MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 16898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	AAT	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020291	ATA	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020291	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020291	ATA	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020291	AAT	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020291	TTG	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020291	CAA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020291	CTA	3	9	1633	1641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020291	TTA	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020291	TTA	2	6	1674	1679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020291	TAA	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020291	AGG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020291	ATT	3	9	2829	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020291	GAT	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020291	ATA	2	6	3076	3081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020291	ATT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020291	AGG	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020291	AAT	3	9	4501	4509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020291	TTA	2	6	4518	4523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020291	AGG	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020291	TGT	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020291	GGC	2	6	9476	9481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020291	GCG	2	6	9532	9537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020291	GCA	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020291	CGA	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020291	GCA	2	6	9786	9791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020291	GCA	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020291	CGC	2	6	9833	9838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020291	GAG	2	6	9901	9906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020291	CAG	2	6	9929	9934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020291	TGC	2	6	10039	10044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020291	GAA	2	6	10121	10126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020291	GCC	2	6	10265	10270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020291	AGC	2	6	10348	10353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020291	GAA	2	6	10383	10388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020291	GGA	2	6	10428	10433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020291	GGT	2	6	10456	10461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020291	GTC	2	6	10470	10475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020291	GGA	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020291	ATC	2	6	10606	10611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020291	CCT	2	6	10944	10949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020291	ATG	2	6	10974	10979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020291	CCA	2	6	11159	11164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020291	ATT	2	6	11191	11196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020291	ACA	2	6	11237	11242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020291	TAA	2	6	11275	11280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020291	GGA	2	6	11494	11499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020291	TAG	2	6	11523	11528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020291	ATT	2	6	11599	11604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020291	ACC	2	6	11729	11734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_020291	TAC	2	6	11748	11753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020291	TGA	2	6	11755	11760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020291	GAT	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020291	GGA	2	6	12044	12049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020291	AGT	2	6	12171	12176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020291	AGC	2	6	12390	12395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020291	ACC	2	6	12469	12474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020291	CGT	2	6	12515	12520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020291	TAG	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020291	TCT	2	6	12646	12651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020291	TAT	2	6	12725	12730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020291	CAA	2	6	12826	12831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020291	AGT	2	6	12911	12916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020291	GAG	2	6	12946	12951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020291	GAA	2	6	12970	12975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020291	AGC	2	6	13157	13162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020291	CGG	2	6	13195	13200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020291	GTT	2	6	13455	13460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020291	ACC	2	6	13466	13471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020291	CCT	2	6	13554	13559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020291	GGT	2	6	13690	13695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020291	TCG	2	6	13805	13810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020291	CGT	2	6	13885	13890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020291	GAG	2	6	13934	13939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020291	GTT	2	6	13988	13993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020291	TAA	2	6	14279	14284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020291	TGA	2	6	14310	14315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020291	TAA	2	6	14426	14431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020291	CCA	2	6	14505	14510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020291	CCA	2	6	14582	14587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020291	AGG	2	6	15197	15202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020291	ATT	2	6	17367	17372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020291	GTT	2	6	17378	17383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020291	TTA	2	6	17543	17548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020291	GTA	2	6	17676	17681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020291	TAA	2	6	17697	17702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020291	TTG	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020291	ATA	2	6	17731	17736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020291	GGA	2	6	17866	17871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020291	TCC	2	6	17947	17952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_020291	ATT	3	9	18053	18061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020291	TAT	2	6	18086	18091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020291	GAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020291	AAG	2	6	18125	18130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020291	ATA	2	6	22136	22141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020291	TAT	2	6	22164	22169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020291	ATT	2	6	22177	22182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020291	TTA	2	6	25965	25970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020291	ATT	2	6	26004	26009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020291	TTA	2	6	26021	26026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020291	CCT	2	6	27211	27216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020291	ATA	2	6	27294	27299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020291	GGA	2	6	27375	27380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020291	TAT	3	9	27875	27883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020291	GTT	2	6	27926	27931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020291	AAT	2	6	28916	28921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020291	ATG	2	6	28934	28939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020291	TAT	2	6	28976	28981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020291	ATT	2	6	28989	28994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020291	ATA	2	6	29008	29013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020291	TGT	2	6	29020	29025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020291	TAA	2	6	29033	29038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020291	GTA	2	6	29249	29254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020291	AAT	2	6	29351	29356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020291	GTT	2	6	29396	29401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020291	TAA	2	6	29415	29420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020291	ATA	2	6	29493	29498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020291	ATT	2	6	29629	29634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020291	ATT	2	6	29790	29795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020291	TAT	2	6	31158	31163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020291	AGG	2	6	31210	31215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020291	TAA	3	9	31604	31612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020291	TTA	2	6	31621	31626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020291	ATA	2	6	31697	31702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020291	TTG	2	6	31811	31816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020291	AAG	2	6	31888	31893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020291	ATA	2	6	31894	31899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020291	AAG	2	6	32114	32119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020291	GTA	2	6	32133	32138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020291	AAT	2	6	32159	32164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020291	ATT	2	6	32174	32179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020291	ATA	2	6	32233	32238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020291	TTG	2	6	32322	32327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020291	ATA	2	6	32405	32410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020291	TAT	2	6	33837	33842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020291	ATT	2	6	33857	33862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020291	TAT	3	9	34102	34110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020291	TAA	2	6	34122	34127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020291	ATT	2	6	34129	34134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020291	AAT	2	6	34147	34152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020291	GGA	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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