MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 88259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	TTC	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
2	NC_020291	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
3	NC_020291	ATT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
4	NC_020291	ATG	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
5	NC_020291	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816899
6	NC_020291	ATT	2	6	547	552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816899
7	NC_020291	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
8	NC_020291	GTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816899
9	NC_020291	TCT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
10	NC_020291	GAT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
11	NC_020291	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
12	NC_020291	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
13	NC_020291	ATG	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
14	NC_020291	TAA	2	6	826	831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
15	NC_020291	ACC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816899
16	NC_020291	AGA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
17	NC_020291	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
18	NC_020291	AAT	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
19	NC_020291	TTC	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816899
20	NC_020291	ATA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816899
21	NC_020291	GTA	2	6	1193	1198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
22	NC_020291	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
23	NC_020291	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
24	NC_020291	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816899
25	NC_020291	TGG	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816899
26	NC_020291	GAT	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816899
27	NC_020291	ACA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816899
28	NC_020291	TAG	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
29	NC_020291	AGA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
30	NC_020291	ATA	2	6	1946	1951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
31	NC_020291	ATT	2	6	1985	1990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
32	NC_020291	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
33	NC_020291	TAG	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
34	NC_020291	GTT	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
35	NC_020291	AGA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
36	NC_020291	TGA	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816900
37	NC_020291	AAT	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
38	NC_020291	ATA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
39	NC_020291	TTA	2	6	2450	2455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
40	NC_020291	ATT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816900
41	NC_020291	TAA	2	6	2553	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
42	NC_020291	TAA	3	9	2583	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
43	NC_020291	GAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
44	NC_020291	GTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816900
45	NC_020291	GAA	3	9	2759	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816900
46	NC_020291	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816900
47	NC_020291	AGG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816900
48	NC_020291	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816901
49	NC_020291	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816901
50	NC_020291	TGA	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816901
51	NC_020291	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
52	NC_020291	ATA	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
53	NC_020291	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
54	NC_020291	AGA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
55	NC_020291	TAA	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
56	NC_020291	CTA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816902
57	NC_020291	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816902
58	NC_020291	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
59	NC_020291	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
60	NC_020291	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
61	NC_020291	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
62	NC_020291	CAA	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816902
63	NC_020291	ATA	2	6	4009	4014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816902
64	NC_020291	TTA	3	9	4042	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
65	NC_020291	GAT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816902
66	NC_020291	ATT	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816902
67	NC_020291	TGT	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816903
68	NC_020291	AGA	3	9	4343	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816903
69	NC_020291	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816903
70	NC_020291	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816903
71	NC_020291	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816903
72	NC_020291	TCA	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816903
73	NC_020291	ACA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816903
74	NC_020291	ATA	3	9	4553	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
75	NC_020291	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
76	NC_020291	TCA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816904
77	NC_020291	ATA	2	6	4682	4687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
78	NC_020291	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
79	NC_020291	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
80	NC_020291	GGT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
81	NC_020291	GGA	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816904
82	NC_020291	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
83	NC_020291	CAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
84	NC_020291	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
85	NC_020291	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
86	NC_020291	ATG	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
87	NC_020291	GGT	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816904
88	NC_020291	AAG	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
89	NC_020291	TGA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
90	NC_020291	CAG	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
91	NC_020291	GAA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
92	NC_020291	CTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816904
93	NC_020291	GAT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
94	NC_020291	GCA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
95	NC_020291	TTC	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816904
96	NC_020291	ATA	2	6	6019	6024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816904
97	NC_020291	TTA	2	6	6067	6072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
98	NC_020291	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816904
99	NC_020291	ATT	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
100	NC_020291	TAT	2	6	6169	6174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816904
101	NC_020291	AAG	2	6	6209	6214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
102	NC_020291	ACA	2	6	6292	6297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
103	NC_020291	AGA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816904
104	NC_020291	GCA	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816904
105	NC_020291	ACA	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816904
106	NC_020291	TGT	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816904
107	NC_020291	TAA	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816905
108	NC_020291	TAG	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
109	NC_020291	AGA	2	6	6607	6612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
110	NC_020291	ATC	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816905
111	NC_020291	ATG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
112	NC_020291	TAG	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
113	NC_020291	TGC	3	9	6819	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816905
114	NC_020291	GAA	2	6	6925	6930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
115	NC_020291	AGT	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816905
116	NC_020291	TCA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816905
117	NC_020291	CAA	2	6	7007	7012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816905
118	NC_020291	ATA	2	6	7039	7044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816905
119	NC_020291	TAT	2	6	7137	7142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816905
120	NC_020291	GCT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816905
121	NC_020291	GTT	2	6	7192	7197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816905
122	NC_020291	AAG	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
123	NC_020291	AAG	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
124	NC_020291	AAG	2	6	7554	7559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
125	NC_020291	AAG	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
126	NC_020291	GAA	2	6	7846	7851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
127	NC_020291	ATT	2	6	7854	7859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816905
128	NC_020291	TTA	2	6	7865	7870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816905
129	NC_020291	AGA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
130	NC_020291	AGA	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
131	NC_020291	AAG	3	9	7967	7975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816905
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