MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 21392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	CTAT	2	8	203	210	25 %	50 %	0 %	25 %	451816899
2	NC_020291	ATGC	2	8	590	597	25 %	25 %	25 %	25 %	451816899
3	NC_020291	GGAA	2	8	616	623	50 %	0 %	50 %	0 %	451816899
4	NC_020291	AATT	2	8	672	679	50 %	50 %	0 %	0 %	451816899
5	NC_020291	AAAT	2	8	715	722	75 %	25 %	0 %	0 %	451816899
6	NC_020291	AAAT	2	8	2076	2083	75 %	25 %	0 %	0 %	451816900
7	NC_020291	ATTG	2	8	2308	2315	25 %	50 %	25 %	0 %	451816900
8	NC_020291	ATTA	2	8	2435	2442	50 %	50 %	0 %	0 %	451816900
9	NC_020291	TATG	2	8	3132	3139	25 %	50 %	25 %	0 %	451816902
10	NC_020291	AATT	2	8	3191	3198	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
11	NC_020291	TATT	2	8	3258	3265	25 %	75 %	0 %	0 %	451816902
12	NC_020291	AATT	2	8	3674	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	451816902
13	NC_020291	ACAG	2	8	4116	4123	50 %	0 %	25 %	25 %	451816902
14	NC_020291	TAAT	2	8	4496	4503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020291	GTAT	2	8	4622	4629	25 %	50 %	25 %	0 %	451816904
16	NC_020291	TACT	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	451816904
17	NC_020291	GGAT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	50 %	0 %	451816905
18	NC_020291	ATAA	2	8	6883	6890	75 %	25 %	0 %	0 %	451816905
19	NC_020291	AAGC	2	8	7720	7727	50 %	0 %	25 %	25 %	451816905
20	NC_020291	TTTA	2	8	8298	8305	25 %	75 %	0 %	0 %	451816905
21	NC_020291	TGTA	2	8	8559	8566	25 %	50 %	25 %	0 %	451816905
22	NC_020291	TAAA	2	8	9096	9103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020291	ACAA	2	8	9317	9324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020291	AAGA	2	8	9345	9352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020291	GTGA	2	8	9839	9846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020291	TACT	2	8	11018	11025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020291	AGAA	2	8	11502	11509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020291	GCGA	2	8	11531	11538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020291	GCTA	2	8	12769	12776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020291	CTGA	2	8	14160	14167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020291	TTTA	2	8	14788	14795	25 %	75 %	0 %	0 %	451816906
32	NC_020291	TAAA	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	451816907
33	NC_020291	GAAT	2	8	15931	15938	50 %	25 %	25 %	0 %	451816908
34	NC_020291	AATA	2	8	16595	16602	75 %	25 %	0 %	0 %	451816908
35	NC_020291	AAGT	2	8	17131	17138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020291	TTGT	2	8	17305	17312	0 %	75 %	25 %	0 %	451816909
37	NC_020291	ATTG	2	8	17396	17403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020291	GCGT	2	8	17474	17481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020291	GATA	2	8	17598	17605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020291	TAAT	2	8	17621	17628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020291	ATTA	2	8	17689	17696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020291	GCGT	2	8	17796	17803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020291	TAAT	2	8	18018	18025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020291	TAAT	2	8	18298	18305	50 %	50 %	0 %	0 %	451816910
45	NC_020291	TAAT	2	8	18626	18633	50 %	50 %	0 %	0 %	451816910
46	NC_020291	ATTT	2	8	18663	18670	25 %	75 %	0 %	0 %	451816911
47	NC_020291	AATT	2	8	18752	18759	50 %	50 %	0 %	0 %	451816911
48	NC_020291	AAAT	2	8	20075	20082	75 %	25 %	0 %	0 %	451816911
49	NC_020291	CATA	2	8	20655	20662	50 %	25 %	0 %	25 %	451816911
50	NC_020291	AAAT	2	8	20727	20734	75 %	25 %	0 %	0 %	451816911
51	NC_020291	AAAT	2	8	21246	21253	75 %	25 %	0 %	0 %	451816911
52	NC_020291	GAAA	2	8	22413	22420	75 %	0 %	25 %	0 %	451816912
53	NC_020291	TAAA	2	8	22832	22839	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
54	NC_020291	AATT	2	8	23153	23160	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
55	NC_020291	TTCC	2	8	23366	23373	0 %	50 %	0 %	50 %	451816912
56	NC_020291	TGGT	2	8	23504	23511	0 %	50 %	50 %	0 %	451816912
57	NC_020291	AGGC	2	8	23539	23546	25 %	0 %	50 %	25 %	451816912
58	NC_020291	TGAT	2	8	24131	24138	25 %	50 %	25 %	0 %	451816912
59	NC_020291	TAAA	2	8	24227	24234	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
60	NC_020291	AATT	2	8	24311	24318	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
61	NC_020291	TAAA	2	8	24548	24555	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
62	NC_020291	AATT	2	8	25110	25117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
63	NC_020291	ATAA	2	8	25234	25241	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
64	NC_020291	TAAA	2	8	25460	25467	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
65	NC_020291	TAAA	2	8	25610	25617	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
66	NC_020291	ATGA	2	8	26171	26178	50 %	25 %	25 %	0 %	451816913
67	NC_020291	TAGA	2	8	26375	26382	50 %	25 %	25 %	0 %	451816913
68	NC_020291	TAAG	2	8	26975	26982	50 %	25 %	25 %	0 %	451816913
69	NC_020291	AATT	2	8	27075	27082	50 %	50 %	0 %	0 %	451816913
70	NC_020291	ATGT	2	8	27325	27332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020291	TAAT	2	8	27584	27591	50 %	50 %	0 %	0 %	451816914
72	NC_020291	ATAG	2	8	28492	28499	50 %	25 %	25 %	0 %	451816915
73	NC_020291	TTAG	2	8	28717	28724	25 %	50 %	25 %	0 %	451816915
74	NC_020291	AAAT	2	8	28839	28846	75 %	25 %	0 %	0 %	451816915
75	NC_020291	ATTT	2	8	28897	28904	25 %	75 %	0 %	0 %	451816915
76	NC_020291	GTTA	2	8	29044	29051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020291	ACGG	2	8	29072	29079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020291	AATA	2	8	29339	29346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020291	TTAC	2	8	29375	29382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020291	ATAA	2	8	29544	29551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020291	AGCA	2	8	30091	30098	50 %	0 %	25 %	25 %	451816916
82	NC_020291	TTTG	2	8	30152	30159	0 %	75 %	25 %	0 %	451816916
83	NC_020291	TATT	2	8	30266	30273	25 %	75 %	0 %	0 %	451816916
84	NC_020291	AGCG	2	8	30279	30286	25 %	0 %	50 %	25 %	451816916
85	NC_020291	TTGA	2	8	30924	30931	25 %	50 %	25 %	0 %	451816916
86	NC_020291	TTAT	2	8	30955	30962	25 %	75 %	0 %	0 %	451816916
87	NC_020291	TAAA	2	8	31396	31403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020291	ATTT	2	8	31414	31421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020291	AAAT	2	8	31764	31771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020291	AGCA	2	8	31868	31875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020291	GAAA	2	8	32075	32082	75 %	0 %	25 %	0 %	451816918
92	NC_020291	ATGT	2	8	32246	32253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020291	AGCA	2	8	32379	32386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020291	TTTA	2	8	33008	33015	25 %	75 %	0 %	0 %	451816921
95	NC_020291	TATC	2	8	33433	33440	25 %	50 %	0 %	25 %	451816921
96	NC_020291	CATA	2	8	34028	34035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020291	TAAT	2	8	34065	34072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020291	TTGA	2	8	34588	34595	25 %	50 %	25 %	0 %	451816922
99	NC_020291	AAGG	2	8	34826	34833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020291	GTTG	2	8	35061	35068	0 %	50 %	50 %	0 %	451816923
101	NC_020291	GCTT	2	8	35610	35617	0 %	50 %	25 %	25 %	451816923
102	NC_020291	TAAT	2	8	36542	36549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020291	ATTA	2	8	36581	36588	50 %	50 %	0 %	0 %	451816924
104	NC_020291	GATA	2	8	37308	37315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020291	GGGA	2	8	37373	37380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020291	ATTA	2	8	37640	37647	50 %	50 %	0 %	0 %	451816925
107	NC_020291	ATTT	2	8	37702	37709	25 %	75 %	0 %	0 %	451816925
108	NC_020291	TTGG	2	8	37804	37811	0 %	50 %	50 %	0 %	451816925
109	NC_020291	CATA	2	8	38020	38027	50 %	25 %	0 %	25 %	451816925
110	NC_020291	ATAA	2	8	38030	38037	75 %	25 %	0 %	0 %	451816925
111	NC_020291	AAAT	2	8	38159	38166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020291	AAGC	2	8	38420	38427	50 %	0 %	25 %	25 %	451816926
113	NC_020291	TTAC	2	8	38510	38517	25 %	50 %	0 %	25 %	451816926
114	NC_020291	ATGT	2	8	38553	38560	25 %	50 %	25 %	0 %	451816926
115	NC_020291	TTTA	2	8	38977	38984	25 %	75 %	0 %	0 %	451816926
116	NC_020291	AATT	2	8	39127	39134	50 %	50 %	0 %	0 %	451816927
117	NC_020291	AATA	2	8	40014	40021	75 %	25 %	0 %	0 %	451816927
118	NC_020291	AAAT	2	8	40267	40274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020291	TAAA	2	8	40422	40429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020291	TGAG	2	8	40593	40600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020291	AAAG	2	8	40727	40734	75 %	0 %	25 %	0 %	451816928
122	NC_020291	AAAT	2	8	41097	41104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020291	TTAT	2	8	41226	41233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020291	AATA	2	8	41314	41321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020291	TAAA	2	8	41563	41570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020291	AAAG	2	8	41936	41943	75 %	0 %	25 %	0 %	451816929
127	NC_020291	TAAA	2	8	42942	42949	75 %	25 %	0 %	0 %	451816930
128	NC_020291	TTTA	2	8	43125	43132	25 %	75 %	0 %	0 %	451816930
129	NC_020291	ATAC	2	8	43658	43665	50 %	25 %	0 %	25 %	451816930
130	NC_020291	AATA	2	8	43738	43745	75 %	25 %	0 %	0 %	451816930
131	NC_020291	AAAG	2	8	44195	44202	75 %	0 %	25 %	0 %	451816930
132	NC_020291	TAAA	2	8	44277	44284	75 %	25 %	0 %	0 %	451816930
133	NC_020291	AGTA	2	8	44734	44741	50 %	25 %	25 %	0 %	451816930
134	NC_020291	GCAG	2	8	45032	45039	25 %	0 %	50 %	25 %	451816930
135	NC_020291	GTAG	2	8	45680	45687	25 %	25 %	50 %	0 %	451816930
136	NC_020291	AAAC	2	8	45772	45779	75 %	0 %	0 %	25 %	451816930
137	NC_020291	ACCA	2	8	45973	45980	50 %	0 %	0 %	50 %	451816930
138	NC_020291	GAAA	2	8	46031	46038	75 %	0 %	25 %	0 %	451816930
139	NC_020291	TCTT	2	8	46200	46207	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020291	TAAT	2	8	46449	46456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020291	ATGG	2	8	46626	46633	25 %	25 %	50 %	0 %	451816931
142	NC_020291	TTTG	2	8	46926	46933	0 %	75 %	25 %	0 %	451816932
143	NC_020291	CTAG	2	8	47203	47210	25 %	25 %	25 %	25 %	451816932
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145	NC_020291	TTCT	2	8	47708	47715	0 %	75 %	0 %	25 %	451816932
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