934	40 %	60 %	0 %	0 %	451816942
47	NC_020291	AATTA	2	10	60430	60439	60 %	40 %	0 %	0 %	451816943
48	NC_020291	AGATA	2	10	64442	64451	60 %	20 %	20 %	0 %	451816945
49	NC_020291	TATAA	2	10	65187	65196	60 %	40 %	0 %	0 %	451816946
50	NC_020291	CTCTT	2	10	67103	67112	0 %	60 %	0 %	40 %	451816947
51	NC_020291	AAATT	2	10	67421	67430	60 %	40 %	0 %	0 %	451816947
52	NC_020291	GTCTT	2	10	67774	67783	0 %	60 %	20 %	20 %	451816948
53	NC_020291	TGGTG	2	10	68538	68547	0 %	40 %	60 %	0 %	451816950
54	NC_020291	GATTG	2	10	69222	69231	20 %	40 %	40 %	0 %	451816951
55	NC_020291	ATGGA	2	10	69842	69851	40 %	20 %	40 %	0 %	451816952
56	NC_020291	GCATA	2	10	70604	70613	40 %	20 %	20 %	20 %	451816952
57	NC_020291	AAAAC	2	10	71361	71370	80 %	0 %	0 %	20 %	451816953
58	NC_020291	TTATA	2	10	71541	71550	40 %	60 %	0 %	0 %	451816953
59	NC_020291	ATATT	2	10	73377	73386	40 %	60 %	0 %	0 %	451816954
60	NC_020291	GATTA	2	10	76044	76053	40 %	40 %	20 %	0 %	451816955
61	NC_020291	ATTAA	2	10	77071	77080	60 %	40 %	0 %	0 %	451816956
62	NC_020291	AAATA	2	10	77540	77549	80 %	20 %	0 %	0 %	451816956
63	NC_020291	AGAAA	2	10	80464	80473	80 %	0 %	20 %	0 %	451816959
64	NC_020291	ATTTA	2	10	80881	80890	40 %	60 %	0 %	0 %	451816959
65	NC_020291	TTAGT	2	10	83461	83470	20 %	60 %	20 %	0 %	451816962
66	NC_020291	AATTA	2	10	84624	84633	60 %	40 %	0 %	0 %	451816964
67	NC_020291	TGAAA	2	10	85086	85095	60 %	20 %	20 %	0 %	451816965
68	NC_020291	TGAAT	2	10	85430	85439	40 %	40 %	20 %	0 %	451816965
69	NC_020291	GGAAT	2	10	85868	85877	40 %	20 %	40 %	0 %	451816966
70	NC_020291	AAGAA	2	10	87060	87069	80 %	0 %	20 %	0 %	451816967
71	NC_020291	TAAAT	2	10	87945	87954	60 %	40 %	0 %	0 %	451816967
72	NC_020291	ACCAT	2	10	88125	88134	40 %	20 %	0 %	40 %	451816967
73	NC_020291	GAAGA	2	10	91112	91121	60 %	0 %	40 %	0 %	451816969
74	NC_020291	GAAAA	2	10	93555	93564	80 %	0 %	20 %	0 %	451816970
75	NC_020291	ATGGA	2	10	94879	94888	40 %	20 %	40 %	0 %	451816972
76	NC_020291	ATAAA	2	10	96935	96944	80 %	20 %	0 %	0 %	451816974
77	NC_020291	ATTAA	2	10	98036	98045	60 %	40 %	0 %	0 %	451816976
78	NC_020291	GGAAA	2	10	101433	101442	60 %	0 %	40 %	0 %	451816979
79	NC_020291	TTGAT	2	10	102178	102187	20 %	60 %	20 %	0 %	451816981
80	NC_020291	TATGG	2	10	102591	102600	20 %	40 %	40 %	0 %	451816982
81	NC_020291	ATTAC	2	10	104659	104668	40 %	40 %	0 %	20 %	451816984
82	NC_020291	ATGAT	2	10	106487	106496	40 %	40 %	20 %	0 %	451816986
83	NC_020291	TCTTT	2	10	108208	108217	0 %	80 %	0 %	20 %	451816987
84	NC_020291	TATTG	2	10	110122	110131	20 %	60 %	20 %	0 %	451816989
85	NC_020291	AATGA	2	10	110791	110800	60 %	20 %	20 %	0 %	451816989
86	NC_020291	AATAT	2	10	111433	111442	60 %	40 %	0 %	0 %	451816990
87	NC_020291	AATGA	2	10	113233	113242	60 %	20 %	20 %	0 %	451816992
88	NC_020291	ATGAT	2	10	114828	114837	40 %	40 %	20 %	0 %	451816993
89	NC_020291	GGATA	2	10	114943	114952	40 %	20 %	40 %	0 %	451816993
90	NC_020291	AAAAG	2	10	116960	116969	80 %	0 %	20 %	0 %	451816995
91	NC_020291	GAAGT	2	10	117757	117766	40 %	20 %	40 %	0 %	451816996
92	NC_020291	GATTT	2	10	118193	118202	20 %	60 %	20 %	0 %	451816997
93	NC_020291	AATTA	2	10	119890	119899	60 %	40 %	0 %	0 %	451816997
94	NC_020291	AAAGT	2	10	120561	120570	60 %	20 %	20 %	0 %	451816997
95	NC_020291	AGCCA	2	10	121244	121253	40 %	0 %	20 %	40 %	451816997
96	NC_020291	TAAAA	2	10	121411	121420	80 %	20 %	0 %	0 %	451816997
97	NC_020291	AAACT	2	10	123454	123463	60 %	20 %	0 %	20 %	451816999
98	NC_020291	GCCAA	2	10	123922	123931	40 %	0 %	20 %	40 %	451817000
99	NC_020291	GAATA	2	10	124139	124148	60 %	20 %	20 %	0 %	451817000
100	NC_020291	TATAT	2	10	125071	125080	40 %	60 %	0 %	0 %	451817000
101	NC_020291	ATTTA	2	10	125451	125460	40 %	60 %	0 %	0 %	451817001
102	NC_020291	AAGTT	2	10	125660	125669	40 %	40 %	20 %	0 %	451817001
103	NC_020291	GATTT	2	10	126299	126308	20 %	60 %	20 %	0 %	451817001
104	NC_020291	TTTTC	2	10	128041	128050	0 %	80 %	0 %	20 %	451817005
105	NC_020291	AAATA	2	10	133685	133694	80 %	20 %	0 %	0 %	451817009
106	NC_020291	AAAGT	2	10	134062	134071	60 %	20 %	20 %	0 %	451817009
107	NC_020291	TCAAA	2	10	134208	134217	60 %	20 %	0 %	20 %	451817009
108	NC_020291	TCTGT	2	10	134674	134683	0 %	60 %	20 %	20 %	451817010
109	NC_020291	TATCT	2	10	134828	134837	20 %	60 %	0 %	20 %	451817010
110	NC_020291	TGTTA	2	10	135163	135172	20 %	60 %	20 %	0 %	451817011
111	NC_020291	GAAGA	2	10	136119	136128	60 %	0 %	40 %	0 %	451817011
112	NC_020291	AAAAT	2	10	138521	138530	80 %	20 %	0 %	0 %	451817012
113	NC_020291	GTATA	2	10	139155	139164	40 %	40 %	20 %	0 %	451817013
114	NC_020291	TAGAG	2	10	139548	139557	40 %	20 %	40 %	0 %	451817013
115	NC_020291	ATTAT	2	10	139994	140003	40 %	60 %	0 %	0 %	451817014
116	NC_020291	AGAAA	2	10	141249	141258	80 %	0 %	20 %	0 %	451817015
117	NC_020291	GAGAA	2	10	141959	141968	60 %	0 %	40 %	0 %	451817016
118	NC_020291	ATGAT	2	10	142505	142514	40 %	40 %	20 %	0 %	451817016
119	NC_020291	TTAGA	2	10	147877	147886	40 %	40 %	20 %	0 %	451817020
120	NC_020291	TAATT	2	10	154937	154946	40 %	60 %	0 %	0 %	451817021
121	NC_020291	ATTGG	2	10	156546	156555	20 %	40 %	40 %	0 %	451817023
122	NC_020291	ATAAA	2	10	157975	157984	80 %	20 %	0 %	0 %	451817025
123	NC_020291	TATTT	2	10	158470	158479	20 %	80 %	0 %	0 %	451817026
124	NC_020291	TAGAA	2	10	158543	158552	60 %	20 %	20 %	0 %	451817026
125	NC_020291	AGAAC	2	10	158675	158684	60 %	0 %	20 %	20 %	451817026
126	NC_020291	ATAAA	2	10	159709	159718	80 %	20 %	0 %	0 %	451817029
127	NC_020291	ATGAA	2	10	159998	160007	60 %	20 %	20 %	0 %	451817029
128	NC_020291	AAAAT	2	10	160824	160833	80 %	20 %	0 %	0 %	451817030
129	NC_020291	GAATG	2	10	161458	161467	40 %	20 %	40 %	0 %	451817031
130	NC_020291	AAAGG	2	10	164433	164442	60 %	0 %	40 %	0 %	451817033
131	NC_020291	GAATA	2	10	164621	164630	60 %	20 %	20 %	0 %	451817033
132	NC_020291	ATTGC	2	10	165416	165425	20 %	40 %	20 %	20 %	451817034
133	NC_020291	TAATA	2	10	166468	166477	60 %	40 %	0 %	0 %	451817034
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135	NC_020291	TCTTT	2	10	168150	168159	0 %	80 %	0 %	20 %	451817036
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