MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 105157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	AAT	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020291	ATA	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020291	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020291	TTC	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
5	NC_020291	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
6	NC_020291	ATT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
7	NC_020291	ATG	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
8	NC_020291	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816899
9	NC_020291	ATT	2	6	547	552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
10	NC_020291	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
11	NC_020291	GTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816899
12	NC_020291	TCT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
13	NC_020291	GAT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
14	NC_020291	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
15	NC_020291	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
16	NC_020291	ATG	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
17	NC_020291	TAA	2	6	826	831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
18	NC_020291	ACC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816899
19	NC_020291	AGA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
20	NC_020291	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
21	NC_020291	AAT	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
22	NC_020291	TTC	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
23	NC_020291	ATA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
24	NC_020291	GTA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
25	NC_020291	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
26	NC_020291	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
27	NC_020291	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
28	NC_020291	TGG	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
29	NC_020291	GAT	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
30	NC_020291	ACA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816899
31	NC_020291	ATA	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020291	AAT	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020291	TTG	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020291	CAA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020291	CTA	3	9	1633	1641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020291	TTA	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020291	TTA	2	6	1674	1679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020291	TAA	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020291	AGG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020291	TAG	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
41	NC_020291	AGA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
42	NC_020291	ATA	2	6	1946	1951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
43	NC_020291	ATT	2	6	1985	1990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
44	NC_020291	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
45	NC_020291	TAG	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
46	NC_020291	GTT	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
47	NC_020291	AGA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
48	NC_020291	TGA	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
49	NC_020291	AAT	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
50	NC_020291	ATA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
51	NC_020291	TTA	2	6	2450	2455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
52	NC_020291	ATT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
53	NC_020291	TAA	2	6	2553	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
54	NC_020291	TAA	3	9	2583	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
55	NC_020291	GAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
56	NC_020291	GTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
57	NC_020291	GAA	3	9	2759	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
58	NC_020291	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
59	NC_020291	AGG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816900
60	NC_020291	ATT	3	9	2829	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020291	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816901
62	NC_020291	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816901
63	NC_020291	TGA	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816901
64	NC_020291	GAT	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020291	ATA	2	6	3076	3081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020291	ATT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020291	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
68	NC_020291	ATA	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
69	NC_020291	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
70	NC_020291	AGA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
71	NC_020291	TAA	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
72	NC_020291	CTA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816902
73	NC_020291	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
74	NC_020291	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
75	NC_020291	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
76	NC_020291	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
77	NC_020291	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
78	NC_020291	CAA	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816902
79	NC_020291	ATA	2	6	4009	4014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
80	NC_020291	TTA	3	9	4042	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
81	NC_020291	GAT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
82	NC_020291	ATT	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
83	NC_020291	AGG	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020291	TGT	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816903
85	NC_020291	AGA	3	9	4343	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816903
86	NC_020291	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816903
87	NC_020291	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816903
88	NC_020291	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816903
89	NC_020291	TCA	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816903
90	NC_020291	ACA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816903
91	NC_020291	AAT	3	9	4501	4509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020291	TTA	2	6	4518	4523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020291	AGG	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020291	ATA	3	9	4553	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
95	NC_020291	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
96	NC_020291	TCA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816904
97	NC_020291	ATA	2	6	4682	4687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
98	NC_020291	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
99	NC_020291	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
100	NC_020291	GGT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
101	NC_020291	GGA	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816904
102	NC_020291	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
103	NC_020291	CAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
104	NC_020291	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
105	NC_020291	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
106	NC_020291	ATG	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
107	NC_020291	GGT	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
108	NC_020291	AAG	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
109	NC_020291	TGA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
110	NC_020291	CAG	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
111	NC_020291	GAA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
112	NC_020291	CTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816904
113	NC_020291	GAT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
114	NC_020291	GCA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
115	NC_020291	TTC	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816904
116	NC_020291	ATA	2	6	6019	6024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
117	NC_020291	TTA	2	6	6067	6072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
118	NC_020291	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
119	NC_020291	ATT	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
120	NC_020291	TAT	2	6	6169	6174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
121	NC_020291	AAG	2	6	6209	6214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
122	NC_020291	ACA	2	6	6292	6297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
123	NC_020291	AGA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
124	NC_020291	GCA	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
125	NC_020291	ACA	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
126	NC_020291	TGT	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816904
127	NC_020291	TAA	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816905
128	NC_020291	TAG	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
129	NC_020291	AGA	2	6	6607	6612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
130	NC_020291	ATC	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816905
131	NC_020291	ATG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
132	NC_020291	TAG	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
133	NC_020291	TGC	3	9	6819	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816905
134	NC_020291	GAA	2	6	6925	6930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
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