MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020288	TGCAC	2	10	1346	1355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020288	CAACT	2	10	2436	2445	40 %	20 %	0 %	40 %	451816491
3	NC_020288	TCCTA	2	10	8703	8712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020288	AGAAC	2	10	11893	11902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020288	GACCC	2	10	12487	12496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_020288	GATTC	2	10	14877	14886	20 %	40 %	20 %	20 %	451816508
7	NC_020288	AAAAC	2	10	15619	15628	80 %	0 %	0 %	20 %	451816509
8	NC_020288	AATCC	2	10	15641	15650	40 %	20 %	0 %	40 %	451816509
9	NC_020288	CTTGC	2	10	16288	16297	0 %	40 %	20 %	40 %	451816509
10	NC_020288	CTTCA	2	10	16874	16883	20 %	40 %	0 %	40 %	451816509
11	NC_020288	GGGCA	2	10	18242	18251	20 %	0 %	60 %	20 %	451816510
12	NC_020288	CACTC	2	10	18537	18546	20 %	20 %	0 %	60 %	451816511
13	NC_020288	ACTGG	2	10	19065	19074	20 %	20 %	40 %	20 %	451816511
14	NC_020288	AACAA	2	10	23462	23471	80 %	0 %	0 %	20 %	451816517
15	NC_020288	GTCCT	2	10	24416	24425	0 %	40 %	20 %	40 %	451816519
16	NC_020288	TGGTC	2	10	25148	25157	0 %	40 %	40 %	20 %	451816520
17	NC_020288	CCAGT	2	10	29732	29741	20 %	20 %	20 %	40 %	451816524
18	NC_020288	AGACC	2	10	30941	30950	40 %	0 %	20 %	40 %	451816526
19	NC_020288	CGCTG	2	10	34028	34037	0 %	20 %	40 %	40 %	451816528
20	NC_020288	TCCCC	2	10	34262	34271	0 %	20 %	0 %	80 %	451816528
21	NC_020288	GGAGT	2	10	38017	38026	20 %	20 %	60 %	0 %	451816530
22	NC_020288	TAGTC	2	10	38318	38327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020288	CCAAG	2	10	40450	40459	40 %	0 %	20 %	40 %	451816534
24	NC_020288	ACAAA	2	10	40687	40696	80 %	0 %	0 %	20 %	451816534
25	NC_020288	GTCCT	2	10	43074	43083	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.